Giải trình tự DNA/RNA – Máy giải trình tự Nanopore
Chi tiết dịch vụ Tính năng
| Nền tảng | Kích thước thư viện | Năng suất dữ liệu lý thuyết (trên mỗi ô) | Độ chính xác cơ sở đơn | Ứng dụng |
| Nanopore | 8Kb, 10kb, 20kb, Siêu dài, cDNA-PCR | 70-90Gb/ô | 85-92% | Gọi SV, De novo, Giải trình tự toàn bộ, Iso-Seq, Chú thích gen, Phát hiện metyl hóa DNA |
Ưu điểm dịch vụ
● Hơn 5 năm kinh nghiệm về nền tảng giải trình tự PacBio với hàng nghìn dự án đã hoàn thành với nhiều loài khác nhau.
● BMKGENE là đối tác chính thức của Oxford Nanopore, với chứng nhận RNA/DNA nền tảng kép.
● Có các mẫu máy giải trình tự chính thống với thiết bị hoàn chỉnh và thông lượng giải trình tự đủ lớn.
● Dựa trên nền tảng Nanopore, hơn 10 nghiên cứu về động vật và thực vật của Denovo đã được công bố trên các tạp chí uy tín quốc tế.
Yêu cầu mẫu
| Loại mẫu | Số lượng | Nồng độ (Qubit ®) | Âm lượng | Độ tinh khiết | Người khác |
| DNA bộ gen | Phụ thuộc vào yêu cầu dữ liệu | ≥20ng/μl | ≥15μl | OD260/280=1,7-2,2; OD260/230≥1,5； Đỉnh rõ ràng ở 260 nm，không có tạp chất | Nồng độ cần được đo bằng Qubit và Qubit/Nanopore ≤ 2 |
| Tổng RNA | ≥1,2μg | ≥100μg/μl | ≥15μl | OD260/280=1,7-2,5; OD260/230=0,5-2,5；không có tạp chất | Giá trị RIN ≥7,5 |
Quy trình dịch vụ
Chuẩn bị mẫu
Xây dựng thư viện
Trình tự
Phân tích dữ liệu
Giao dự án
Đánh giá chất lượng dữ liệu mẫu DNA
Bảng 1. Thống kê về dữ liệu sạch.
| BMKID | rawSeqNum | rawSumBase | cleanSeqNum | cleanSumBase | cleanN50Len | cleanN90Len | cleanMeanLen | cleanMaxLen | cleanMeanQual |
| DNA_BMK01 | 1.218.239 | 26,37 | 1.121.736 | 25,90 | 28.014 | 15.764 | 23.090 | 143.181 | 9 |
Đánh giá chất lượng dữ liệu của mẫu RNA
Bảng 1. Thống kê về dữ liệu sạch.
| Tên tệp | ID khách hàng | Đọc số | Số cơ sở | N50 | Chiều dài trung bình | Chiều dài tối đa | Điểm Q trung bình |
| RNA_BMK001 | C2 | 8.947.708 | 4.047.230.083 | 398 | 452 | 129.227 | Câu hỏi 12 |
Hình 1. Phân bố độ dài đọc
Hình 2. Phân phối điểm chất lượng của dữ liệu sạch
Hình 3. Phân phối điểm chất lượng và độ dài của dữ liệu sạch
