Giải trình tự không mã hóa dài - Illumina
Ưu điểm dịch vụ
●Phân tích chung mRNA và lncRNA: bằng cách kết hợp việc định lượng bản sao mRNA với nghiên cứu lncRNA và các mục tiêu của chúng, có thể có được cái nhìn tổng quan sâu sắc về cơ chế điều hòa cơ bản của phản ứng tế bào.
●Chuyên môn sâu rộng: Chúng tôi đã xử lý hơn 230.000 mẫu, đáp ứng nhiều mục tiêu dự án và mẫu khác nhau. Chúng tôi mang đến sự chuyên môn sâu rộng cho mọi dự án.
●Phân tích chung mRNA và lncRNA:Chúng tôi kết hợp việc định lượng bản sao mRNA với nghiên cứu lncRNA và các mục tiêu của chúng, giúp có được cái nhìn tổng quan sâu sắc về cơ chế điều hòa cơ bản của phản ứng tế bào.
●Kiểm soát chất lượng nghiêm ngặt: Chúng tôi áp dụng các điểm kiểm soát cốt lõi trong tất cả các giai đoạn, từ chuẩn bị mẫu đến chuẩn bị thư viện, giải trình tự và tin sinh học. Việc giám sát tỉ mỉ của chúng tôi đảm bảo cung cấp kết quả chất lượng cao một cách nhất quán.
●Chú thích toàn diện: Chúng tôi sử dụng nhiều cơ sở dữ liệu để chú thích chức năng cho các Gen Biểu hiện Khác biệt (DEG) và thực hiện các phân tích làm giàu tương ứng. Phương pháp tiếp cận toàn diện này cung cấp thông tin chi tiết về các quá trình tế bào và phân tử làm nền tảng cho phản ứng phiên mã, đảm bảo bạn có được tất cả thông tin có thể về dữ liệu thí nghiệm của mình.
●Hỗ trợ sau bán hàng: Chúng tôi hiểu tầm quan trọng của việc hiện diện, đó là lý do tại sao cam kết của chúng tôi không chỉ dừng lại ở việc hoàn thành dự án mà còn mở rộng sang thời gian dịch vụ hậu mãi 3 tháng. Trong thời gian này, chúng tôi cung cấp dịch vụ theo dõi dự án, hỗ trợ khắc phục sự cố và các buổi hỏi đáp để giải đáp mọi thắc mắc liên quan đến kết quả.
Yêu cầu mẫu và giao hàng
| Thư viện | Nền tảng | Dữ liệu được đề xuất | Kiểm soát chất lượng dữ liệu |
| thư viện định hướng rRNA cạn kiệt | Illumina PE150 | 10-16 GB | Q30≥85% |
Nucleotide:
| Nồng độ (ng/μl) | Số lượng (μg) | Độ tinh khiết | Chính trực |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Không thấy hoặc có rất ít protein hoặc DNA bị nhiễm bẩn trên gel. | RIN≥6,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; độ cao cơ bản hạn chế hoặc không có |
● Thực vật:
Rễ, thân hoặc cánh hoa: 450 mg
Lá hoặc Hạt: 300 mg
Trái cây: 1,2 g
● Động vật:
Tim hoặc Ruột: 450 mg
Nội tạng hoặc não: 240 mg
Cơ bắp: 600 mg
Xương, Tóc hoặc Da: 1,5g
● Động vật chân đốt:
Côn trùng: 9g
Giáp xác: 450 mg
● Máu toàn phần:2 ống
● Tế bào: 106 tế bào
● Huyết thanh và huyết tương: 6 mL
Giao hàng mẫu được đề xuất
Vật chứa: Ống ly tâm 2 ml (Không khuyến khích dùng giấy bạc)
Nhãn mẫu: Nhóm + bản sao ví dụ A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Vận chuyển:
1. Đá khô: Các mẫu cần được đóng gói trong túi và chôn trong đá khô.
2. Ống RNAstable: Mẫu RNA có thể được sấy khô trong ống ổn định RNA (ví dụ: RNAstable®) và vận chuyển ở nhiệt độ phòng.
Quy trình làm việc của dịch vụ
Thiết kế thí nghiệm
Giao hàng mẫu
Chiết xuất RNA
Xây dựng thư viện
Trình tự
Phân tích dữ liệu
Dịch vụ sau bán hàng
Tin sinh học
- Dữ liệu thô
- Kiểm soát chất lượng dữ liệu
- Căn chỉnh bộ gen
- Cấu trúc gen (Ghép nối thay thế, tối ưu hóa cấu trúc gen và dự đoán gen mới)
- Định lượng biểu hiện gen
- Phân tích biểu hiện khác biệt
- Chú thích và làm giàu DEG + Các gen mục tiêu lncRNA biểu hiện khác biệt
- Nhận dạng bản sao
- nhận dạng lncRNA (bảo tồn lncRNA và lncRNA đã biết)
- dự đoán gen mục tiêu lncRNA
- định lượng biểu hiện lncRNA
- Phân tích chung với dữ liệu mRNA
Phân tích biểu hiện gen khác biệt (DEG)
Định lượng biểu hiện lncRNA – phân cụm
Làm giàu gen mục tiêu lncRNA
Phân tích vị trí mRNA và lncRNA chung – Biểu đồ Circos (vòng tròn ở giữa là mRNA và vòng tròn bên trong là lncRNA)
Khám phá những tiến bộ được tạo điều kiện bởi dịch vụ giải trình tự lncRNA của BMKGene thông qua bộ sưu tập ấn phẩm được tuyển chọn kỹ lưỡng.
Ji, H. et al. (2020) 'Xác định, dự đoán chức năng và xác minh lncRNA quan trọng của lncRNA liên quan đến căng thẳng lạnh ở gan chuột',Báo cáo khoa học2020 10:1, 10(1), trang 1–14. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.
Jia, Z. et al. (2021) 'Phân tích phiên mã tích hợp tiết lộ cơ chế miễn dịch cho dòng cá chép thông thường kháng CyHV-3',Biên giới trong Miễn dịch học, 12, tr. 687151. doi: 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX.
Wang, XJ và cộng sự (2022) 'Ưu tiên hóa dựa trên tích hợp đa Omics của các mạng điều hòa RNA nội sinh cạnh tranh trong ung thư phổi tế bào nhỏ: Đặc điểm phân tử và ứng cử viên thuốc',Biên giới trong Ung thư học, 12, tr. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xiao, L. et al. (2020) 'Phân tích di truyền mạng lưới đồng biểu hiện gen cơ bản trong quá trình quang hợp ở Populus',Tạp chí Công nghệ sinh học thực vật, 18(4), trang 1015–1026. doi: 10.1111/PBI.13270.
Zheng, H. et al. (2022) 'Mạng lưới quản lý toàn cầu về biểu hiện gen bất thường và tín hiệu chuyển hóa bất thường trong tế bào miễn dịch trong môi trường vi mô của bệnh Graves và viêm tuyến giáp Hashimoto',Biên giới trong Miễn dịch học, 13, tr. 879824. doi: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX.
