BMKCloud Log in
banner-03

Mahsulotlar

Butun transkriptoma ketma-ketligi - Illumina

Butun transkriptoma ketma-ketligi kodlovchi (mRNK) va kodlanmaydigan RNKlarni (lncRNA, circRNA va miRNK) o'z ichiga olgan turli RNK molekulalarini profillash uchun keng qamrovli yondashuvni taklif etadi.Ushbu usul ma'lum bir lahzada ma'lum hujayralarning to'liq transkriptomiyasini ushlaydi, bu hujayra jarayonlarini yaxlit tushunishga imkon beradi."Jami RNK ketma-ketligi" deb ham ataladi, u transkriptom darajasida murakkab tartibga solish tarmoqlarini ochishga qaratilgan bo'lib, raqobatdosh endogen RNK (ceRNK) va qo'shma RNK tahlili kabi chuqur tahlil qilish imkonini beradi.Bu, ayniqsa, circRNA-miRNA-mRNA-ga asoslangan ceRNA o'zaro ta'sirini o'z ichiga olgan tartibga soluvchi tarmoqlarni ochishda funktsional xarakteristikaning dastlabki bosqichini belgilaydi.


Xizmat tafsilotlari

Bioinformatika

Namoyish natijalari

Tanlangan nashrlar

Xususiyatlari

● Toʻliq transkriptomani ketma-ketlashtirish uchun ikkilamchi kutubxona: rRNKning kamayishi, keyin PE150 kutubxonasini tayyorlash va oʻlcham tanlash, keyin esa SE50 kutubxonasini tayyorlash

● Alohida bioinformatika hisobotlarida mRNK, lncRNA, circRNA va miRNKning toʻliq bioinformatika tahlili

● Birlashtirilgan hisobotdagi barcha RNK ifodalarini birgalikda tahlil qilish, shu jumladan ceRNK tarmoqlari tahlili.

Xizmat afzalliklari

Normativ tarmoqlarni chuqur tahlil qilish: ceRNA tarmog'ini tahlil qilish mRNK, lncRNA, circRNA va miRNK ning qo'shma ketma-ketligi va to'liq bioinformatik ish oqimi orqali amalga oshiriladi.

Keng qamrovli izoh: biz Differentsial ifodalangan genlarni (DEG) funktsional izohlash uchun bir nechta ma'lumotlar bazalaridan foydalanamiz va transkriptom javobi asosida yotgan hujayra va molekulyar jarayonlar haqida tushuncha beradigan tegishli boyitish tahlilini o'tkazamiz.

Keng ekspertiza: turli tadqiqot sohalarida 2000 dan ortiq transkriptom loyihalarini muvaffaqiyatli yakunlash tajribasiga ega bo'lgan jamoamiz har bir loyihaga boy tajriba olib keladi.

Qattiq sifat nazorati: biz namuna va kutubxonani tayyorlashdan tortib, ketma-ketlik va bioinformatikagacha bo'lgan barcha bosqichlarda asosiy nazorat nuqtalarini amalga oshiramiz.Ushbu sinchkovlik bilan monitoring doimiy ravishda yuqori sifatli natijalarni taqdim etishni ta'minlaydi.

● Keng qamrovli izoh: biz Differentsial ifodalangan genlarni (DEG) funktsional izohlash uchun bir nechta ma'lumotlar bazalaridan foydalanamiz va transkriptom javobi asosida yotgan hujayra va molekulyar jarayonlar haqida tushuncha beradigan tegishli boyitish tahlilini o'tkazamiz.

Sotishdan keyingi yordam: Bizning majburiyatimiz sotuvdan keyingi 3 oylik xizmat muddati bilan loyihani yakunlashdan tashqariga chiqadi.Shu vaqt ichida biz natijalar bilan bog'liq har qanday so'rovlarni hal qilish uchun loyihani kuzatish, muammolarni bartaraf etish bo'yicha yordam va savol-javob seanslarini taklif qilamiz.

Namuna talablari va yetkazib berish

Kutubxona

Ketma-ketlik strategiyasi

Ma'lumotlar tavsiya etiladi

Sifat nazorati

rRNK tugadi

Illumina PE150

16 Gb

Q30≥85%

Hajmi tanlangan

Illumina SE50

10-20 million o'qish

 

Namuna talablari:

Nukleotidlar:

Kons.(ng/ml)

Miqdori (mkg)

Tozalik

Butunlik

≥ 100

≥ 1

OD260/280=1,7-2,5

OD260/230=0,5-2,5

Jelda ko'rsatilgan protein yoki DNK ifloslanishi cheklangan yoki yo'q.

O'simliklar: RIN≥6,5

Hayvon: RIN≥7,0

5,0≥28S/18S≥1,0;

cheklangan yoki asosiy balandlikning yo'qligi

Tavsiya etilgan namuna yetkazib berish

Idish:
2 ml santrifüj naychasi (qalay folga tavsiya etilmaydi)
Namuna belgilari: Guruh+takrorlash, masalan, A1, A2, A3;B1, B2, B3 ......

Yuk tashish:
1.Quruq muz: namunalar qoplarga solib, quruq muzga ko'milishi kerak.
2.RNK barqaror naychalar: RNK namunalari RNK stabilizatsiya trubkasida (masalan, RNAstable®) quritilishi va xona haroratida yuborilishi mumkin.

Xizmat ish oqimi

QC namunasi

Tajriba dizayni

namuna yetkazib berish

Namuna yetkazib berish

Uchuvchi tajriba

RNK ekstraktsiyasi

Kutubxonaga tayyorgarlik

Kutubxona qurilishi

Ketma-ketlik

Ketma-ketlik

Ma'lumotlarni tahlil qilish

Ma'lumotlarni tahlil qilish

Sotishdan keyingi xizmatlar

Sotishdan keyingi xizmatlar


  • Oldingi:
  • Keyingisi:

  • Bioinformatika

    wps_doc_16

    RNK ifodasining umumiy ko'rinishi

     41

    Differensial ifodalangan genlar

    42

     

     

    serRNK tahlili

     43Differensial ifodalangan miRNKlar va tegishli RNKlar

    44 

     BMKGene’ning transkriptomlar ketma-ketligi bo‘yicha to‘liq xizmatlari tomonidan yaratilgan tadqiqot yutuqlarini saralangan nashrlar to‘plami orqali o‘rganing.

     

    Dai, Y. va boshqalar.(2022) 'RNK ketma-ketligi bilan aniqlangan Kashin-Bek kasalligida mRNK, lncRNA va miRNKlarning keng qamrovli ifoda profillari', Molecular Omics, 18(2), 154-166-betlar.doi: 10.1039/D1MO00370D.

    Liu, N. nan va boshqalar.(2022) 'Qishlash davrida Changbay tog'idagi Apis cerananing sovuqqa chidamliligini to'liq uzunlikdagi transkriptomlar tahlili.', Gen, 830, 146503-146503-betlar.doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503.

    Vang, XJ va boshqalar.(2022) 'Kichik hujayrali o'pka saratonida raqobatdosh endogen RNK tartibga solish tarmoqlarining ko'p omiks integratsiyasiga asoslangan ustuvorligi: molekulyar xususiyatlar va dori-darmonlarga nomzodlar', Onkologiyadagi chegaralar, 12, p.904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.

    Xu, P. va boshqalar.(2022) "LncRNA/circRNA-miRNA-mRNA ifoda profillarining integratsiyalashgan tahlili yeryong'oqdagi ildiz nematodalariga javoban potentsial mexanizmlar haqida yangi tushunchalarni ochib beradi", BMC Genomics, 23(1), 1-12-betlar.doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/FIGURES/7.

    Yan, Z. va boshqalar.(2022) "To'liq transkriptom RNK ketma-ketligi qizil LED nurlanishi orqali brokkoli yig'im-terimidan keyingi sifatni saqlash bilan bog'liq molekulyar mexanizmlarni ta'kidlaydi", o'rimdan keyingi biologiya va texnologiya, 188, p.111878. doi: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.

    taklif oling

    Xabaringizni shu yerga yozing va bizga yuboring

    Bizga xabaringizni yuboring: