mRNA-seq (NGS) – De novo

Giải trình tự mRNA cho phép lập hồ sơ tất cả các bản sao mRNA trong tế bào dưới các điều kiện cụ thể và là một công nghệ được sử dụng rộng rãi trong nhiều lĩnh vực nghiên cứu. Quy trình giải trình tự mRNA de novo của BMKCloud được thiết kế để phân tích các thư viện giải trình tự được làm giàu poly-A khi không có bộ gen tham chiếu. Quy trình bắt đầu với kiểm soát chất lượng, tiếp theo là...mớiQuá trình này bao gồm lắp ráp bản phiên mã và lựa chọn tập hợp unigene. Phân tích cấu trúc unigene dự đoán trình tự mã hóa (CDS) và các trình tự lặp lại đơn giản (SSR). Tiếp theo, phân tích biểu hiện khác biệt tìm ra các gen biểu hiện khác biệt (DEGs) giữa các điều kiện được thử nghiệm, sau đó là chú thích chức năng và làm giàu DEGs để trích xuất thông tin sinh học.