BMKCloud Log in
条形بینر-03

مصنوعات

پلانٹ/جانوروں کے مکمل جینوم کی ترتیب

مکمل جینوم کی دوبارہ ترتیب، جسے WGS بھی کہا جاتا ہے، پورے جینوم پر عام اور نایاب دونوں تغیرات کو ظاہر کرنے کے قابل بناتا ہے جس میں سنگل نیوکلیوٹائڈ پولیمورفزم (SNP)، انسرشن ڈیلیٹیشن (InDel)، ساخت میں تغیر (SV)، اور کاپی نمبر ویری ایشن (CNV) شامل ہیں۔ )۔SVs SNPs کے مقابلے میں تغیر کی بنیاد کا ایک بڑا حصہ بناتے ہیں اور جینوم پر زیادہ اثر ڈالتے ہیں، جس کا جانداروں پر نمایاں اثر پڑتا ہے۔طویل پڑھنے سے ریسکیونسنگ بڑے ٹکڑوں اور پیچیدہ تغیرات کی زیادہ درست شناخت کی اجازت دیتی ہے کیونکہ طویل پڑھنا پیچیدہ خطوں جیسے کہ ٹینڈم ریپیٹس، GC/AT سے بھرپور خطوں اور ہائپر متغیر خطوں پر کروموسومل عبور کرنا بہت آسان بنا دیتا ہے۔

پلیٹ فارم: Illumina، PacBio، Nanopore


سروس کی تفصیلات

ڈیمو نتیجہ

نمایاں اشاعت

1۔سروس کے فوائد

1000 سے زیادہ پرجاتیوں کے لیے جینوم کی ترتیب میں وسیع تجربہ۔

800 سے زیادہ شائع شدہ کیسز جن میں 4000 سے زیادہ کے جمع اثر والے عنصر ہیں۔

تغیر کالنگ اور فنکشن تجزیہ پر جامع بائیو انفارمیٹکس تجزیہ۔

2. سروس کی تفصیلات

پلیٹ فارم

کتب خانہ

تجویز کردہ سیق کی گہرائی

Illumina

پیئ 150

SNP کے لیے، InDel کالنگ ≥ 10x

SV کے لیے، CNY کالنگ ≥ 30x

 

 

نانوپور

 

8 kb

SV کے لیے، CNY کالنگ ≥ 20x

Pacbio

سی سی ایس

15 kb

SNP, InDel, SV, CNY کالنگ ≥ 10x کے لیے

3. نمونہ کی ضروریات

پلیٹ فارم

Conc.(ng/μL)

 

رقم (ng)

 

طہارت

 

اگروز جیل

 

OD260/280

OD260/230

1. بغیر یا محدود کے مرکزی بینڈ کو صاف کریں۔جیل پر انحطاط کا مشاہدہ کیا گیا۔

2. کوئی یا محدود RNA یا پروٹین کی آلودگی

 

Illumina

≥1

≥30

 

-

-

نانوپور

 

≥30

ڈیٹا کی پیداوار پر منحصر ہے۔

10μg/cell

1.7-2.2

≥1.5

Pacbio

سی سی ایس

≥50

1.7-2.2

1.8-2.5

4. حیاتیاتی معلومات کا تجزیہ

wps_doc_3

5. سروس ورک فلو

نمونہ کی ترسیل

نمونہ کی ترسیل

پائلٹ تجربہ

ڈی این اے نکالنا

لائبریری کی تیاری

لائبریری کی تعمیر

ترتیب دینا

ترتیب دینا

ڈیٹا کا تجزیہ

ڈیٹا کا تجزیہ

数据上传-03

ڈیٹا کی ترسیل


  • پچھلا:
  • اگلے:

  • 1) جینوم میپنگ کے اعدادوشمار

    جدول 1 نقشہ سازی کے نتائج کے اعدادوشمار

    wps_doc_5

    شکل 1 داخل کرنے کے سائز اور پڑھنے کی کوریج کی تقسیم۔

    wps_doc_14 wps_doc_6

     

    2) متغیر کا پتہ لگانا

    شکل 2 نمونوں کے درمیان SNP/INDEL/SV کے اعداد و شمار اور تشریح

    wps_doc_7 wps_doc_8

     

    شکل 3 جینوم کی وسیع تقسیم

    wps_doc_9

    3) تغیرات کی فنکشنل تشریح

    wps_doc_10 wps_doc_11 wps_doc_12

     

    2019

    فطرت مواصلات

    مکمل جینوم ریسکیونسنگ سے پتہ چلتا ہے کہ براسیکا نیپس کی اصل اور جینیاتی لوکی اس کی بہتری میں ملوث ہے۔

    2020

    پی این اے ایس

    زرد مچھلی کی ارتقائی اصل اور پالنے کی تاریخ

    2021

    پلانٹ بائیو ٹیکنالوجی جرنل

    دو کاشت شدہ جوٹ پرجاتیوں کے حوالہ جینوم

    2021

    پلانٹ بائیو ٹیکنالوجی جرنل

    سبزیوں اور تیل کے بیجوں کے جینومک دستخط ایلوپولائپلائڈ براسیکاجونسیا اور جینیاتی لوکی جو گلوکوزینولیٹس کے جمع ہونے کو کنٹرول کرتے ہیں

    2019

    مالیکیولر پلانٹ

    ریپسیڈ ایکسیسیشن کے عالمی سطح پر مجموعہ کی مکمل جینوم ریسکینسنگ ان کے ایکوٹائپ ڈائیورجن کی جینیاتی بنیاد کو ظاہر کرتی ہے۔

    2022

    باغبانی کی تحقیق

    جینوم وسیع ایسوسی ایشن کا تجزیہ تربوز کے بیج کے سائز کے قدرتی تغیرات میں مالیکیولر بصیرت فراہم کرتا ہے۔

    2021

    جرنل آف تجرباتی نباتیات

    جینوم وائڈ ایسوسی ایشن کا مطالعہ GhSAD1 کی مختلف قسموں کی نشاندہی کرتا ہے جو کپاس میں سرد رواداری فراہم کرتا ہے

    2021

    جرنل آف تجرباتی نباتیات

    جینوم وائڈ ایسوسی ایشن اسٹڈی اور ٹرانسکرپٹوم موازنہ ناول کیو ٹی ایل اور امیدوار جینوں کو ظاہر کرتا ہے جو ریپسیڈ میں پنکھڑیوں کے سائز کو کنٹرول کرتے ہیں۔

    ایک اقتباس حاصل

    اپنا پیغام یہاں لکھیں اور ہمیں بھیجیں۔

    اپنا پیغام ہمیں بھیجیں: