BMKCloud Log in
条形банер-03

Продукти

секвенування circRNA-Illumina

Секвенування кільцевої РНК (circRNA-seq) призначене для профілювання та аналізу кільцевих РНК, класу молекул РНК, які утворюють замкнуті цикли через неканонічні події сплайсингу, забезпечуючи цим РНК підвищену стабільність.У той час як було показано, що деякі circRNA діють як губки мікроРНК, секвеструючи мікроРНК і перешкоджаючи їм регулювати свої цільові мРНК, інші circRNA можуть взаємодіяти з білками, модулювати експресію генів або грати роль у клітинних процесах.Аналіз експресії circRNA дає уявлення про регуляторні ролі цих молекул та їхнє значення в різних клітинних процесах, стадіях розвитку та захворюваннях, сприяючи глибшому розумінню складності регуляції РНК у контексті експресії генів.


Деталі послуги

Біоінформатика

Демонстраційні результати

Вибрані публікації

особливості

● Деплеція рРНК з подальшою спрямованою підготовкою бібліотеки, що дозволяє секвенувати дані, що є специфічними для ланцюга.

● Біоінформаційний робочий процес дозволяє прогнозувати circRNA та кількісне визначення експресії

 

Переваги сервісу

Більш повні бібліотеки РНК:ми використовуємо деплецію рРНК замість лінійної деплеції РНК у нашій попередній підготовці до бібліотеки, гарантуючи, що дані секвенування включають не лише circRNA, а й мРНК та lncRNA, що дозволяє проводити спільний аналіз цих наборів даних

Додатковий аналіз мереж конкурентної ендогенної РНК (ceRNA).: глибше розуміння механізмів клітинної регуляції

Великий досвід: завдяки досвіду обробки понад 20 000 зразків у BMK, що охоплюють різні типи зразків і проекти lncRNA, наша команда вносить багатий досвід у кожен проект.

Суворий контроль якості: ми впроваджуємо основні контрольні точки на всіх етапах, від підготовки зразків і бібліотеки до секвенування та біоінформатики.Такий ретельний моніторинг забезпечує стабільно високу якість результатів.

● Післяпродажна підтримка: Наше зобов’язання поширюється на період після завершення проекту з 3-місячним періодом післяпродажного обслуговування.Протягом цього часу ми пропонуємо подальше спостереження за проектом, допомогу з усунення несправностей і сеанси запитань і відповідей, щоб відповісти на будь-які запитання, пов’язані з результатами.

Вимоги до зразків і доставка

Бібліотека

Платформа

Рекомендовані дані

Контроль якості даних

Полі А збагачений

Illumina PE150

16-20 Гб

Q30≥85%

Вимоги до зразків:

Нуклеотиди:

Конц. (нг/мкл)

Кількість (мкг)

Чистота

Цілісність

≥ 100

≥ 0,5

OD260/280=1,7-2,5

OD260/230=0,5-2,5

На гелі виявлено обмежене забруднення білком або ДНК або його відсутність.

Для рослин: RIN≥6,5;

Для тварин: RIN≥7,0;

5,0≥28S/18S≥1,0;

обмежене підвищення або відсутність базової лінії

● Рослини:

Корінь, стебло або пелюстка: 450 мг

Лист або насіння: 300 мг

Фрукти: 1,2 г

● Тварина:

Серце або кишечник: 450 мг

Внутрішні органи або мозок: 240 мг

М'язи: 600 мг

Кістки, волосся або шкіра: 1,5 г

● Членистоногі:

Комахи: 9г

Ракоподібні: 450 мг

● Цільна кров:2 трубки

● Клітини: 106 клітини

● Сироватка і плазма: 6 мл

Рекомендована доставка зразків

Контейнер: центрифужна пробірка на 2 мл (фольга не рекомендована)

Зразок маркування: Група + копія, наприклад, A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...

Відвантаження:

1. Сухий лід: Зразки потрібно упакувати в мішки та закопати в сухий лід.

2. Пробірки для стабілізації РНК: зразки РНК можна висушити в пробірці для стабілізації РНК (наприклад, RNAstable®) і відправити при кімнатній температурі.

Потік роботи служби

Зразок КЯ

Дизайн експерименту

доставка зразків

Доставка зразків

Пілотний експеримент

екстракція РНК

Підготовка бібліотеки

Будівництво бібліотеки

Підготовка бібліотеки

Секвенування

Аналіз даних

Аналіз даних

Післяпродажне обслуговування

Післяпродажне обслуговування


  • Попередній:
  • далі:

  • Біоінформатика

    wps_doc_15

    передбачення circRNA: хромосомний розподіл

     图片36

     

    Диференціально експресовані circRNAs – графік вулкана

     图片37

     

    Диференціально експресовані circRNAs – ієрархічна кластеризація

     图片38

     

    Функціональне збагачення генів хазяїна circRNA

     图片39

     

     

    Ознайомтеся з науково-дослідницькими досягненнями завдяки службам секвенування circRNA BMKGene за допомогою підібраної колекції публікацій.

     

    Wang, X. та ін.(2021) «CPSF4 регулює утворення circRNA і опосередковане мікроРНК глушіння генів у гепатоцелюлярній карциномі», Oncogene 2021 40:25, 40(25), стор. 4338–4351.doi: 10.1038/s41388-021-01867-6.

    Ся К. та ін.(2023) «X oo-чутливий транскриптом розкриває роль кільцевої РНК133 у стійкості до хвороб шляхом регулювання експресії OsARAB у рисі», Phytopathology Research, 5(1), стор. 1–14.doi: 10.1186/S42483-023-00188-8/FIGURES/6.

    Y, H. та ін.(2023) «CPSF3 модулює баланс кільцевих і лінійних транскриптів у гепатоцелюлярній карциномі».doi: 10.21203/RS.3.RS-2418311/V1.

    Zhang, Y. та ін.(2023) «Комплексна оцінка circRNA при циротичній кардіоміопатії до та після трансплантації печінки», Міжнародна імунофармакологія, 114, с.109495. doi: 10.1016/J.INTIMP.2022.109495.

    отримати цитату

    Напишіть своє повідомлення тут і надішліть його нам

    Надішліть нам своє повідомлення: