Pacbio to'liq metrajli transkriptomasi

PacBio to'liq uzunlikdagi transkriptom ketma-ketligi, Isoseq, transkript izoformalarini aniq aniqlash imkonini beradi, muqobil poliadenilatsiya va splaysinga yoritib beradi va gen ekspressiyasini aniqroq tahlil qilishga olib keladi. BMKCloud PacBio to'liq uzunlikdagi transkriptom quvur liniyasi aylanma konsensus ketma-ketligi (CCS) rejimida ketma-ketlashtirilgan kDNK kutubxonalarini tahlil qilish uchun mo'ljallangan va keyinchalik ortiqcha bo'lmagan transkriptlarga klasterlangan to'liq uzunlikdagi ximerik bo'lmagan (FLNC) ketma-ketliklarni aniqlaydi. Keyingi BUSCO tahlili transkriptom yig'ilishining to'liqligini baholaydi. Yig'ilgan transkriptomdan bir nechta tahlillar amalga oshiriladi: muqobil splaysinga, oddiy ketma-ketlikni takrorlashga (SSR), lncRNA va unga mos keladigan maqsadli genlarni bashorat qilish, yangi genlarni bashorat qilish, gen oilasini tahlil qilish, transkripsiya omillarini tahlil qilish va transkriptlarning funktsional annotatsiyasi.