مکمل ٹرانسکرپٹوم کی ترتیب - ایلومینا۔
خصوصیات
● مکمل ٹرانسکرپٹ کو ترتیب دینے کے لیے دوہری لائبریری: rRNA کی کمی جس کے بعد PE150 لائبریری کی تیاری اور سائز کا انتخاب اس کے بعد SE50 لائبریری کی تیاری
● الگ الگ بایو انفارمیٹکس رپورٹس میں mRNA، lncRNA، circRNA اور miRNA کا مکمل بایو انفارمیٹکس تجزیہ
● مشترکہ رپورٹ میں تمام RNA اظہار کا مشترکہ تجزیہ، بشمول ceRNA نیٹ ورکس کا تجزیہ۔
سروس کے فوائد
●ریگولیٹری نیٹ ورکس کا گہرائی سے تجزیہ: ceRNA نیٹ ورک تجزیہ mRNA، lncRNA، circRNA اور miRNA کی مشترکہ ترتیب اور ایک مکمل بایو انفارمیٹک ورک فلو کے ذریعے فعال کیا گیا ہے۔
●جامع تشریح: ہم ایک سے زیادہ ڈیٹا بیس کا استعمال کرتے ہیں فعال طور پر تفریق اظہار شدہ جینز (DEGs) کی تشریح کرنے اور متعلقہ افزودگی کا تجزیہ انجام دیتے ہیں، ٹرانسکرپٹوم ردعمل کے تحت سیلولر اور سالماتی عمل کے بارے میں بصیرت فراہم کرتے ہیں۔
●وسیع مہارت: مختلف تحقیقی ڈومین میں 2000 سے زیادہ مکمل ٹرانسکرپٹوم پروجیکٹس کو کامیابی کے ساتھ بند کرنے کے ٹریک ریکارڈ کے ساتھ، ہماری ٹیم ہر پروجیکٹ کے لیے کافی تجربہ لاتی ہے۔
●سخت کوالٹی کنٹرول: ہم نمونے اور لائبریری کی تیاری سے لے کر ترتیب اور بایو انفارمیٹکس تک تمام مراحل میں بنیادی کنٹرول پوائنٹس کو نافذ کرتے ہیں۔یہ محتاط نگرانی مسلسل اعلیٰ معیار کے نتائج کی فراہمی کو یقینی بناتی ہے۔
● جامع تشریح: ہم ایک سے زیادہ ڈیٹا بیس کا استعمال کرتے ہیں فعال طور پر تفریق اظہار شدہ جینز (DEGs) کی تشریح کرنے اور متعلقہ افزودگی کا تجزیہ انجام دیتے ہیں، ٹرانسکرپٹوم ردعمل کے تحت سیلولر اور سالماتی عمل کے بارے میں بصیرت فراہم کرتے ہیں۔
●پوسٹ سیلز سپورٹ: ہماری وابستگی 3 ماہ کے بعد فروخت سروس کی مدت کے ساتھ پراجیکٹ کی تکمیل سے آگے ہے۔اس وقت کے دوران، ہم نتائج سے متعلق کسی بھی سوالات کو حل کرنے کے لیے پروجیکٹ کی پیروی، ٹربل شوٹنگ میں مدد، اور سوال و جواب کے سیشن پیش کرتے ہیں۔
نمونے کی ضروریات اور ترسیل
| کتب خانہ | ترتیب کی حکمت عملی | ڈیٹا تجویز کیا گیا۔ | کوالٹی کنٹرول |
| rRNA ختم ہو گیا۔ | Illumina PE150 | 16 GB | Q30≥85% |
| سائز منتخب کیا گیا۔ | ایلومینا SE50 | 10-20M پڑھتا ہے۔ |
نمونہ کی ضروریات:
نیوکلیوٹائڈز:
| Conc.(ng/μl) | رقم (μg) | طہارت | سالمیت |
| ≥ 100 | ≥ 1 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 محدود یا کوئی پروٹین یا ڈی این اے آلودگی جیل پر دکھائی نہیں دیتی۔ | پودے: RIN≥6.5 جانور: RIN≥7.0 5.0≥28S/18S≥1.0; محدود یا کوئی بنیادی بلندی نہیں۔ |
تجویز کردہ نمونے کی ترسیل
کنٹینر:
2 ملی لیٹر سینٹرفیوج ٹیوب (ٹن ورق کی سفارش نہیں کی جاتی ہے)
نمونہ لیبلنگ: گروپ + نقل جیسے A1، A2، A3؛B1, B2, B3...
کھیپ:
1. خشک برف: نمونوں کو تھیلے میں پیک کرنے اور خشک برف میں دفن کرنے کی ضرورت ہے۔
2.RNAstable tubes: RNA کے نمونے RNA سٹیبلائزیشن ٹیوب (جیسے RNAstable®) میں خشک کیے جا سکتے ہیں اور کمرے کے درجہ حرارت پر بھیجے جا سکتے ہیں۔
سروس ورک فلو
تجربہ ڈیزائن
نمونہ کی ترسیل
آر این اے نکالنا
لائبریری کی تعمیر
ترتیب دینا
ڈیٹا کا تجزیہ
فروخت کے بعد کی خدمات
بایو انفارمیٹکس
آر این اے اظہار کا جائزہ
امتیازی طور پر اظہار شدہ جین
ceRNA تجزیہ
مختلف طور پر اظہار کردہ miRNAs اور متعلقہ RNAs
BMKGene کی مکمل ٹرانسکرپٹوم سیکوینسنگ سروسز کے ذریعے فراہم کردہ تحقیقی پیشرفت کو پبلیکیشنز کے کیوریٹڈ مجموعے کے ذریعے دریافت کریں۔
ڈائی، وائی وغیرہ۔(2022) 'کاشین-بیک بیماری میں mRNAs، lncRNAs اور miRNAs کے جامع ایکسپریشن پروفائلز جن کی شناخت RNA-sequencing سے ہوئی'، مالیکیولر اومکس، 18(2)، پی پی 154–166۔doi: 10.1039/D1MO00370D۔
لیو، این نان وغیرہ۔(2022) 'سردی کے دوران چانگ بائی ماؤنٹین میں Apis cerana کے سرد مزاحمت کا مکمل طوالت ٹرانسکرپٹومز تجزیہ'، جین، 830، صفحہ 146503–146503۔doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503۔
وانگ، ایکس جے وغیرہ۔(2022) 'چھوٹے خلیے کے پھیپھڑوں کے کینسر میں مسابقتی اینڈوجینس آر این اے ریگولیشن نیٹ ورکس کی ملٹی اومکس انٹیگریشن پر مبنی ترجیح: مالیکیولر خصوصیات اور منشیات کے امیدوار'، فرنٹیئرز ان آنکولوجی، 12، صفحہ۔904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX۔
Xu، P. et al.(2022) 'lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA ایکسپریشن پروفائلز کا انٹیگریٹڈ تجزیہ مونگ پھلی میں جڑ کی گرہ والے نیماٹوڈس کے جواب میں ممکنہ میکانزم کی نئی بصیرت کو ظاہر کرتا ہے'، BMC جینومکس، 23(1)، pp. 1-12۔doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/FIGURES/7۔
یان، زیڈ وغیرہ۔(2022) 'پوری ٹرانسکرپٹوم آر این اے کی ترتیب سرخ ایل ای ڈی شعاع ریزی کے ذریعے بروکولی میں پوسٹ ہارویسٹ کوالٹی کی دیکھ بھال سے وابستہ مالیکیولر میکانزم پر روشنی ڈالتی ہے'، پوسٹ ہارویسٹ بائیولوجی اینڈ ٹیکنالوجی، 188، صفحہ۔111878. doi: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.
