mRNA-seq (NGS) – De novo

mRNA ketma-ketligi hujayralardagi barcha mRNA transkriptlarini ma'lum sharoitlarda profillash imkonini beradi va turli tadqiqot sohalarida keng qo'llaniladigan texnologiya hisoblanadi. BMKCloud De novo mRNA-seq quvur liniyasi hech qanday ma'lumotnoma genom mavjud bo'lmagan hollarda poli-A bilan boyitilgan ketma-ketlik kutubxonalarini tahlil qilish uchun mo'ljallangan. Quvur liniyasi sifat nazorati bilan boshlanadi, keyin esayangitranskript yig'ish va unigen to'plamini tanlash. Unigen tuzilishi tahlili kodlash ketma-ketligini (CDS) va oddiy ketma-ketlik takrorlanishlarini (SSR) bashorat qiladi. Keyinchalik, differentsial ifoda tahlili sinovdan o'tgan sharoitlar orasida differentsial ifodalangan genlarni (DEG) topadi, so'ngra biologik tushunchalarni olish uchun funktsional annotatsiya va DEGlarni boyitish amalga oshiriladi.