Trình tự siêu phiên mã
Tính năng dịch vụ
● sự suy giảm rRNA sau đó là việc chuẩn bị thư viện mRNA theo định hướng.
● Trình tự trên Illumina NovaSeq.
Ưu điểm dịch vụ
●Nghiên cứu sự thay đổi của cộng đồng vi sinh vật phức tạp:Điều này xảy ra ở cấp độ phiên mã và khám phá các gen mới tiềm năng.
●Giải thích sự tương tác của cộng đồng vi sinh vật với vật chủ hoặc môi trường.
●Phân tích tin sinh học toàn diện: Điều này cung cấp những hiểu biết sâu sắc về các thành phần chức năng và phân loại cộng đồng, cũng như phân tích biểu hiện gen khác biệt.
●Chú thích gen mở rộng:Sử dụng cơ sở dữ liệu chức năng gen cập nhật để biết thông tin biểu hiện gen thông tin của các cộng đồng vi sinh vật.
●Hỗ trợ sau bán hàng:Cam kết của chúng tôi còn vượt xa việc hoàn thành dự án với thời gian dịch vụ sau bán hàng 3 tháng. Trong thời gian này, chúng tôi cung cấp dịch vụ theo dõi dự án, hỗ trợ khắc phục sự cố và các phiên hỏi đáp để giải quyết mọi thắc mắc liên quan đến kết quả.
Thông số dịch vụ
| Nền tảng trình tự | Chiến lược tuần tự | Dữ liệu được đề xuất | Kiểm soát chất lượng dữ liệu |
| Illumina NovaSeq | PE150 | 12Gb | Q30 ≥85% |
Yêu cầu mẫu
| Nồng độ (ng/µL) | Tổng số tiền (µg) | Thể tích (µL) | OD260/280 | OD260/230 | RIN |
| ≥50 | ≥1,0 | ≥20 | 1,8-2,0 | 1,0-2,5 | ≥6,5 |
Quy trình công việc dịch vụ
Giao mẫu
Xây dựng thư viện
Trình tự
Phân tích dữ liệu
Dịch vụ sau bán hàng
Bao gồm các phân tích sau:
● Kiểm soát chất lượng dữ liệu theo trình tự
● Hội bảng điểm
● Chú thích phân loại và sự phong phú
● Chú thích chức năng và sự phong phú
● Định lượng biểu thức và phân tích vi phân
Phân bố phân loại của từng mẫu:
Phân tích đa dạng Beta: UPGMA
Chú thích chức năng – GO phong phú
Sự phong phú về phân loại khác biệt – LEFSE
Khám phá những tiến bộ được hỗ trợ bởi các dịch vụ giải trình tự phiên mã meta của BMKGene thông qua bộ sưu tập các ấn phẩm được tuyển chọn.
Lu, Z. và cộng sự. (2023) 'Khả năng chịu axit của vi khuẩn sử dụng lactate thuộc bộ Bacteroidales góp phần ngăn ngừa tình trạng nhiễm axit dạ cỏ ở dê thích nghi với chế độ ăn đậm đặc cao',Dinh dưỡng động vật, 14, trang 130–140. doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.
Bài hát, Z. và cộng sự. (2017) 'Làm sáng tỏ hệ vi sinh vật chức năng cốt lõi trong quá trình lên men ở trạng thái rắn truyền thống bằng các bộ khuếch đại thông lượng cao và giải trình tự siêu phiên mã',Biên giới trong vi sinh vật, 8(Tháng 7). doi: 10.3389/FMICB.2017.01294/FULL.
Wang, W. và cộng sự. (2022) 'Các loại Mycovirus mới được phát hiện từ một cuộc khảo sát về siêu phiên mã của nấm Alternaria gây bệnh thực vật',Virus, 14(11), tr. 2552. doi: 10.3390/V14112552/S1.
Wei, J. và cộng sự. (2022) 'Phân tích metatranscriptome song song cho thấy sự suy thoái của các chất chuyển hóa thứ cấp ở thực vật do bọ cánh cứng và các sinh vật cộng sinh trong ruột của chúng',phân tử Sinh thái học, 31(15), trang 3999–4016. doi: 10.1111/MEC.16557.
