Illumina và BGI
Đặc trưng
●Nền tảng:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq , HiSeq X Ten và BGI-DNB-T7
●Các chế độ tuần tự:PE50, PE100, PE150, PE250
●Kiểm soát chất lượng thư viện trước khi giải trình tự
●Trình tự phân phối dữ liệu và QC:gửi báo cáo QC và dữ liệu thô ở định dạng fastq sau khi phân kênh và lọc các lần đọc Q30.
Ưu điểm dịch vụ
●Tính linh hoạt của dịch vụ tuần tự:khách hàng có thể chọn sắp xếp theo làn, ô lưu lượng hoặc lượng dữ liệu.
●Tính linh hoạt của nền tảng:Thư viện DNB có thể được chuyển sang nền tảng Illumina
●Kinh nghiệm sâu rộng về nền tảng giải trình tự Illumina:với hàng ngàn dự án khép kín với nhiều chủng loại đa dạng.
●Gửi báo cáo QC trình tự:với các số liệu chất lượng, độ chính xác của dữ liệu và hiệu suất tổng thể của dự án giải trình tự.
●Quá trình giải trình tự trưởng thành:với thời gian quay vòng ngắn.
●Kiểm soát chất lượng nghiêm ngặt: chúng tôi thực hiện các yêu cầu QC nghiêm ngặt để đảm bảo mang lại kết quả chất lượng cao nhất quán.
Yêu cầu mẫu*
Trình tự làn đường một phần
| Lượng dữ liệu (X) | Nồng độ (qPCR/nM) | Âm lượng |
| X 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 20µl |
| 50 Gb ≤ X < 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 20µl |
| X ≥ 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 20µl |
Làn đường đơn (Illumina)
| Nền tảng | Nồng độ (qPCR/nM) | Âm lượng |
| HiSeq X Ten | ≥ 2 nM | ≥ 20µl |
| NovaSeq 6000 SP | ≥ 1 nM | ≥ 25µl |
| NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25µl |
| NovaSeq X | ≥ 1,5 nM | ≥ 25µl |
| BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25µl |
Ngoài nồng độ và tổng lượng, cũng cần có mẫu pic phù hợp.
Vui lòng liên hệ với chúng tôi nếu mẫu của bạn không đáp ứng các yêu cầu về nguyên liệu ban đầu.
Quy trình làm việc của dịch vụ
Kiểm soát chất lượng thư viện
Trình tự
Kiểm soát chất lượng dữ liệu
Giao dự án
Báo cáo QC thư viện
Một báo cáo về chất lượng của thư viện được cung cấp trước khi sắp xếp thứ tự, đánh giá số lượng thư viện và sự phân mảnh.
Báo cáo QC trình tự
Bảng 1. Thống kê dữ liệu giải trình tự.
| ID mẫu | BMKID | Đọc thô | Dữ liệu thô (bp) | Đọc sạch (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96,48 | 99,14 | 94,85 | 36,67 |
| C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96,00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Hình 1. Phân bố chất lượng dọc theo số lần đọc trong mỗi mẫu
Hình 2. Phân phối nội dung cơ bản
Hình 3. Phân phối nội dung đọc trong dữ liệu tuần tự
