-
Bản sao chép có thời lượng đầy đủ PacBio (Không tham chiếu)
Nền tảng Amplicon (16S / 18S / ITS) được phát triển với nhiều năm kinh nghiệm trong phân tích dự án đa dạng vi sinh vật, bao gồm phân tích cơ bản được tiêu chuẩn hóa và phân tích cá nhân hóa: phân tích cơ bản bao gồm nội dung phân tích chủ đạo của nghiên cứu vi sinh vật hiện tại, nội dung phân tích phong phú và toàn diện, và kết quả phân tích được trình bày dưới dạng báo cáo dự án;Nội dung phân tích cá nhân hóa rất đa dạng.Có thể chọn mẫu và các thông số có thể được thiết lập linh hoạt theo báo cáo phân tích cơ bản và mục đích nghiên cứu, để thực hiện các yêu cầu cá nhân hóa.Hệ điều hành Windows, đơn giản và nhanh chóng.
-
Bản sao chép có thời lượng đầy đủ PacBio (Không tham chiếu)
Lấy dữ liệu giải trình tự đồng dạng của Pacific Biosciences (PacBio) làm đầu vào, Ứng dụng này có thể xác định các trình tự bảng điểm có độ dài đầy đủ (không cần lắp ráp).Bằng cách ánh xạ các trình tự có độ dài đầy đủ so với bộ gen tham chiếu, các bản sao có thể được tối ưu hóa bởi các gen, bản sao, vùng mã hóa đã biết, v.v. Trong trường hợp này, có thể đạt được việc xác định chính xác hơn các cấu trúc mRNA, chẳng hạn như nối thay thế, v.v..Phân tích kết hợp với dữ liệu giải trình tự một số bảng mã NGS cho phép chú thích toàn diện hơn và định lượng chính xác hơn trong biểu thức ở cấp phiên mã, điều này phần lớn mang lại lợi ích cho biểu thức vi phân hạ nguồn và phân tích chức năng.
-
Bộ công cụ
BMKCloud là nền tảng định dạng sinh học hàng đầu cung cấp giải pháp một cửa cho các chương trình gen, được các nhà nghiên cứu tin tưởng rộng rãi trong các lĩnh vực khác nhau bao gồm y tế, nông nghiệp, môi trường, v.v. BMKCloud cam kết cung cấp các dịch vụ tích hợp, đáng tin cậy và hiệu quả bao gồm các nền tảng và công cụ phân tích định dạng sinh học , tài nguyên máy tính, cơ sở dữ liệu công cộng, các khóa học trực tuyến về thông tin sinh học, v.v. BMKCloud có nhiều công cụ thông tin sinh học được sử dụng thường xuyên bao gồm chú thích gen, công cụ di truyền tiến hóa, ncRNA, kiểm soát chất lượng dữ liệu, lắp ráp, căn chỉnh, trích xuất dữ liệu, đột biến, thống kê, trình tạo hình, trình tự phân tích, v.v.
-
RNA nhỏ
RNA nhỏ là loại RNA ngắn không mã hóa với chiều dài trung bình từ 18-30 nt, bao gồm miRNA, siRNA và piRNA.Các RNA nhỏ này đã được báo cáo hàng loạt là có liên quan đến các quá trình sinh học khác nhau như phân hủy mRNA, ức chế dịch mã, hình thành dị nhiễm sắc, v.v. Phân tích trình tự RNA nhỏ đã được áp dụng rộng rãi trong các nghiên cứu về sự phát triển của động vật / thực vật, bệnh tật, vi rút, v.v. RNA nhỏ nền tảng phân tích trình tự bao gồm phân tích tiêu chuẩn và khai thác dữ liệu nâng cao.Dựa trên dữ liệu RNA-seq, phân tích tiêu chuẩn có thể đạt được nhận dạng và dự đoán miRNA, dự đoán gen mục tiêu miRNA, phân tích chú thích và biểu hiện.Phân tích nâng cao cho phép tìm kiếm và trích xuất miRNA tùy chỉnh, tạo sơ đồ Venn, miRNA và xây dựng mạng lưới gen mục tiêu.
-
NGS-WGS (Illumina / BGI)
NGS-WGS là một nền tảng phân tích tái trình tự toàn bộ bộ gen, được phát triển dựa trên kinh nghiệm phong phú trong Công nghệ Dấu ấn Sinh học.Nền tảng dễ sử dụng này cho phép gửi nhanh quy trình phân tích tích hợp bằng cách chỉ cần thiết lập một vài thông số cơ bản, phù hợp với dữ liệu giải trình tự DNA được tạo từ cả nền tảng Illumina và nền tảng giải trình tự BGI.Nền tảng này được triển khai trên máy chủ tính toán hiệu suất cao, cho phép phân tích dữ liệu hiệu quả cao trong thời gian rất hạn chế.Khai thác dữ liệu được cá nhân hóa có sẵn trên cơ sở phân tích tiêu chuẩn, bao gồm truy vấn gen đột biến, thiết kế mồi PCR, v.v.
-
mRNA (Tham khảo)
Transcriptome là liên kết giữa thông tin di truyền bộ gen và proteome của chức năng sinh học.Điều hòa mức độ phiên mã là phương thức điều hòa quan trọng nhất và được nghiên cứu rộng rãi nhất của sinh vật.Giải trình tự bộ mã phiên mã có thể giải trình tự bộ mã phiên mã tại bất kỳ thời điểm nào hoặc trong bất kỳ điều kiện nào, với độ phân giải chính xác đến một nucleotide đơn. mẫu bảng điểm cụ thể.
Hiện nay, công nghệ giải trình tự gen phiên mã đã được sử dụng rộng rãi trong nông học, y học và các lĩnh vực nghiên cứu khác, bao gồm điều chỉnh sự phát triển của động vật và thực vật, thích ứng với môi trường, tương tác miễn dịch, bản địa hóa gen, tiến hóa di truyền loài và phát hiện khối u và bệnh di truyền.
-
Metagenomics (NGS)
Nền tảng phân tích này được thiết kế để phân tích dữ liệu đo lường súng ngắn dựa trên nhiều năm kinh nghiệm.Nó bao gồm quy trình làm việc tích hợp chứa nhiều phân tích đo lường thông thường cần thiết bao gồm xử lý dữ liệu, nghiên cứu cấp loài, nghiên cứu cấp chức năng gen, phân loại gen, v.v. Ngoài ra, các công cụ khai thác dữ liệu tùy chỉnh có sẵn theo quy trình phân tích tiêu chuẩn, bao gồm truy vấn gen và loài , cài đặt thông số, tạo hình được cá nhân hóa, v.v.
-
LncRNA
RNA dài không mã hóa (lncRNA) là một loại phiên mã có chiều dài hơn 200 nt, không có khả năng mã hóa protein.Các bằng chứng tích lũy cho thấy rằng hầu hết các lncRNA rất có thể hoạt động được.Công nghệ giải trình tự thông lượng cao và các công cụ phân tích thông tin sinh học cho phép chúng tôi tiết lộ trình tự lncRNA và thông tin định vị hiệu quả hơn và dẫn chúng tôi khám phá các lncRNA có chức năng điều tiết quan trọng.BMKCloud tự hào cung cấp cho khách hàng nền tảng phân tích trình tự lncRNA để đạt được phân tích lncRNA nhanh chóng, đáng tin cậy và linh hoạt.
-
GWAS
Nghiên cứu liên kết toàn bộ bộ gen (GWAS) nhằm xác định các biến thể di truyền (kiểu gen) có liên quan đến các đặc điểm cụ thể (kiểu hình).Các nghiên cứu của GWA điều tra các dấu hiệu di truyền qua toàn bộ bộ gen của một số lượng lớn các cá thể và dự đoán sự liên kết kiểu gen-kiểu hình bằng phân tích thống kê ở cấp độ quần thể.Giải mã lại toàn bộ bộ gen có thể phát hiện ra tất cả các biến thể di truyền.Kết hợp với dữ liệu kiểu hình, GWAS có thể được xử lý để xác định SNP, QTL có liên quan đến kiểu hình và các gen ứng viên, điều này hỗ trợ mạnh mẽ cho quá trình tạo giống động vật / thực vật hiện đại.SLAF là một chiến lược giải trình tự bộ gen đơn giản tự phát triển, chiến lược này phát hiện ra các điểm đánh dấu phân tán trên toàn bộ bộ gen, SNP.Những SNP này, như là dấu hiệu di truyền phân tử, có thể được xử lý cho các nghiên cứu liên kết với các đặc điểm được nhắm mục tiêu.Đây là một chiến lược hiệu quả về chi phí trong việc xác định các đặc điểm phức tạp liên quan đến các biến thể di truyền.
-
Bản ghi độ dài đầy đủ Nanopore
Các dạng đồng dạng thay thế phức tạp và biến đổi trong sinh vật là cơ chế di truyền quan trọng để điều chỉnh sự biểu hiện gen và sự đa dạng của protein.Việc xác định chính xác các cấu trúc phiên mã là cơ sở để nghiên cứu sâu về các kiểu điều hòa biểu hiện gen.Nền tảng giải trình tự nanopore đã đưa thành công nghiên cứu phiên mã lên cấp isoform.Nền tảng phân tích này được thiết kế để phân tích dữ liệu RNA-Seq được tạo trên nền tảng Nanopore dựa trên bộ gen tham chiếu, giúp đạt được các phân tích định tính và định lượng ở cả cấp độ gen và cấp độ phiên mã.
