Kichik RNK ketma-ketligi-Illumina
Xususiyatlari
● Hajm tanlash kutubxonasini tayyorlash.
● Bioinformatik tahlil miRNA bashorati va maqsadlariga asoslangan.
Xizmat ko'rsatishning afzalliklari
●Keng qamrovli ekspertizaBiz turli xil namunalarni qamrab oluvchi 300 dan ortiq namunalarni qayta ishladik. Biz har bir loyihaga boy tajribani olib kelamiz.
●Qattiq sifat nazoratiBiz namunalarni tayyorlashdan tortib, kutubxona tayyorlash, ketma-ketlik va bioinformatikagacha bo'lgan barcha bosqichlarda asosiy nazorat nuqtalarini joriy qilamiz. Bizning puxta monitoringimiz doimiy ravishda yuqori sifatli natijalarni ta'minlashni ta'minlaydi.
●Kompleks bioinformatika tahlili:Bu ma'lum va yangi miRNAlarni aniqlash, miRNA maqsadlarini aniqlash va tegishli funktsional annotatsiya va bir nechta ma'lumotlar bazalari (KEGG, GO) bilan boyitish imkonini beradi.
●Sotuvdan keyingi qo'llab-quvvatlashBiz hozir bo'lish qanchalik muhimligini tushunamiz, shuning uchun bizning majburiyatimiz loyihani yakunlashdan tashqari, 3 oylik sotishdan keyingi xizmat ko'rsatish muddatini ham qamrab oladi. Shu vaqt ichida biz natijalar bilan bog'liq har qanday savollarga javob berish uchun loyihani kuzatish, muammolarni bartaraf etishda yordam berish va savol-javob sessiyalarini taklif etamiz.
Namuna talablari va yetkazib berish
| Kutubxona | Platforma | Tavsiya etilgan ma'lumotlar | Ma'lumotlar sifatini nazorat qilish |
| Tanlangan o'lcham | Illumina SE50 | 10M-20M o'qishlar | Q30≥85% |
Namuna talablari:
Nukleotidlar:
| Konsentratsiya (ng/mkl) | Miqdori (mkg) | Poklik | Halollik |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Gelda oqsil yoki DNK ifloslanishi cheklangan yoki umuman ko'rsatilmagan. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; cheklangan yoki bazaviy balandlik yo'q |
● O'simliklar:
Ildiz, poya yoki gulbarg: 450 mg
Barg yoki urug': 300 mg
Meva: 1,2 g
● Hayvon:
Yurak yoki ichak: 450 mg
Ichki organlar yoki miya: 240 mg
Mushak: 600 mg
Suyaklar, sochlar yoki teri: 1,5 g
● Bo'g'imayaklar:
Hasharotlar: 9 g
Qisqichbaqasimonlar: 450 mg
● To'liq qon: 2 ta naycha
● Hujayralar: 106 hujayralar
● Zardob va plazma:6 ml
Tavsiya etilgan namunaviy yetkazib berish
Idish: 2 ml santrifuga naychasi (qalay folga tavsiya etilmaydi)
Namunaviy yorliqlash: Guruh+replikatsiya, masalan, A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Yuk tashish:
1. Quruq muz: Namunalar paketlarga solinishi va quruq muzga ko'milishi kerak.
2. RNKga barqaror naychalar: RNK namunalari RNK stabilizatsiya naychasida (masalan, RNKstabil®) quritilishi va xona haroratida jo'natilishi mumkin.
Xizmat ko'rsatish ish oqimi
Tajriba dizayni
Namuna yetkazib berish
RNK ekstrakti
Kutubxona qurilishi
Ketma-ketlik
Ma'lumotlar tahlili
Sotishdan keyingi xizmatlar
Bioinformatika
● Xom ma'lumotlar sifatini nazorat qilish
● Kichik RNK tasnifi
● miRNA ifodasi va differentsial ifoda tahlili
● miRNA nishon geni va differentsial ifodalangan miRNA nishon geni annotatsiyasi
● Maqsadli gen annotatsiyasi va differentsial ifodalangan miRNA gen funktsiyasini boyitish
miRNA identifikatsiyasi: tuzilishi va chuqurligi
miRNA ning differentsial ifodasi – ierarxik klasterlash
Differentsial ifodalangan miRNAlar nishonining funktsional annotatsiyasi
BMKGene'ning sRNA sekvenlash xizmatlari tomonidan qo'llab-quvvatlangan tadqiqot yutuqlarini tanlangan nashrlar to'plami orqali o'rganing.
Chen, H. va boshqalar. (2023) 'Virusli infeksiyalar Panax notoginsengda saponin biosintezi va fotosintezini inhibe qiladi',O'simliklar fiziologiyasi va biokimyosi, 203, 108038-bet. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. va boshqalar. (2023) 'FYVE domenini o'z ichiga olgan FREE1 oqsili o'simlik mikroprotsessor komponentlari bilan bog'lanib, miRNA biogenezini bostiradi',EMBO hisobotlari, 24(1). doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Yu, J. va boshqalar. (2023) 'MicroRNA Ame-Bantam-3p asalari Apis mellifera'dagi ko'p epidermal o'sish omili kabi domenlar 8 genini (megf8) nishonga olish orqali lichinka pupa rivojlanishini boshqaradi',Xalqaro molekulyar fanlar jurnali, 24(6), 5726-bet. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. va boshqalar. (2018) 'Go'sht sifati bilan bog'liq MiRNA va genlarning integral tahlili Gga-MiR-140-5p tovuqlarda mushak ichiga yog 'birikmasiga ta'sir qilishini ko'rsatdi',Hujayra fiziologiyasi va biokimyosi, 46(6), 2421–2433-betlar. doi: 10.1159/000489649.
