16S/18S/ITS Amplikon ketma-ketligi-NGS
Xizmat xususiyatlari
● Ketma-ketlik platformasi: Illumina NovaSeq.
● Boshqa kuchaytirish maqsadlari qatorida 16S, 18S va ITS ning qisqa mintaqalarini kuchaytirish.
● Amplikonning moslashuvchan tanlovi.
● Bir nechta kuchaytirish maqsadlari bilan oldingi loyiha tajribasi.
Xizmat ko'rsatishning afzalliklari
●Izolyatsiyasiz:Atrof-muhit namunalarida mikrobial tarkibni tezkor aniqlash.
●Yuqori aniqlikAtrof-muhit namunalarida kam miqdorda komponentlarda.
●Keng qo'llaniladiTurli xil mikrobial hamjamiyat tadqiqotlari.
●Keng qamrovli bioinformatik tahlilMa'lumotlar bazasi, annotatsiya, OTU/ASV nuqtai nazaridan turli xil tahlillarga ega eng so'nggi QIIME2 to'plami (mikrobial ekologiyaga miqdoriy tushuncha).
●Keng qamrovli ekspertizaYiliga 150 ming amplikon ketma-ketlik loyihalari amalga oshirilgan BMKGENE o'n yildan ortiq tajriba, yuqori malakali tahlil guruhi, keng qamrovli kontent va ajoyib savdo-sotiqdan keyingi qo'llab-quvvatlashni o'z ichiga oladi.
Xizmat ko'rsatish xususiyatlari
| Kutubxona | Ketma-ketlik strategiyasi | Tavsiya etilgan ma'lumotlar |
| Amplikon | Illumina PE250 | 50/100/300K teglar (o'qish juftliklari) |
Xizmat talablari
| Konsentratsiya (ng/µL) | Umumiy miqdor (ng) | Hajmi (µL) |
| ≥1 | ≥200 | ≥20 |
● Tuproq/loy: 1-2 g
● Ichak tarkibi - hayvon: 0,5-2 g
● Ichak tarkibi - hasharot: 0.1-0.25 g
● O'simlik yuzasi (boyitilgan cho'kindi): 0,1-0,5 g
● Fermentatsiya buloniga boyitilgan cho'kma): 0,1-0,5 g
● Katta hayvonlarning najasi: 0,5-2 g
● Najas (sichqoncha): 3-5 dona
● O'pka alveolyar lavaj suyuqligi: filtr qog'ozi
● Vaginal tampon: 5-6 ta tampon
● Teri/jinsiy a'zolar uchun surtma/so'lak/og'iz bo'shlig'i yumshoq to'qimasi/faringeal surtma/rektal surtma: 2-3 ta surtma
● Yuzaki mikroorganizmlar: filtr qog'ozi
● Suv havzasi/havo/bioplyonka: filtr qog'ozi
● Endofitlar: 1-2 g
● Tish plakasi: 0,5-1 g
Xizmat ko'rsatish ish oqimi
Namuna yetkazib berish
Kutubxona qurilishi
Ketma-ketlik
Ma'lumotlar tahlili
Sotishdan keyingi xizmatlar
Quyidagi tahlilni o'z ichiga oladi:
- Xom ma'lumotlar sifatini nazorat qilish
- OTU klasterlash / shovqinni kamaytirish (ASV)
- OTU annotatsiyasi
- Alfa xilma-xillik tahlili: Shannon, Simpson va ACE kabi bir nechta indekslar.
- Beta xilma-xilligi tahlili
- Guruhlararo tahlil
- Korrelyatsiya tahlili: atrof-muhit omillari va OUT tarkibi va xilma-xilligi o'rtasidagi
- 16S funktsional gen bashorati
Taksonomik taqsimotning gistogrammasi
taksonomik mo'llik klasterlash issiqlik xaritasi
Alfa xilma-xilligi tahlili: noyob fraksiya egri chizig'i
beta xilma-xillik tahlili: NMDS
Guruhlararo tahlil: LEFSE biomarkerini kashf etish
BMKGene'ning Illumina bilan birgalikda amplikon sekvenlash xizmatlari orqali erishilgan yutuqlarni nashrlarning tanlangan to'plami orqali o'rganing.
Dong, C. va boshqalar. (2022) 'Eucommia ulmoidesdagi Rizosfera tuproq va po'stloq mikrobiotasining yig'ilishi, asosiy mikrobiotasi va funktsiyasi', Mikrobiologiya chegaralari, 13. doi: 10.3389/FMICB.2022.855317/FULL.
Li, Y. va boshqalar. (2023) 'Sichqonlarda Gardnerella vaginalis keltirib chiqaradigan bakterial vaginozni davolash uchun sintetik bakterial konsortsium transplantatsiyasi', Microbiome, 11(1), 1–14-betlar. doi: 10.1186/s40168-023-01497-y
Yang, J., Fu, Y. va Liu, H. (2022) 'Yerga asoslangan yopiq bioregenerativ hayotni qo'llab-quvvatlash tajribasi “Oy saroyi 365” davomida to'plangan havo changining mikrobiomlari', Environmental Microbiomes, 17(1), 1–20-betlar. doi: 10.1186/S40793-022-00399-0/FIGURES/8.
Yin, S. va boshqalar (2022) 'Kompostlashda azot konvertatsiyasi bilan bog'liq funktsional genlarning xom ashyoga bog'liq ko'pligi nazorat ostida azot yo'qotilishi', Bioresource Technology, 361, 127678-bet. doi: 10.1016/J.BIORTECH.2022.127678.
