Bộ gen nấm
Ưu điểm dịch vụ
● Có sẵn nhiều chiến lược giải trình tự cho các mục tiêu nghiên cứu khác nhau
● Có nhiều kinh nghiệm trong việc tập hợp bộ gen nấm với hơn 10.000 bộ gen hoàn chỉnh bằng pene được tập hợp.
● Đội ngũ hỗ trợ kỹ thuật sau bán hàng chuyên nghiệp đáp ứng các nhu cầu nghiên cứu cụ thể hơn.
Thông số dịch vụ
| Dịch vụ | Chiến lược tuần tự | Đảm bảo chất lượng | Thời gian quay vòng ước tính |
| Bản đồ nấm tốt | Illumina 50X+Nanopore 100X | Contig N50 ≥2 Mb | 35 ngày làm việc |
| PacBio HiFi 30X | |||
| Bản đồ hoàn chỉnh của nấm pene | Illumina 50X+Nanopore 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X | Tỷ lệ neo nhiễm sắc thể >90% | 45 ngày làm việc |
Phân tích tin sinh học
● Kiểm soát chất lượng dữ liệu thô
● Tập hợp bộ gen
● Phân tích thành phần bộ gen
● Chú thích chức năng gen
● Phân tích bộ gen so sánh
Yêu cầu mẫu và giao hàng
Yêu cầu mẫu:
Vìchiết xuất DNA:
| Loại mẫu | Số lượng | Sự tập trung | độ tinh khiết |
| chiết xuất DNA | ＞ 1,2 g | > 20 ng/μl | OD260/280= 1,6-2,5 |
Đối với mẫu mô:
| Loại mẫu | Xử lý mẫu đề xuất | Bảo quản và vận chuyển mẫu |
| Nấm đơn bào | Quan sát nấm men dưới kính hiển vi và thu thập chúng ở pha hàm mũ Chuyển môi trường nuôi cấy (chứa khoảng 3-4,5e9 tế bào) vào eppendorf 1,5 hoặc 2 ml.(Giữ trên băng) Ly tâm ống trong 1 phút ở 14000 g để thu thập vi khuẩn và loại bỏ phần nổi phía trên một cách cẩn thận Đậy kín ống và đông lạnh vi khuẩn trong nitơ lỏng ít nhất 1-3 giờ.Bảo quản ống trong tủ lạnh -80oC. | Làm đông lạnh mẫu trong nitơ lỏng trong 3-4 giờ và bảo quản trong nitơ lỏng hoặc -80 độ để bảo quản lâu dài.Cần vận chuyển mẫu bằng đá khô. |
| Nấm vĩ mô | Khuyến khích sử dụng mô đang trong giai đoạn phát triển tích cực. Rửa sạch khăn giấy bằng nước không có nội độc tố, sau đó là 70% ethonal. Bảo quản mẫu trong ống đông lạnh. |
Quy trình công việc dịch vụ
Phân phối mẫu
Xây dựng thư viện
Trình tự
Phân tích dữ liệu
Dịch vụ sau bán hàng
1.Biểu đồ tuần hoàn về thành phần gen của nấm
2. Phân tích genomics so sánh: Cây phát sinh gen
