-
Секвенування імунопреципітації хроматину (ChIP-seq)
ChIP-Seq забезпечує загальногеномне профілювання ДНК-мішеней для модифікації гістонів, факторів транскрипції та інших білків, асоційованих з ДНК.Він поєднує в собі селективність імунопреципітації хроматину (ChIP) для відновлення специфічних комплексів білок-ДНК із потужністю секвенування наступного покоління (NGS) для високопродуктивного секвенування відновленої ДНК.Крім того, оскільки комплекси білок-ДНК відновлюються з живих клітин, сайти зв’язування можна порівнювати в різних типах клітин і тканинах або за різних умов.Застосування варіюються від регуляції транскрипції до шляхів розвитку до механізмів захворювання та інше.
Платформа: платформа Illumina NovaSeq
-
Бісульфітне секвенування всього геному
Метилювання ДНК у п’ятій позиції в цитозині (5-mC) має фундаментальний вплив на експресію генів і клітинну активність.Аномальні моделі метилювання пов’язують із кількома станами та захворюваннями, такими як рак.WGBS став золотим стандартом для вивчення загальногеномного метилювання з одноосновною роздільною здатністю.
Платформа: платформа Illumina NovaSeq
-
Аналіз транспозазно-доступного хроматину з високопродуктивним секвенуванням (ATAC-seq)
ATAC-seq — це високопродуктивний метод секвенування для аналізу загальногеномної доступності хроматину, що важливо для глобального епігенетичного контролю експресії генів.Адаптери для секвенування вставляються у відкриті ділянки хроматину за допомогою гіперактивної транспозази Tn5.Після ПЛР-ампліфікації створюється бібліотека секвенування.Усі відкриті ділянки хроматину можна отримати за певних просторово-часових умов, які не обмежуються лише сайтами зв’язування фактора транскрипції або певною модифікованою ділянкою гістону.
-
Бісульфітне секвенування зі зниженим представленням (RRBS)
Дослідження метилювання ДНК завжди було гарячою темою в дослідженнях захворювань і тісно пов’язане з експресією генів і фенотиповими ознаками.RRBS — точний, ефективний і економічний метод дослідження метилювання ДНК.Збагачення ділянок промотора та CpG-острівців шляхом ферментативного розщеплення (Msp I) у поєднанні з бісульфітним секвенуванням забезпечує виявлення метилювання ДНК з високою роздільною здатністю.
Платформа: платформа Illumina NovaSeq
