میٹا ٹرانسکرپٹوم کی ترتیب
سروس کی خصوصیات
● rRNA کی کمی جس کے بعد دشاتمک mRNA لائبریری کی تیاری۔
● Illumina NovaSeq پر ترتیب۔
سروس کے فوائد
●پیچیدہ مائکروبیل کمیونٹیز کی تبدیلیوں کا مطالعہ کریں:یہ نقل کی سطح پر ہوتا ہے اور ممکنہ نئے جینوں کو دریافت کرتا ہے۔
●میزبان یا ماحولیات کے ساتھ مائکروبیل کمیونٹی کے تعاملات کی وضاحت کرنا۔
●جامع بایو انفارمیٹک تجزیہ: یہ کمیونٹی ٹیکنومک اور فنکشنل کمپوزیشنز کے ساتھ ساتھ امتیازی جین کے اظہار کے تجزیہ پر بصیرت فراہم کرتا ہے۔
●وسیع جین تشریح:مائکروبیل کمیونٹیز کی معلوماتی جین کے اظہار کی معلومات کے لیے جدید ترین جین فنکشن ڈیٹا بیس کا استعمال۔
●پوسٹ سیلز سپورٹ:ہماری وابستگی 3 ماہ کے بعد فروخت سروس کی مدت کے ساتھ پراجیکٹ کی تکمیل سے آگے ہے۔ اس وقت کے دوران، ہم نتائج سے متعلق کسی بھی سوالات کو حل کرنے کے لیے پروجیکٹ کی پیروی، ٹربل شوٹنگ میں مدد، اور سوال و جواب کے سیشن پیش کرتے ہیں۔
سروس کی وضاحتیں
| ترتیب دینے والا پلیٹ فارم | ترتیب کی حکمت عملی | ڈیٹا تجویز کیا گیا۔ | ڈیٹا کوالٹی کنٹرول |
| Illumina NovaSeq | PE150 | 12 جی بی | Q30≥85% |
نمونے کے تقاضے
| ارتکاز (ng/µL) | کل رقم (µg) | حجم (µL) | OD260/280 | OD260/230 | RIN |
| ≥50 | ≥1.0 | ≥20 | 1.8-2.0 | 1.0-2.5 | ≥6.5 |
سروس ورک فلو
نمونہ کی ترسیل
لائبریری کی تعمیر
ترتیب دینا
ڈیٹا کا تجزیہ
فروخت کے بعد کی خدمات
مندرجہ ذیل تجزیہ پر مشتمل ہے:
● ڈیٹا کوالٹی کنٹرول کو ترتیب دینا
● ٹرانسکرپٹ اسمبلی
● ٹیکسونومک تشریح اور کثرت
● فنکشنل تشریح اور کثرت
● اظہار کی مقدار اور تفریق کا تجزیہ
ہر نمونے کی درجہ بندی کی تقسیم:
بیٹا تنوع تجزیہ: UPGMA
فنکشنل تشریح - GO abundance
امتیازی درجہ بندی کی کثرت - LEFSE
BMKGene کی میٹا ٹرانسکرومکس سیکوینسنگ سروسز کے ذریعے تیار کردہ پبلیکیشنز کے مجموعے کے ذریعے پیشرفت کو دریافت کریں۔
لو، زیڈ وغیرہ۔ (2023) 'بیکٹیرائڈیلس آرڈر کے لییکٹیٹ استعمال کرنے والے بیکٹیریا کی تیزابیت برداشت بکریوں میں زیادہ مرتکز غذا کے مطابق رومینل ایسڈوسس کی روک تھام میں معاون ہے'،جانوروں کی غذائیت، 14، صفحہ 130-140۔ doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.
گانا، Z. et al. (2017) 'روایتی ٹھوس ریاست کے ابال میں بنیادی فنکشنل مائیکرو بائیوٹا کو ہائی تھرو پٹ ایمپلیکنز اور میٹا ٹرانسکرپٹومکس سیکوینسنگ کے ذریعے کھولنا'،مائکرو بایولوجی میں فرنٹیئرز، 8 (جولائی)۔ doi: 10.3389/FMICB.2017.01294/FULL۔
وانگ، ڈبلیو وغیرہ۔ (2022) 'فائیٹو پیتھوجینک الٹرنیریا فنگس کے میٹا ٹرانسکرپٹومکس سروے سے دریافت شدہ ناول مائکووائرس'،وائرسز، 14(11)، صفحہ۔ 2552. doi: 10.3390/V14112552/S1.
وی، جے وغیرہ۔ (2022) 'متوازی میٹا ٹرانسکرپٹوم تجزیہ بیٹلز اور ان کے گٹ سمبیونٹس کے ذریعہ پودوں کے ثانوی میٹابولائٹس کے انحطاط کو ظاہر کرتا ہے'،سالماتی ماحولیات، 31(15)، صفحہ 3999–4016۔ doi: 10.1111/MEC.16557۔
