Mahsulotlar

Prokaryotik RNK ketma-ketligi

Prokaryotik RNK ketma-ketligi o'zgaruvchan hujayra transkriptomini tahlil qilish orqali ma'lum bir vaqtda RNKning mavjudligi va miqdorini aniqlash uchun keyingi avlod sekvensiyasidan (NGS) foydalanadi.Kompaniyamizning prokaryotik RNK ketma-ketligi, xususan, mos yozuvlar genomlari bo'lgan prokariotlarga qaratilgan bo'lib, sizga transkriptoma profilini aniqlash, gen strukturasini tahlil qilish va h.k.larni taqdim etadi. U fundamental fan tadqiqotlari, dori-darmonlarni tadqiq qilish va ishlab chiqishda va boshqalarda keng qo'llaniladi.

Platforma: Illumina NovaSeq platformasi

Biz bilan bog'lanish

Xizmat tafsilotlari

Xizmat spetsifikatsiyalari

Platforma: Illumina NovaSeq platformasi, PE150

Kutubxona turi: 350bp cDNA kutubxonasini kiritish (cho'qqi taqsimotiga bog'liq)

Sequencing strategiyasi: Paired-End 150 bp

Tavsiya etilgan maʼlumotlar hajmi: 2 Gb xom maʼlumot/namuna

Bioinformatika

(1) Sequencing ma'lumotlar sifatini nazorat qilish: Nukleotid taqsimoti, asosiy sifat taqsimoti, rRNK nisbatini baholash;

(2) ketma-ketlikni moslashtirish tahlili: Hizalama natijalari statistikasi, ketma-ketlikning to'yinganligi, ketma-ketlikni qamrab olish;

(3) Referent genom annotatsiyasi (NR, Swiss-Prot, Pfam, COG, GO, KEGG);

(4) Ifoda tahlili: ifoda taqsimoti (ikki yoki undan ortiq namunalar bilan), namunalar orasidagi ifodani tahlil qilish (Venn tahlili, korrelyatsiya tahlili, PCA tahlili);

(5) Differensial ifoda tahlili (ikki yoki undan ortiq namunalar bilan);

(6) Genlar to'plami tahlili: Venn tahlili, Klaster tahlili, Funktsiya annotatsiyasi tahlili (COG, GO, KEGG), Funktsiyani boyitish tahlili (GO, KEGG), Funktsiyani boyitish akkord grafigi, Ipath tahlili;

(7) sRNK tahlili: sRNK prognozi, sRNK annotatsiyasi (Blast, sRNAMap, sRNATarBase, SIPHT, Rfam), sRNKning ikkilamchi tuzilishini bashorat qilish, sRNK maqsadli genni bashorat qilish;

(8) Transkript tuzilishi tahlili: Operon tahlili, Transkripsiyaning boshlanish va tugash joylarini bashorat qilish, UTR izohi va tahlili, Promoter ketma-ketligini bashorat qilish, SNP/InDel tahlili (SNP/InDel izohi, SNP/InDel mintaqaviy taqsimoti, SNP statistikasi).