мРНК-секвенування (NGS) – De novo

Секвенування мРНК дозволяє профілювати всі транскрипти мРНК у клітинах за певних умов і є широко використовуваною технологією в різних галузях досліджень. Конвеєр BMKCloud De novo мРНК-секвенування призначений для аналізу бібліотек секвенування, збагачених полі-А, коли референсний геном недоступний. Конвеєр починається з контролю якості, а потім...з самого початкуЗбірка транскриптів та вибір набору унікальних генів. Аналіз структури унікальних генів передбачає кодуючу послідовність (CDS) та прості послідовні повтори (SSR). Згодом, аналіз диференціальної експресії знаходить диференціально експресовані гени (DEG) серед протестованих умов, після чого проводиться функціональна анотація та збагачення DEG для отримання біологічної інформації.