ØВисокий досвід: понад 200 000 зразків було оброблено в BMK, що охоплюють різні типи зразків, включаючи культуру клітин, тканини, рідини організму тощо, а також понад 7 000 проектів mRNA-Seq, закритих, що охоплюють різні області досліджень.
ØСувора система контролю якості: основні точки контролю якості на всіх етапах, включаючи підготовку зразків, підготовку бібліотеки, секвенування та біоінформатику, перебувають під ретельним моніторингом для отримання високоякісних результатів.
ØЧисленні бази даних доступні для анотації функцій і дослідження збагачення для досягнення різноманітних цілей дослідження.
ØПослуги після продажу: послуги після продажу діють протягом 3 місяців після завершення проекту, включаючи подальше виконання проекту, усунення несправностей, запитання та відповіді на результати тощо.
Бібліотека | Стратегія послідовності | Рекомендовані дані | Контроль якості |
Poly A збагачений | Illumina PE150 | 6 Гб | Q30≥85% |
нуклеотиди:
Чистота | Цілісність | Сума |
OD260/280≥1,7-2,5 OD260/230≥0,5-2,5Обмежене або відсутність забруднення білком або ДНК на гелі. | Для рослин: RIN≥6,5;Для тварин: RIN≥7;28S/18S≥1,0;обмежена або відсутність вихідної висоти | Конц.≥30 нг/мкл;Об’єм ≥ 10 мкл;Всього ≥ 1,5 мкг |
Тканина: Вага (суха):≥1 г
*Для тканини менше 5 мг ми рекомендуємо відправити миттєво заморожений (у рідкому азоті) зразок тканини.
Клітинна суспензія:Кількість клітин = 3×106- 1×107
*Ми рекомендуємо доставити заморожений лізат клітин.У випадку, якщо кількість клітини менше 5×105, рекомендується миттєве заморожування в рідкому азоті, що є кращим для мікроекстракції.
Зразки крові:Обсяг≥1 мл
Мікроорганізм:Маса ≥ 1 г
Контейнер: центрифужна пробірка об'ємом 2 мл (олов'яна фольга не рекомендується)
Маркування зразка: група+копія, наприклад, A1, A2, A3;B1, B2, B3 ... ...
Відвантаження:
Біоінформатика
еукаріот Робочий процес аналізу секвенування мРНК
Біоінформатика
ØКонтроль якості вихідних даних
ØРеферентне вирівнювання геному
ØАналіз структури транскрипту
ØКількісна оцінка виразу
ØАналіз диференціальних виразів
ØФункція анотації та збагачення
1.Крива насичення даних мРНК
2.Аналіз диференціальних виразів-Вулкан графік
3.Анотація KEGG на DEG
4.Класифікація GO за DEG