-
Metagenomik ketma-ketlik (NGS)
Metagenom organizmlarning aralash jamoasining umumiy genetik materiali to'plamini bildiradi, masalan, atrof-muhit metagenomi, inson metagenomi va boshqalar. Unda etishtiriladigan va etishtirilmaydigan mikroorganizmlarning genomlari mavjud.Metagenomik ketma-ketlik - bu atrof-muhit namunalaridan olingan aralash genomik materiallarni tahlil qilish uchun ishlatiladigan molekulyar vosita bo'lib, u turlarning xilma-xilligi va ko'pligi, populyatsiya tuzilishi, filogenetik munosabatlar, funktsional genlar va atrof-muhit omillari bilan korrelyatsiya tarmog'i haqida batafsil ma'lumot beradi.
Platforma:Illumina NovaSeq6000
-
Metagenomik ketma-ketlik-nanopora
Metagenomika - bu atrof-muhit namunalaridan olingan aralash genomik materiallarni tahlil qilish uchun ishlatiladigan molekulyar vosita bo'lib, u turlarning xilma-xilligi va ko'pligi, populyatsiya tuzilishi, filogenetik munosabatlar, funktsional genlar va atrof-muhit omillari bilan korrelyatsiya tarmog'i va boshqalar haqida batafsil ma'lumot beradi. Nanoporlarni ketma-ketlik platformalari yaqinda joriy etilgan. metagenomik tadqiqotlar uchun.Uning o'qish uzunligi bo'yicha ajoyib ishlashi pastga oqim metagenomik tahlilini, ayniqsa metagenom yig'ilishini sezilarli darajada oshirdi.O'qish uzunligi afzalliklaridan foydalangan holda, Nanoporga asoslangan metagenomik tadqiqot o'q otish quroli metagenomikasi bilan solishtirganda uzluksiz yig'ilishga erisha oladi.Nanoporga asoslangan metagenomika mikrobiomalardan to'liq va yopiq bakterial genomlarni muvaffaqiyatli yaratganligi e'lon qilindi (Moss, EL va boshqalar,Tabiat biotexnologiyasi, 2020)
Platforma:Nanopor PromethION P48
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
16S va 18S rRNKning yuqori darajada saqlanib qolgan va oʻta oʻzgaruvchan hududlarni oʻz ichiga olgan subunit prokaryotik va eukaryotik organizmlarni identifikatsiyalash uchun mukammal molekulyar barmoq izi hisoblanadi.Sekvensiyadan foydalangan holda, bu amplikonlarni saqlangan qismlarga asoslangan holda yo'naltirish mumkin va giper-o'zgaruvchan hududlar mikrobial identifikatsiya qilish uchun to'liq tavsiflanishi mumkin, bu mikrobial xilma-xillikni tahlil qilish, taksonomiya, filogeniya va boshqalarni o'z ichiga olgan tadqiqotlarga hissa qo'shadi. Yagona molekulali real vaqt rejimi (SMRT) ) PacBio platformasining ketma-ketligi to'liq uzunlikdagi amplikonlarni (taxminan 1,5 Kb) qamrab oladigan yuqori aniqlikdagi uzoq o'qishlarni olish imkonini beradi.Genetik maydonning keng ko'rinishi bakteriyalar yoki zamburug'lar jamoasida turlar annotatsiyasining aniqligini sezilarli darajada oshirdi.
Platforma:PacBio davomi II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
16S/18S/ITS amplikon ketma-ketligi oʻta oʻzaro bogʻlangan va oʻta oʻzgaruvchan qismlarni oʻz ichiga olgan maishiy genetik markerlarning PCR mahsulotlarini oʻrganish orqali mikroblar jamoasida filogeniya, taksonomiya va turlarning koʻpligini aniqlashga qaratilgan.Woeses va boshqalar (1977) tomonidan ushbu mukammal molekulyar barmoq izining kiritilishi mikrobiomani izolyatsiyasiz profillash imkonini beradi.16S (bakteriyalar), 18S (zamburug'lar) va ichki transkripsiyalangan spacer (ITS, zamburug'lar) ketma-ketligi ham ko'p turlarni, ham noyob va noma'lum turlarni aniqlash imkonini beradi.Ushbu texnologiya turli muhitlarda, masalan, inson og'zi, ichaklari, najaslari va boshqalarda differensial mikrob tarkibini aniqlashda keng qo'llaniladigan va asosiy vositaga aylandi.
Platforma:Illumina NovaSeq6000
-
Bakterial va zamburug'li butun genomni qayta tartiblash
Bakterial va zamburug'li butun genomni qayta tartiblash ma'lum bakteriya va zamburug'larning genomlarini to'ldirish, shuningdek, bir nechta genomlarni solishtirish yoki yangi organizmlarning genomlarini xaritalash uchun muhim vositadir.Aniq mos yozuvlar genomlarini yaratish, mikroblarni aniqlash va boshqa qiyosiy genom tadqiqotlarini o'tkazish uchun bakteriya va zamburug'larning butun genomlarini ketma-ketlashtirish katta ahamiyatga ega.
Platforma: Illumina NovaSeq 6000
-
Qo'ziqorin genomi
Biomarker Technologies aniq tadqiqot maqsadiga qarab genom tadqiqotini, nozik genomni va qo'ziqorinning to'liq genomini ta'minlaydi.Genom ketma-ketligi, yig'ish va funktsional izohlash yuqori darajadagi genom yig'ilishiga erishish uchun keyingi avlod sekvensiyasi + Uchinchi avlod sekvensiyasini birlashtirish orqali erishish mumkin.Xromosoma darajasida genom yig'ilishini osonlashtirish uchun Hi-C texnologiyasi ham qo'llanilishi mumkin.
Platforma:PacBio davomi II
Nanopor PromethION P48
Illumina NovaSeq 6000
-
Bakteriyalar to'liq genom
Biomarker Technologies nol bo'shliqqa ega bakteriyalarning to'liq genomini yaratish bo'yicha sekvensiya xizmatini taqdim etadi.Bakteriyalar genomini to'liq qurishning asosiy ish oqimi uchinchi avlod ketma-ketligi, yig'ish, funktsional izoh va aniq tadqiqot maqsadlariga javob beradigan ilg'or bioinformatik tahlilni o'z ichiga oladi.Bakteriyalar genomini yanada kengroq profillash ularning biologik jarayonlari asosidagi asosiy mexanizmlarni ochib berishga imkon beradi, bu esa yuqori eukaryotik turlarda genomik tadqiqotlar uchun qimmatli ma'lumotnoma bo'lishi mumkin.
Platforma:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq 6000
PacBio davomi II
