Các sản phẩm

*Các kết quả demo hiển thị ở đây đều lấy từ bộ gen được xuất bản bằng Biomarker Technologies

1. Ước tính thời gian chèn LTR: Hình vẽ cho thấy sự phân bố lưỡng kim duy nhất về thời gian chèn LTR-RT trong bộ gen lúa mạch đen Weining, so với các loài khác.Đỉnh cao gần đây nhất xuất hiện vào khoảng 0,5 triệu năm trước.

Li Quảng và cộng sự,Di truyền học tự nhiên, 2021

2. Phân tích phát sinh loài và họ gen trên su su (Sechium edule): Bằng cách phân tích su su và 13 loài liên quan khác trong họ gen, Chayote được phát hiện có họ hàng gần gũi nhất với cây bầu rắn (Trichosanthes anguina).Su su có nguồn gốc từ bầu rắn vào khoảng 27-45 Mya và sự sao chép toàn bộ bộ gen (WGD) đã được quan sát thấy ở su su vào 25±4 Mya, đây là sự kiện WGD thứ ba ở họ cucuibitaceae.

Fu A và cộng sự,Nghiên cứu làm vườn, 2021

3. Phân tích tổng hợp: Một số gen liên quan đến phytohormone trong quá trình phát triển của quả được tìm thấy ở su su, bí đao và bí.Mối tương quan giữa su su và bí cao hơn một chút so với su su và bầu rắn.

Fu A và cộng sự,Nghiên cứu làm vườn, 2021

4. Phân tích họ gen: Làm giàu KEGG về sự mở rộng và thu hẹp họ gen trong bộ gen của G.thurberi và G.davidsonii cho thấy rằng các gen liên quan đến sinh tổng hợp steroid và sinh tổng hợp Brassinosteroid đã được mở rộng.

Yang Z và cộng sự,Sinh học BMC, 2021

5. Phân tích sao chép toàn bộ bộ gen: Phân tích phân phối 4DTV và Ks cho thấy toàn bộ sự kiện sao chép bộ gen.Đỉnh của các loài nội tạng cho thấy các sự kiện trùng lặp.Đỉnh của các loài giao thoa thể hiện các sự kiện hình thành loài.Phân tích chỉ ra rằng so với ba loài có liên quan chặt chẽ khác, O. europaea đã trải qua quá trình sao chép gen quy mô lớn gần đây hơn.

Rao G và cộng sự,Nghiên cứu làm vườn, 2021

Vỏ BMK

Hoa hồng không gai: hiểu biết về gen liên quan đến khả năng thích ứng với độ ẩm

Được phát hành: Tạp chí khoa học quốc gia, 2021

Chiến lược tuần tự:

'Basye'skhông gai' (R.Wichurainan) bộ gen:
Xấp xỉ.93 X PacBio + khoảng.90 X Nanopore + 267 X Illumina

Kết quả chính

1. Bộ gen R.wichuraiana chất lượng cao được xây dựng bằng kỹ thuật giải trình tự đọc dài, mang lại tập hợp 530,07 Mb (Kích thước bộ gen ước tính là khoảng 525,9 Mb bằng phương pháp tế bào học dòng chảy và 525,5 bằng phương pháp khảo sát bộ gen; Tỷ lệ dị hợp tử là khoảng 1,03%).Điểm ước tính của BUSCO là 93,9%.So sánh với “Old Blush” (haploOB), chất lượng và tính hoàn chỉnh của bộ gen này đã được xác nhận bằng độ chính xác của cơ sở đơn và chỉ số lắp ráp LTR (LAI=20,03).Bộ gen của R.wichuraiana chứa 32.674 gen mã hóa protein.

2. Phân tích chung đa omics, bao gồm so sánh bộ gen, phiên mã, phân tích QTL của quần thể di truyền, đã tiết lộ sự hình thành loài quan trọng giữa R. wichuraiana và Rosa chinensis.Ngoài ra, sự biến đổi biểu hiện của các gen liên quan trong QTL có thể liên quan đến kiểu hình gai trên thân.

Phân tích bộ gen so sánh giữa Basye;s Thornless và Rosa chinensis bao gồm phân tích tổng hợp, cụm họ gen, phân tích mở rộng và thu hẹp, cho thấy số lượng lớn các biến thể, liên quan đến các đặc điểm quan trọng ở hoa hồng.Sự mở rộng duy nhất trong họ gen NAC và FAR1/FRS rất có thể liên quan đến khả năng kháng bệnh đốm đen.

Chung, M., và cộng sự.“Hoa hồng không gai: hiểu biết về gen liên quan đến khả năng thích ứng với độ ẩm”Tạp chí khoa học quốc gia, 2021;, nwab092.