Метатранскриптоматичне секвенування
Особливості обслуговування
● Виснаження рРНК з подальшим підготовкою бібліотеки мРНК.
● Послідовність на Illumina Novaseq.
Переваги послуг
●Вивчіть зміни складних мікробних спільнот:Це відбувається на транскрипційному рівні та вивчає потенційні нові гени.
●Пояснення взаємодії мікробної спільноти з господарем або навколишнім середовищем.
●Комплексний біоінформатичний аналіз: Це дає уявлення про таксономічні та функціональні композиції спільноти, а також диференціальний аналіз експресії генів.
●Обширна анотація генів:Використання сучасних баз даних генів для інформаційної інформації про експресію генів мікробних спільнот.
●Підтримка після продажу:Наше зобов’язання виходить за рамки завершення проекту з 3-місячним післяпродажним періодом. За цей час ми пропонуємо подальше спостереження за проектами, допомогу у вирішенні несправностей та сесії запитань та запитань для вирішення будь-яких запитів, пов'язаних з результатами.
Технічні характеристики послуг
| Платформа послідовності | Стратегія послідовності | Рекомендовані дані | Контроль якості даних |
| Illumina novaseq | PE150 | 12 Гб | Q30≥85% |
Вимоги до вибірки
| Концентрація (нг/мкл) | Загальна кількість (мкг) | Об'єм (мкл) | OD260/280 | OD260/230 | Rin |
| ≥50 | ≥1,0 | ≥20 | 1,8-2,0 | 1,0-2,5 | ≥6,5 |
РОБОТИ РОБОТА
Доставка зразків
Будівництво бібліотеки
Послідовність
Аналіз даних
Послуги після продажу
Включає такий аналіз:
● Послідовність контролю якості даних
● Збірка стенограми
● Таксономічна анотація та достатність
● Функціональна анотація та достатність
● Кількісне визначення та диференціальний аналіз
Таксономічний розподіл кожного зразка:
Аналіз різноманітності бета: UPGMA
Функціональна анотація - Ідіть достаток
Диференціальна достаток таксономії - Лефсе
Дослідіть просування, спричинені послугами послідовності мета -транскриптоміки BMKGENE через кураторну колекцію публікацій.
Lu, Z. et al. (2023) "кислота толерантність до лактату-використання бактерій порядку бактероїдів сприяє профілактиці ацидозу румун у козах, адаптованих до дієти з високим вмістом концентрації",Харчування тварин, 14, с. 130–140. doi: 10.1016/j.aninu.2023.05.006.
Пісня, Z. та ін. (2017) "Розгадування функціональної мікробіоти ядра в традиційному твердотільному бродінні за допомогою високопропускних ампліконів та секвенування метатранскриптоміки",Кордони в мікробіології, 8 (липень). doi: 10.3389/fmicb.2017.01294/Повна.
Wang, W. et al. (2022) "Нові міковіруси, виявлені в опитуванні метатранскриптоміки фітопатогенного гриба Alternaria",Віруси, 14 (11), с. 2552. doi: 10.3390/v14112552/s1.
Вей, Дж. Та ін. (2022) "Паралельний метатранскриптомний аналіз виявляє деградацію вторинних метаболітів рослин жуками та їх симбіонтами кишечника",Молекулярний Екологія, 31 (15), с. 3999–4016. doi: 10.1111/mec.16557.
