Qisqartirilgan vakillik bisulfit ketma-ketligi (RRBS)
Xizmat spetsifikatsiyalari
Platforma: NovaSeq platformasi, PE150
Kutubxona turi: 200-400bp bisulfit bilan ishlov berilgan DNK kutubxonasini joylashtiring
Sequencing strategiyasi: Paired-End 150 bp
Tavsiya etilgan ma'lumotlar chiqishi: 10 Gb xom ma'lumot/namuna
Namuna talablari
DNK miqdori: ≥ 2ug
DNK konsentratsiyasi: ≥ 20ng/ml.
Soflik: OD260/280 = 1,8 dan 2,0 gacha buzilishsiz yoki RNK bilan ifloslanmasdan
Bioinformatika tahlili
Xizmat ish oqimi
Namuna yetkazib berish
Kutubxona qurilishi
Ketma-ketlik
Ma'lumotlarni tahlil qilish
Sotishdan keyingi xizmatlar
a.Malumot genomlarini moslashtirish statistikasi
Xaritani o'qish statistikasi
SC saytining ketma-ketlik chuqurligi va qamrovi statistikasi
Ato'plangan qamrov
Dhar bir namunaning hazm qilish samaradorligi
b.Metillanish joyini aniqlash
C saytida metillanish darajalari ro'yxati
BS konvertatsiyasi
Metillangan sitozin
Metillanish darajasining taqsimlanishi
c.Metilatsiya xaritasi
Genom miqyosida
Genom elementi
d.Namunalar orasidagi metillanish darajasini solishtirish
Pairwise CG metilatsiyasining korrelyatsiyasi
PCA-CG metilatsiyasi
CCG metilatsiyasining porlashi
d.Differensial metillanish tahlili
SDMR statistikasi
DMR uzunligi taqsimoti
Hxaritani yeyish
DMaqsadli hududda MR taqsimoti
