Metabenomik samagizish --ng
Metagenom - bu ekologik va inson metasenomlari kabi aralash organizmlarning aralash jamiyatining umumiy genetik materialining yig'indisi to'plami. Unda ham madaniy va kamroq mikroorganizmlarning nasllari mavjud. NGS bilan Ochish metabenomenivektori ekologik profillarni, shuningdek, turli xil turlarga, shuningdek, turli turdagilikning xilma-xilligi, shuningdek, turli xillik, mo'l-ko'llik dinamikasi va murakkab inkasbalar. Taqoratonomik tadqiqotlardan tashqari, shuningdek, Metagenomiks ham funktsional gi jinmalarning nuqtai nazarini taklif qiladi, bu kodlangan genika va ularni ekologik jarayonlarda puturtiv rollarini taklif etadi. Va nihoyat, genetik elementlar va ekologik omillar o'rtasidagi korrelyatsiya tarmoqlari mikrobial jamoalar va ularning ekologik fondining murakkab aralashmasini yaxlit tushunishga yordam beradi. Xulosa qilib aytganda, turli xil mikrob jamoatlarning genomikik birikmalarini ochib, ushbu murakkab ekotizimlardagi genetika va ekologiya o'rtasidagi ko'p qirrali munosabatlarni yoritib, pivotenomiya ketma-ketligi hisoblanadi.
Platformalar: Illumman Novasq va DnbseQ-T7
Xizmatning afzalliklari
●Mikrob jamoatchilikni profillash uchun izolyatsiya va etishtirish: Genetik materialni aniqlab bo'lmaydigan organizmlardan chiqarish.
●Yuqori aniqlik: Atrof-muhit namunalarida past-mo'l-ko'llik turlarini aniqlang.
●Bioinformatika bo'yicha keng qamrovli tahlil:Nafaqat taksonli xilma-xillik, balki jamiyatning funktsional xilma-xilligiga ham qaratilgan.
●Keng tajriba:Turli xil ilmiy domenlarda va 200 000 dan ortiq namunalarni qayta ishlash bo'yicha bir nechta metabenomik loyihalarni muvaffaqiyatli yopish bo'yicha rekord bilan bizning jamoamiz har bir loyiha uchun boy tajribaga ega.
Xizmat texnikasi
| Ketma-ketlik platformasi | Ketma-ketlik strategiyasi | Ma'lumotlar tavsiya etiladi | Sifatni boshqarish |
| Illumina Novasq yoki DnbseQ-T7 | Pe150 | 6-20GB | Q3085% |
Xizmat talablari
| Konsentratsiya (NG / mkl) | Umumiy miqdor (Ng) | Hajmi (mkl) |
| ≥1 | ≥30 | ≥20 |
● Tuproq / loyqa: 2-3g
● Ichak miqdori - hayvon: 0,5-2g
● Ichak tarkibidagi hasharotlar: 0.10.25g
● O'simlik yuzasi (boyitilgan cho'kindi): 0,5-1G
● Fermentatsiya brotida boyitilgan cho'kindi): 0,2-0.5g
● Faces (katta hayvonlar): 0,5-2g
● Facees (sichqonchani): 3-5grain
● Pulmoner alveolyar suyuqlik suyuqligi: Filtr qog'ozi
● Vaginal Swab: 5-6 ta chayqov
● Ter / Genital Swab / tupuricha / tupuriual yumshoq to'qima / Fir'yngeal Swab / Rektal Swab: 2-3 ta chayqov
● Yuzgi mikroorganizm: 5-6 ta chayqov
● Suv quyon / havo / biofilm: Filtr qog'ozi
● Endofites: 2-3g
● Dentdikal plakki: 0,5-1G
Xizmat ishi oqimi
Namuna etkazib berish
Kutubxona qurilishi
Tartibsizlik
Ma'lumotlar tahlili
Sotishdan keyingi xizmatlar
Quyidagi tahlilni o'z ichiga oladi:
● Ma'lumotlarning sifatini boshqarish
● Metabenom Majlis va gen bashorat qilish
● Genen annotatsiya
● Xulmoaviy alfonaviy tahlil
● Jamiyatning funktsional tahlili: biologik funktsiya, metabolik, antibiotiklarga qarshi kurash
● Ham funktsional va taksonomik xilma-xillikni tahlil qilish:
Beta-ning xilma-xilligini tahlil qilish
Guruhlararo tahlil
Korrelyatsiya tahlili: atrof-muhit omillari va tarkibi va xilma-xilligi o'rtasida
Funktsional tahlil: Kartani antibiotiklarga qarshi kurash
Kegg metabolik yo'llarini differentsial tahluklar: Muhim yo'llar
Taxbiy taqsimotning alfa xilma-xilligi: Ace indeksi
Tukli taqsimlashning beta xilma-xilligi: Pcaa
Bmkgene-ning iloji boricha iloji boricha iltijo etilgan nashrlar to'plamlari orqali BMKgenning metrendive-serverli serverlar sertifikatlari yordam beradi.
Xay, q. va boshqalar. (2023) kamalak prokuratsiyasining ichak tarkibidagi o'zgarishlarning (onkorxyxus mykiss) yuqumli gematopoetik nekroz virusi turli xil madaniy haroratda yuqtirgan "metigenomik va metabolomik tahlil",Mikrobiologiya bo'yicha chegaralar, 14, p. 1275649. Doi: 10.3389 / FMICB.2023.1275649.
Mao, C. va boshqalar. (2023) "Mikrobial jamoalar, qarshilik ko'rsatadigan genlar va turli trofi shahar ko'lilari shahar ko'lamlarida qarshilik ko'rsatadi: ichki havolalar va tashqi ta'sirlar",Xavfli materiallar jurnali Avantsiyalar, 9, p. 100233. Doi: 10.1016 / JAZADA.2023.100233.
Su, m va al. (2022) "Metabenomik tahlili, qo'ylar remeni suyuq bog'langan suyuqlikli va qattiq bog'langan mikroorganizmlar o'rtasidagi farqlarni aniqladi.Mikrobiologiya bo'yicha chegaralar, 13, p. 851567. Doi: 10.3389 / FMICB.2022.851567.
Yin, jd va boshqalar. (2023) "Sog'liqni qoldirgan Mikrobianning cho'chqa go'shti mikrobiota mushaklarning yog 'to'ng'izlarida mushaklarning yog'li kislotasi cho'kmalarini targ'ib qilish uchun karnitin metabolizmini qaytardi.Innovatsiya, 4 (5), p. 100486. Doi: 10.1016 / J.XINN.2023.100486.
Zhao, x. va boshqalar. (2023) "Metabenomik tushunchalarni" Xayhe Estuar ", Xitoy", Xitoyning yuqori va pastki qismida plastik bo'lmagan qoldiqlarni,Umumiy atrof-muhit bo'yicha fan, 887, p. 164026. Doi: 10.1016 / J.Scitotenv.2023.16026.
