-
PacBio-To'liq uzunlikdagi transkriptom (noaniq)
Amplicon (16S/18S/ITS) platformasi mikrobial xilma-xillik loyihasini tahlil qilish boʻyicha koʻp yillik tajribaga ega boʻlib ishlab chiqilgan boʻlib, u standartlashtirilgan asosiy tahlil va shaxsiylashtirilgan tahlilni oʻz ichiga oladi: asosiy tahlil joriy mikrobial tadqiqotlarning asosiy tahlil mazmunini qamrab oladi, tahlil mazmuni boy va keng qamrovli, va tahlil natijalari loyiha hisobotlari shaklida taqdim etiladi;Shaxsiylashtirilgan tahlilning mazmuni xilma-xildir.Shaxsiylashtirilgan talablarni amalga oshirish uchun namunalar tanlanishi va parametrlar asosiy tahlil hisoboti va tadqiqot maqsadiga muvofiq moslashuvchan tarzda o'rnatilishi mumkin.Windows operatsion tizimi, oddiy va tez.
-
PacBio-To'liq uzunlikdagi transkriptom (noaniq)
Pacific Biosciences (PacBio) izoform ketma-ketligi ma'lumotlarini kirish sifatida qabul qilgan holda, ushbu ilova to'liq uzunlikdagi transkript ketma-ketliklarini (montajsiz) aniqlay oladi.To'liq uzunlikdagi ketma-ketliklarni mos yozuvlar genomiga solishtirib, transkriptlarni ma'lum genlar, transkriptlar, kodlash hududlari va boshqalar bilan optimallashtirish mumkin. Bunday holda, mRNK tuzilmalarini, masalan, alternativ birlashma va boshqalarni aniqroq aniqlashga erishish mumkin.NGS transkriptomining ketma-ketligi ma'lumotlari bilan birgalikda tahlil qilish transkript darajasida ifodani yanada kengroq izohlash va aniqroq miqdorni aniqlash imkonini beradi, bu esa asosan quyi oqimdagi differentsial ifoda va funktsional tahlilga foyda keltiradi.
-
Asboblar to'plami
BMKCloud genomik dasturlar uchun bir martalik yechimni taqdim etuvchi yetakchi bioinformatika platformasi boʻlib, unga tibbiyot, qishloq xoʻjaligi, atrof-muhit va boshqalarni oʻz ichiga olgan turli sohalarda tadqiqotchilar tomonidan keng ishoniladi. BMKCloud integratsiyalashgan, ishonchli va samarali xizmatlarni, shu jumladan bioinformatik tahlil platformalari va vositalarini taqdim etishga intiladi. , hisoblash resurslari, ommaviy ma'lumotlar bazasi, bioinformatika onlayn kurslari va boshqalar. BMKCloud gen annotatsiyasi, evolyutsion genetik vositalar, ncRNA, ma'lumotlar sifatini nazorat qilish, yig'ish, moslashtirish, ma'lumotlarni olish, mutatsiyalar, statistika, figura generatori, ketma-ketlikni o'z ichiga olgan turli xil tez-tez ishlatiladigan bioinformatika vositalariga ega. tahlil qilish va boshqalar.
-
kichik RNK
Kichik RNKlar o'rtacha uzunligi 18-30 nt bo'lgan qisqa kodlanmagan RNK turi bo'lib, miRNK, siRNK va piRNKni o'z ichiga oladi.Bu kichik RNKlar mRNK degradatsiyasi, translatsiyani inhibe qilish, geteroxromatin hosil bo'lishi va boshqalar kabi turli biologik jarayonlarda ishtirok etishi haqida ommaviy ravishda xabar berilgan. SmallRNK sekvensiyasi tahlili hayvonlar/o'simliklar rivojlanishi, kasallik, virus va boshqalar bo'yicha tadqiqotlarda keng qo'llanilgan. Kichik RNK ketma-ketlikni tahlil qilish platformasi standart tahlil va ilg'or ma'lumotlarni qazib olishdan iborat.RNK-seq ma'lumotlari asosida standart tahlil miRNKni identifikatsiyalash va bashorat qilish, miRNK maqsadli genini bashorat qilish, izoh va ekspressiya tahliliga erishish mumkin.Kengaytirilgan tahlil moslashtirilgan miRNK qidirish va ekstraksiya qilish, Venn diagrammasini yaratish, miRNK va maqsadli gen tarmog'ini yaratish imkonini beradi.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS biomarker Technologies bo'yicha boy tajriba asosida ishlab chiqilgan butun genomni qayta tartiblash tahlil platformasidir.Foydalanish uchun qulay platforma Illumina platformasi va BGI sekvensiyasi platformasidan olingan DNK ketma-ketligi maʼlumotlariga mos keladigan bir nechta asosiy parametrlarni oʻrnatish orqali integratsiyalashgan tahlil ish jarayonini tez taqdim etish imkonini beradi.Ushbu platforma juda cheklangan vaqt ichida yuqori samarali ma'lumotlarni tahlil qilish imkonini beruvchi yuqori unumdorlikdagi hisoblash serverida joylashtirilgan.Shaxsiylashtirilgan ma'lumotlarni ishlab chiqarish standart tahlillar, jumladan mutatsiyaga uchragan gen so'rovi, PCR primer dizayni va boshqalar asosida mavjud.
-
mRNK (Ma'lumotnoma)
Transkriptom - genomik genetik ma'lumot va biologik funktsiya proteomi o'rtasidagi bog'liqlik.Transkripsiya darajasini tartibga solish organizmlarni tartibga solishning eng muhim va eng ko'p o'rganilgan usuli hisoblanadi.Transkriptoma ketma-ketligi transkriptomani vaqtning istalgan nuqtasida yoki har qanday sharoitda, bitta nukleotidga to'g'ri keladigan rezolyutsiyada tartiblashi mumkin. U gen transkripsiyasi darajasini dinamik ravishda aks ettirishi, bir vaqtning o'zida noyob va normal transkriptlarni aniqlash va miqdorini aniqlash va tizimli ma'lumotlarni taqdim etishi mumkin. maxsus transkriptlardan namunalar.
Hozirgi vaqtda transkriptoma sekvensiyasi texnologiyasi agronomiya, tibbiyot va boshqa tadqiqot sohalarida, jumladan, hayvonlar va o'simliklarning rivojlanishini tartibga solish, atrof-muhitga moslashish, immunitetning o'zaro ta'siri, genlarning lokalizatsiyasi, turlarning genetik evolyutsiyasi va o'simta va genetik kasalliklarni aniqlashda keng qo'llanilmoqda.
-
Metagenomika (NGS)
Ushbu tahlil platformasi ko'p yillik tajriba asosida ov miltig'i metagenomik ma'lumotlarini tahlil qilish uchun mo'ljallangan.U turli xil tez-tez talab qilinadigan metagenomik tahlillarni o'z ichiga olgan integratsiyalashgan ish jarayonini o'z ichiga oladi, shu jumladan ma'lumotlarni qayta ishlash, turlar darajasidagi tadqiqotlar, gen funktsiyasi darajasidagi tadqiqotlar, metagenomlarni bog'lash va boshqalar. Bundan tashqari, moslashtirilgan ma'lumotlarni qidirish vositalari standart ish jarayoni, jumladan, gen va tur so'rovi asosida mavjud. , parametrlarni sozlash, moslashtirilgan raqam yaratish va h.k.
-
LncRNA
Uzoq kodlanmagan RNKlar (lncRNA) uzunligi 200 nt dan ortiq bo'lgan, oqsillarni kodlay olmaydigan transkriptlarning bir turi.To'plangan dalillar shuni ko'rsatadiki, lncRNAlarning aksariyati funktsional bo'lishi mumkin.Yuqori samarali sekvensiya texnologiyalari va bioinformatik tahlil vositalari bizga lncRNA ketma-ketliklarini va joylashuv ma'lumotlarini yanada samaraliroq ochishga imkon beradi va muhim tartibga solish funktsiyalariga ega bo'lgan lncRNAlarni kashf etishga yordam beradi.BMKCloud tez, ishonchli va moslashuvchan lncRNA tahliliga erishish uchun mijozlarimizga lncRNA ketma-ketligini tahlil qilish platformasini taqdim etishdan faxrlanadi.
-
GWAS
Genom bo'yicha assotsiatsiya tadqiqoti (GWAS) o'ziga xos belgilar (fenotip) bilan bog'liq bo'lgan genetik variantlarni (genotip) aniqlashga qaratilgan.GWA tadqiqotlari ko'p sonli shaxslarning butun genomini kesib o'tgan genetik belgilarni o'rganadi va populyatsiya darajasida statistik tahlil orqali genotip-fenotip birlashmalarini bashorat qiladi.Butun genomning qayta sekvensiyasi barcha genetik variantlarni kashf qilishi mumkin.Fenotipik ma'lumotlar bilan bog'langan holda, GWAS fenotip bilan bog'liq SNP, QTL va nomzod genlarni aniqlash uchun qayta ishlanishi mumkin, bu zamonaviy hayvon/o'simlik naslchilikni kuchli qo'llab-quvvatlaydi.SLAF o'z-o'zidan ishlab chiqilgan soddalashtirilgan genom sekvensiyasi strategiyasi bo'lib, u genom bo'ylab taqsimlangan markerlarni, SNP ni kashf etadi.Ushbu SNPlar, molekulyar genetik belgilar sifatida, maqsadli belgilar bilan assotsiatsiyani o'rganish uchun qayta ishlanishi mumkin.Bu genetik o'zgarishlar bilan bog'liq murakkab xususiyatlarni aniqlashda tejamkor strategiyadir.
-
Nanopore To'liq uzunlikdagi transkriptomika
Organizmlardagi murakkab va o'zgaruvchan muqobil izoformlar genlar ifodasini va oqsil xilma-xilligini tartibga solishning muhim genetik mexanizmlari hisoblanadi.Transkript tuzilmalarini to'g'ri aniqlash genlar ifodasini tartibga solish naqshlarini chuqur o'rganish uchun asosdir.Nanopor sekvensiyasi platformasi transkriptomik tadqiqotni izoform darajasiga muvaffaqiyatli olib keldi.Ushbu tahlil platformasi Nanopore platformasida yaratilgan RNK-Seq ma'lumotlarini mos yozuvlar genomiga asoslangan holda tahlil qilish uchun mo'ljallangan bo'lib, u gen darajasida ham, transkriptlar darajasida ham sifatli va miqdoriy tahlillarga erishadi.
