page_head_bg

Mahsulotlar

Metagenomik ketma-ketlik (NGS)

Metagenom organizmlarning aralash jamoasining umumiy genetik materiali to'plamini bildiradi, masalan, atrof-muhit metagenomi, inson metagenomi va boshqalar. Unda etishtiriladigan va etishtirilmaydigan mikroorganizmlarning genomlari mavjud.Metagenomik ketma-ketlik - bu atrof-muhit namunalaridan olingan aralash genomik materiallarni tahlil qilish uchun ishlatiladigan molekulyar vosita bo'lib, u turlarning xilma-xilligi va ko'pligi, populyatsiya tuzilishi, filogenetik munosabatlar, funktsional genlar va atrof-muhit omillari bilan korrelyatsiya tarmog'i haqida batafsil ma'lumot beradi.

Platforma:Illumina NovaSeq6000


Xizmat tafsilotlari

Namoyish natijalari

Case Study

Xizmat afzalliklari

ØMikroorganizmlar jamoasining profilini aniqlash uchun izolyatsiya va etishtirishsiz

ØAtrof-muhit namunalarida kam ko'p turlarni aniqlashda yuqori aniqlik

Ø"Meta-" g'oyasi barcha biologik xususiyatlarni funktsional darajada, tur darajasida va gen darajasida birlashtiradi, bu haqiqatga yaqinroq bo'lgan dinamik ko'rinishni aks ettiradi.

ØBMK 10 000 dan ortiq namunalar qayta ishlangan turli xil namunalar bo'yicha katta tajriba to'playdi.

Xizmat spetsifikatsiyalari

Ketma-ketlikPlatforma

Kutubxona

Tavsiya etilgan ma'lumotlar rentabelligi

Taxminiy aylanish vaqti

Illumina NovaSeq 6000

PE250

50K/100K/300K teglar

30 kun

Bioinformatika tahlillari

üXom ma'lumotlar sifatini nazorat qilish

üMetagenom yig'ilishi

üOrtiqcha bo'lmagan genlar to'plami va izohi

üTurlarning xilma-xilligini tahlil qilish

üGenetik funktsiyalarning xilma-xilligini tahlil qilish

üGuruhlararo tahlil

üEksperimental omillarga qarshi assotsiatsiya tahlili

2

Namuna talablari va yetkazib berish

Namuna talablari:

UchunDNK ekstraktlari:

Namuna turi

Miqdori

Diqqat

Tozalik

DNK ekstraktlari

> 30 ng

> 1 ng/ml

OD260/280= 1,6-2,5

Atrof-muhit namunalari uchun:

Namuna turi

Tavsiya etilgan namuna olish tartibi

Tuproq

Namuna miqdori: taxminan.5 g;Qolgan qurigan moddani sirtdan olib tashlash kerak;Katta bo'laklarni maydalang va 2 mm filtrdan o'ting;Saqlash uchun steril EP-naycha yoki cyrotubedagi alikot namunalari.

Najas

Namuna miqdori: taxminan.5 g;Namunalarni bron qilish uchun steril EP-naycha yoki kriotubeda to'plang va alikot qiling.

Ichak tarkibi

Namunalar aseptik sharoitda qayta ishlanishi kerak.Yig'ilgan to'qimalarni PBS bilan yuving;PBS ni santrifüj qiling va cho'kmani EP-naychalarga to'plang.

Loy

Namuna miqdori: taxminan.5 g;Loy namunasini zahiraga olish uchun steril EP-naycha yoki kriotubeda to'plang va qisman oling.

Suv havzasi

Quduq suvi, quduq suvi va boshqalar kabi mikrobial miqdori cheklangan namuna uchun kamida 1 l suv to'plang va membranadagi mikrobni boyitish uchun 0,22 mkm filtrdan o'tkazing.Membranani steril naychada saqlang.

Teri

Teri yuzasini steril paxta tampon yoki jarrohlik pichoq bilan ehtiyotkorlik bilan qirib tashlang va uni steril naychaga joylashtiring.

Tavsiya etilgan namuna yetkazib berish

Namunalarni suyuq azotda 3-4 soat davomida muzlatib qo'ying va suyuq azotda yoki -80 darajadan uzoq muddatli saqlash uchun saqlang.Quruq muz bilan namuna jo'natish talab qilinadi.

Xizmat ish oqimi

logo_02

Namuna yetkazib berish

logo_04

Kutubxona qurilishi

logo_05

Ketma-ketlik

logo_06

Ma'lumotlarni tahlil qilish

logo_07

Sotishdan keyingi xizmatlar


  • Oldingi:
  • Keyingisi:

  • 1.Gistogramma: Turlarning tarqalishi

    3

    2.KEGG metabolik yo'llariga izohlangan funktsional genlar

    4

    3.Issiqlik xaritasi: nisbiy gen ko'pligiga asoslangan differentsial funktsiyalar54.CARD antibiotiklarga qarshilik genlarining sirkolari

    6

    BMK ishi

    Tuproq-mangrov ildizi uzluksizligi bo'ylab antibiotiklarga qarshilik genlari va bakterial patogenlarning tarqalishi

    Nashr etilgan:Xavfli moddalar jurnali, 2021

    Ketma-ketlik strategiyasi:

    Materiallar: mangrov ildizining to'rtta bo'lagi bilan bog'liq namunalarning DNK ekstrakti: ekilmagan tuproq, rizosfera, episfera va endosfera bo'linmalari
    Platforma: Illumina HiSeq 2500
    Maqsadlar: Metagenom
    16S rRNK geni V3-V4 hududi

    Asosiy natijalar

    Tuproqdan o'simliklarga antibiotiklarga chidamlilik genlarining (ARG) tarqalishini o'rganish uchun mangrov ko'chatlarining tuproq-ildiz kontinuumida metagenomik ketma-ketlik va metabarkodlash profili qayta ishlandi.Metagenomik ma'lumotlar shuni ko'rsatdiki, antibiotiklarga qarshilik genlarining 91,4% yuqorida aytib o'tilgan barcha to'rtta tuproq bo'linmalarida aniqlangan, bu doimiy modani ko'rsatdi.16S rRNK amplikon ketma-ketligi 346 turni ifodalovchi 29285 ta ketma-ketlikni hosil qildi.Amplikon ketma-ketligi bilan turlarni profillash bilan birlashganda, bu tarqalish ildiz bilan bog'liq mikrobiotadan mustaqil ekanligi aniqlandi, ammo bu genetik elementlarning harakatlanishi bilan osonlashtirilishi mumkin.Ushbu tadqiqot o'zaro bog'langan tuproq-ildiz uzluksizligi orqali tuproqdan o'simliklarga ARG va patogenlarning oqimini aniqladi.

    Malumot

    Vang, C., Xu, R., Strong, PJ, Zhuang, V., va Shu, L..(2020).Tuproq-mangrov ildizi uzluksizligi bo'ylab antibiotiklarga qarshilik genlari va bakterial patogenlarning tarqalishi.Xavfli moddalar jurnali, 408, 124985.

    taklif oling

    Xabaringizni shu yerga yozing va bizga yuboring

    Bizga xabaringizni yuboring: