مصنوعات

ڈی این اے / آر این اے کی ترتیب - نینو پور سیکوینسر

ڈی این اے/آر این اے کی ترتیب - نانوپور سیکوینسر کی نمایاں تصویر

ONT کی ترتیب ایک واحد مالیکیول ریئل ٹائم الیکٹریکل سگنل سیکوینسنگ ٹیکنالوجی ہے جس کی بنیاد نینو پورس پر ہے، ہر پلیٹ فارم کی ترتیب کا اصول ایک جیسا ہے۔دوہرے پھنسے ہوئے DNA/RNA بائیو فلم میں سرایت شدہ نینو پورس پروٹین کے ساتھ جڑے ہوں گے اور موٹر پروٹین کی قیادت کے نیچے کھولے جائیں گے، بائیو فلم کے دونوں اطراف سے وولٹیج کے فرق کی کارروائی کے تحت، ڈی این اے/آر این اے اسٹرینڈز نینو پور چینل پروٹین سے ایک خاص حد تک گزرتے ہیں۔ شرحDNA/RNA اسٹرینڈ پر مختلف اڈوں کی کیمیائی خصوصیات کے فرق کی وجہ سے، جب ایک واحد بیس یا DNA مالیکیول نینو پور چینل سے گزرتا ہے، تو یہ مختلف برقی سگنلز کی تبدیلی کا سبب بنے گا۔ان سگنلز کا پتہ لگانے اور ان کے مطابق، متعلقہ بنیادی اقسام کا حساب لگایا جا سکتا ہے، اور ترتیب کا حقیقی وقت کا پتہ لگانے کو مکمل کیا جا سکتا ہے۔

ہم سے رابطہ کریں۔

سروس کی تفصیلات

ڈیمو نتیجہ

سروس کی تفصیلات کی خصوصیات

پلیٹ فارم	لائبریری کا سائز	نظریاتی ڈیٹا کی پیداوار (فی سیل)	سنگل بیس درستگی	ایپلی کیشنز
نانوپور	8Kb، 10kb، 20kb، الٹرا لانگ، cDNA-PCR	70-90Gb/سیل	85-92%	SV کالنگ، ڈی نوو، مکمل لمبائی کی ترتیب، Iso-Seq، جین تشریح، DNA میتھیلیشن کا پتہ لگانا

سروس کے فوائد

● PacBio سیکوینسنگ پلیٹ فارم پر 5 سال سے زیادہ کا تجربہ جس میں مختلف پرجاتیوں کے ساتھ ہزاروں بند پروجیکٹس۔
● BMKGENE دوہری پلیٹ فارم RNA/DNA سرٹیفیکیشن کے ساتھ Oxford Nanopore کا ایک آفیشل پارٹنر ہے۔
● مکمل آلات اور کافی ترتیب دینے والے تھرو پٹ کے ساتھ سیکوینسر کے مین اسٹریم ماڈلز ہیں۔
● نانوپور پلیٹ فارم کی بنیاد پر، 10 سے زیادہ جانوروں اور پودوں کی ڈینووو کی تحقیق بین الاقوامی شہرت یافتہ جرائد میں شائع ہو چکی ہے۔

نمونے کے تقاضے

نمونہ کی قسم

رقم

ارتکاز (Qubit ®)

حجم

طہارت

دوسرے

جینومک ڈی این اے

ڈیٹا کی ضرورت پر منحصر ہے۔

≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.2;

OD260/230≥1.5；

260 nm پر چوٹی صاف کریں، کوئی آلودگی نہیں۔

ارتکاز کو Qubit اور Qubit/Nanopore ≤ 2 سے ناپا جانا ضروری ہے۔

کل آر این اے

≥1.2μg

≥100μg/μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.5؛

OD260/230=0.5-2.5；کوئی آلودگی نہیں۔

RIN قدر ≥7.5

سروس ورک فلو

نمونے کی تیاری

لائبریری کی تعمیر

ترتیب دینا

ڈیٹا کا تجزیہ

پروجیکٹ کی ترسیل

پچھلا: ڈی این اے / آر این اے کی ترتیب - ایلومینا سیکوینسر

اگلے: Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing (SLAF-Seq)

ڈی این اے نمونے کا ڈیٹا کوالٹی اسسمنٹ

ٹیبل 1۔ صاف ڈیٹا کے اعدادوشمار۔

BMKID	rawSeqNum	rawSumBase	cleanSeqNum	کلین سم بیس	کلین این 50 لین	کلین این 90 لین	کلین مین لین	کلین میکس لین	cleanMeanQual
DNA_BMK01	1,218,239	26.37	1,121,736	25.90	28,014	15,764	23,090	143,181	9

آر این اے نمونے کے ڈیٹا کوالٹی اسسمنٹ

ٹیبل 1۔ صاف ڈیٹا کے اعدادوشمار۔

فائل کا نام	کلائنٹ آئی ڈی	ReadNum	بیس نمبر	N50	اوسط لمبائی	زیادہ سے زیادہ طوالت	مین کیو سکور
RNA_BMK001	C2	8,947,708	4,047,230,083	398	452	129,227	Q12