Продукти

Секвенування ДНК/РНК – нанопоровий секвенатор

ONT секвенування — це технологія секвенування електричних сигналів однієї молекули в реальному часі на основі нанопор, принцип секвенування для кожної платформи однаковий.Дволанцюгова ДНК/РНК зв’яжеться з нанопористим білком, вбудованим у біоплівку, і розмотується під проводом моторного білка, під дією різниці напруг з обох боків біоплівки нитки ДНК/РНК проходять через білок каналу нанопори на певній відстані. швидкість.Через відмінності хімічних властивостей різних основ у ланцюзі ДНК/РНК, коли одна основа або молекула ДНК проходить через нанопоровий канал, це спричинить зміну різних електричних сигналів.Виявляючи та відповідаючи цим сигналам, можна обчислити відповідні базові типи та завершити виявлення послідовності в реальному часі.

Зв'яжіться з нами

Деталі послуги

Демонстраційний результат

Характеристики деталей служби

Платформа	Розмір бібліотеки	Теоретичний вихід даних (на комірку)	Однобазова точність	Додатки
Нанопора	8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, кДНК-ПЛР	70-90 Гб/стільниковий	85-92%	Виклик SV, De novo, Повнорозмірне секвенування, Iso-Seq, Генна анотація, Виявлення метилювання ДНК

Переваги сервісу

● Понад 5 років досвіду роботи на платформі секвенування PacBio із тисячами закритих проектів із різними видами.
● BMKGENE є офіційним партнером Oxford Nanopore із сертифікацією подвійної платформи РНК/ДНК.
● Існують основні моделі секвенсорів із повним обладнанням і достатньою пропускною здатністю секвенування.
● На основі платформи Nanopore більше 10 досліджень Denovo щодо тварин і рослин були опубліковані у всесвітньо відомих журналах.

Зразок вимог

Тип зразка

Сума

Концентрація (Qubit®)

Обсяг

Чистота

інші

Геномна ДНК

Залежить від вимог до даних

≥20 нг/мкл

≥15 мкл

OD260/280=1,7-2,2;

OD260/230≥1,5;

Чіткий пік при 260 нм, відсутність забруднень

Концентрацію потрібно вимірювати кубітом і кубітом/нанопорою ≤ 2

Загальна РНК

≥1,2 мкг

≥100 мкг/мкл

≥15 мкл

OD260/280=1,7-2,5;

OD260/230=0,5-2,5； відсутність забруднень

Значення RIN ≥7,5

Робочий процес служби

Пробопідготовка

Будівництво бібліотеки

Секвенування

Аналіз даних

Здача проекту

Попередній: Секвенування ДНК/РНК – секвенатор Illumina

далі: Специфічний локус ампліфікованого секвенування фрагментів (SLAF-Seq)

Оцінка якості даних зразка ДНК

Таблиця 1. Статистика чистих даних.

BMKID	rawSeqNum	rawSumBase	cleanSeqNum	cleanSumBase	cleanN50Len	cleanN90Len	cleanMeanLen	cleanMaxLen	cleanMeanQual
ДНК_BMK01	1,218,239	26.37	1,121,736	25.90	28 014	15 764	23 090	143,181	9