CircrNA секвенування-ілруміна
Особливості
● Виснаження рРНК з подальшим підготовкою бібліотеки спрямованості, що дозволяє специфічно до SUPTRACH DATA.
● Біоінформатичний робочий процес дозволяє прогнозувати CircrNA та кількісне визначення експресії
Переваги послуг
●Більш всеосяжні бібліотеки РНК:Ми використовуємо виснаження рРНК замість лінійного виснаження РНК у нашій перед-бібліотеці, гарантуючи, що дані послідовності включають не тільки циркРНК, але й мРНК та lnCRNA, що дозволяє спільно аналізувати ці набори даних
●Необов’язковий аналіз мереж конкурентної ендогенної РНК (CERNA): Забезпечення глибших розумінь клітинних регуляторних механізмів
●Широка експертиза: Завдяки досвіду обробки понад 20 000 зразків на BMKGENE, що охоплює різноманітні типи вибірки та проекти LNCRNA, наша команда приносить багатий досвід кожного проекту.
●Суворий контроль якості: Ми впроваджуємо основні контрольні точки на всіх етапах, від вибірки та підготовки бібліотеки до послідовності та біоінформатики. Цей ретельний моніторинг забезпечує надання постійно якісних результатів.
● Підтримка після продажу: Наше зобов’язання виходить за рамки завершення проекту з 3-місячним післяпродажним періодом. За цей час ми пропонуємо подальше спостереження за проектами, допомогу у вирішенні несправностей та сесії запитань та запитань для вирішення будь-яких запитів, пов'язаних з результатами.
Зразки вимог та доставки
| Бібліотека | Платформа | Рекомендовані дані | Дані QC |
| РРНК виснажена спрямована бібліотека | Illumina pe150 | 16-20 Гб | Q30≥85% |
Вимоги до вибірки:
Нуклеотиди:
| Конц. (Ng/мкл) | Кількість (мкг) | Чистота | Цілісність |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280 = 1,7-2,5 OD260/230 = 0,5-2,5 Обмежене або відсутність білка або забруднення ДНК, показаного на гелі. | Rin≥6,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; обмежена або відсутність базової висоти |
● Рослини:
Корінь, стебло або пелюстка: 450 мг
Лист або насіння: 300 мг
Плід: 1,2 г
● Тварина:
Серце чи кишечник: 450 мг
Вісцера або мозок: 240 мг
М'яз: 600 мг
Кістки, волосся або шкіра: 1,5 г
● членистоноги:
Комахи: 9г
Раковина: 450 мг
● Цільна кров:2 трубки
● Клітини: 106 клітини
● Сироватка та плазма: 6 мл
Рекомендована доставка зразків
Контейнер: 2 мл центрифугової трубки (олов'яна фольга не рекомендується)
Маркування зразків: група+повторення, наприклад, A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Відвантаження:
1. Сухий погляд: зразки потрібно упакувати в мішках і закопувати в сухий льоду.
2. РНАТУРАТИВНІ ТРУБИ: Зразки РНК можна сушити в трубці стабілізації РНК (наприклад, RNASTABLE®) і відправляти при кімнатній температурі.
РОБОТИ РОБОТА
Дизайн експерименту
Доставка зразків
Екстракція РНК
Будівництво бібліотеки
Послідовність
Аналіз даних
Послуги після продажу
Біоінформатика
Прогнозування циркРНК: хромосомний розподіл
Диференційно експресовані циркна - вулкан
Диференційно експресовані циркРНК - ієрархічна кластеризація
Функціональне збагачення генів господаря CircrNA
Дослідіть дослідницькі просування, спричинені службами послідовності CIRCRNA BMKGENE через кураторську колекцію публікацій.
Ван, X. та ін. (2021) 'CPSF4 регулює утворення CIRCRNA та замовчування генів, опосередкованих мікроРНК при гепатоцелюлярній карциномі ", Онкоген 2021 40:25, 40 (25), с. 4338–4351. doi: 10.1038/S41388-021-01867-6.
Ся, К. та ін. (2023) 'x x oo-чутливий транскриптом виявляє роль кругового РНК133 у стійкості до захворювання шляхом регулювання експресії OSARAB в рисі', Фітопатологічні дослідження, 5 (1), с. 1–14. doi: 10.1186/S42483-023-00188-8/Фігури/6.
Y, H. та ін. (2023) 'CPSF3 модулює баланс кругових та лінійних стенограм при гепатоцелюлярній карциномі'. doi: 10.21203/rs.3.rs-2418311/v1.
Чжан, Ю. та ін. (2023) "Комплексна оцінка циркРН в циротичній кардіоміопатії до та після трансплантації печінки", міжнародна імунофармакологія, 114, с. 109495. Doi: 10.1016/j.intimp.2022.109495.
