Metatranskriptomlar ketma-ketligi
Xizmat xususiyatlari
● rRNKning kamayishi, so'ngra yo'nalishli mRNK kutubxonasini tayyorlash.
● Illumina NovaSeq-da ketma-ketlik.
Xizmat afzalliklari
●Murakkab mikrobial jamoalarning o'zgarishlarini o'rganish:Bu transkripsiya darajasida sodir bo'ladi va potentsial yangi genlarni o'rganadi.
●Mikroblar jamoasining uy egasi yoki atrof-muhit bilan o'zaro ta'sirini tushuntirish.
●Keng qamrovli bioinformatik tahlil: Bu jamoaning taksonomik va funktsional kompozitsiyalari, shuningdek, differensial gen ekspresyon tahlili haqida tushuncha beradi.
●Keng qamrovli gen izohi:Mikrobial jamoalarning ma'lumot beruvchi gen ifodasi ma'lumotlari uchun zamonaviy gen funktsiyasi ma'lumotlar bazalaridan foydalanish.
●Sotishdan keyingi yordam:Bizning majburiyatimiz sotuvdan keyingi 3 oylik xizmat muddati bilan loyihani yakunlashdan tashqariga chiqadi. Shu vaqt ichida biz natijalar bilan bog'liq har qanday so'rovlarni hal qilish uchun loyihani kuzatish, muammolarni bartaraf etish bo'yicha yordam va savol-javob seanslarini taklif qilamiz.
Xizmat spetsifikatsiyalari
| Sequencing platformasi | Ketma-ketlik strategiyasi | Ma'lumotlar tavsiya etiladi | Ma'lumotlar sifatini nazorat qilish |
| Illumina NovaSeq | PE150 | 12 Gb | Q30≥85% |
Namuna talablari
| Konsentratsiya (ng/µL) | Umumiy miqdori (mkg) | Hajmi (µL) | OD260/280 | OD260/230 | RIN |
| ≥50 | ≥1,0 | ≥20 | 1,8-2,0 | 1,0-2,5 | ≥6,5 |
Xizmat ish oqimi
Namuna yetkazib berish
Kutubxona qurilishi
Ketma-ketlik
Ma'lumotlarni tahlil qilish
Sotishdan keyingi xizmatlar
Quyidagi tahlillarni o'z ichiga oladi:
● Sequencing Ma'lumotlar sifatini nazorat qilish
● Transkriptni yig'ish
● Taksonomik izoh va ko'plik
● Funktsional izoh va boylik
● Ifoda miqdorini aniqlash va differentsial tahlil qilish
Har bir namunaning taksonomik taqsimoti:
Beta xilma-xillik tahlili: UPGMA
Funktsional izoh - GO mo'lligi
Differentsial taksonomiya ko'pligi - LEFSE
BMKGene meta-transkriptomik ketma-ketlik xizmatlari tomonidan yaratilgan yutuqlarni o'rganing.
Lu, Z. va boshqalar. (2023) "Bacteroidales guruhidagi laktatdan foydalanadigan bakteriyalarning kislotaga chidamliligi yuqori konsentratsiyali dietaga moslashtirilgan echkilarda ruminal atsidozning oldini olishga yordam beradi",Hayvonlarning oziqlanishi, 14, 130–140-betlar. doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.
Song, Z. va boshqalar. (2017) "An'anaviy qattiq holatdagi fermentatsiyada asosiy funktsional mikrobiotani yuqori o'tkazuvchan amplikonlar va metatranskriptomik ketma-ketlik bilan ochish",Mikrobiologiyadagi chegaralar, 8(iyul). doi: 10.3389/FMICB.2017.01294/FULL.
Vang, W. va boshqalar. (2022) "Fitopatogen Alternaria qo'ziqorinining Metatranskriptomik tadqiqotlari natijasida topilgan yangi mikoviruslar",Viruslar, 14(11), p. 2552. doi: 10.3390/V14112552/S1.
Vey, J. va boshqalar. (2022) "Parallel metatranskriptom tahlili qo'ng'izlar va ularning ichak simbionlari tomonidan o'simlik ikkilamchi metabolitlarining degradatsiyasini aniqlaydi",Molekulyar Ekologiya, 31(15), 3999–4016-betlar. doi: 10.1111/MEC.16557.
