Trình tự phân đoạn khuếch đại theo vị trí cụ thể (SLAF-Seq)
Chi tiết dịch vụ
Sơ đồ kỹ thuật
Luồng công việc
Ưu điểm dịch vụ
Hiệu quả phát hiện điểm đánh dấu cao- Công nghệ giải trình tự thông lượng cao hỗ trợ SLAF-Seq khám phá hàng trăm nghìn thẻ trong toàn bộ bộ gen.
Sự phụ thuộc thấp vào bộ gen- Có thể áp dụng cho các loài có hoặc không có bộ gen tham chiếu.
Thiết kế sơ đồ linh hoạt- Tiêu hóa đơn enzyme, kép, đa enzyme và các loại enzyme khác nhau, tất cả đều có thể được lựa chọn để phục vụ cho mục đích nghiên cứu hoặc loài khác nhau.Đánh giá trước trong silico được sử dụng để đảm bảo thiết kế enzyme tối ưu.
Tiêu hóa enzyme hiệu quả- Tiền thí nghiệm được thực hiện nhằm tối ưu hóa các điều kiện, giúp cho thí nghiệm chính thức ổn định và đáng tin cậy.Hiệu suất thu thập mảnh vỡ có thể đạt trên 95%.
Thẻ SLAF được phân bổ đồng đều- Thẻ SLAF được phân bố đều trên tất cả các nhiễm sắc thể ở mức độ lớn nhất, đạt trung bình 1 SLAF trên 4 kb.
Tránh lặp lại hiệu quả- Trình tự lặp trong dữ liệu SLAF-Seq giảm xuống dưới 5%, đặc biệt ở các loài có mức độ lặp lại cao như lúa mì, ngô, v.v.
Trải nghiệm sâu sắc-Hơn 2000 dự án SLAF-Seq đã đóng trên hàng trăm loài bao gồm thực vật, động vật có vú, chim, côn trùng, thủy sinh vật, v.v.
Quy trình làm việc tin sinh học tự phát triển- Quy trình tin sinh học tích hợp cho SLAF-Seq được BMKGENE phát triển để đảm bảo độ tin cậy và độ chính xác của đầu ra cuối cùng.
Thông số dịch vụ
| Nền tảng | Kết luận(ng/gl) | Tổng cộng (ug) | OD260/280 |
| Illumina NovaSeq | >35 | >1.6(Khối lượng>15μl) | 1,6-2,5 |
Chiến lược trình tự được đề xuất
Độ sâu trình tự: 10X/Thẻ
| Kích thước bộ gen | Thẻ SLAF được đề xuất |
| < 500 Mb | 100K hoặc WGS |
| 500 Mb- 1 Gb | 100 K |
| 1 Gb -2 Gb | 200 K |
| Bộ gen khổng lồ hoặc phức tạp | 300 - 400K |
| Các ứng dụng
| Khuyến khích Quy mô dân số
| Chiến lược trình tự và chiều sâu
| |
| Chiều sâu
| Số thẻ
| ||
| GWAS
| Số mẫu ≥ 200
| 10X
|
Dựa theo kích thước bộ gen
|
| Tiến hóa di truyền
| Cá nhân của mỗi người phân nhóm ≥ 10; tổng số mẫu ≥ 30
| 10X
| |
Đề xuất giao hàng mẫu
Hộp đựng: Ống ly tâm 2 ml
Đối với hầu hết các mẫu, chúng tôi khuyên bạn không nên bảo quản trong ethanol.
Ghi nhãn mẫu: Mẫu cần phải được dán nhãn rõ ràng và giống với phiếu thông tin mẫu đã gửi.
Vận chuyển: Đá khô: Các mẫu trước tiên cần được đóng gói trong túi và chôn trong đá khô.
Quy trình làm việc của dịch vụ
Kiểm soát mẫu
Thí nghiệm thí điểm
thí nghiệm SLAF
Chuẩn bị thư viện
Trình tự
Phân tích dữ liệu
Dịch vụ sau bán hàng
1. Thống kê kết quả bản đồ
2. Phát triển điểm đánh dấu SLAF
3. Chú thích biến thể
| Năm | tạp chí | IF | Tiêu đề | Các ứng dụng |
| 2022 | Truyền thông thiên nhiên | 17.694 | Cơ sở bộ gen của nhiễm sắc thể giga và bộ gen giga của cây mẫu đơn Paeonia ostii | SLAF-GWAS |
| 2015 | Nhà thực vật học mới | 7.433 | Dấu chân thuần hóa neo giữ các vùng gen có tầm quan trọng nông học ở đậu nành | SLAF-GWAS |
| 2022 | Tạp chí nghiên cứu nâng cao | 12.822 | Sự xâm lấn nhân tạo trên toàn bộ gen của Gossypium barbadense vào G. hirsutum tiết lộ các locus ưu việt để cải thiện đồng thời chất lượng và năng suất sợi bông đặc điểm | SLAF-Di truyền học tiến hóa |
| 2019 | thực vật phân tử | 10.81 | Phân tích bộ gen quần thể và hội De Novo tiết lộ nguồn gốc của Weedy Gạo như một trò chơi tiến hóa | SLAF-Di truyền học tiến hóa |
| 2019 | Di truyền học tự nhiên | 31.616 | Trình tự bộ gen và đa dạng di truyền của cá chép Cyprinus carpio | Bản đồ liên kết SLAF |
| 2014 | Di truyền học tự nhiên | 25.455 | Bộ gen của đậu phộng được trồng cung cấp cái nhìn sâu sắc về kiểu nhân cây họ đậu, thể đa bội tiến hóa và thuần hóa cây trồng. | Bản đồ liên kết SLAF |
| 2022 | Tạp chí Công nghệ sinh học thực vật | 9.803 | Việc xác định ST1 cho thấy sự lựa chọn liên quan đến việc đi nhờ xe về hình thái hạt giống và hàm lượng dầu trong quá trình thuần hóa đậu nành | Phát triển SLAF-Marker |
| 2022 | Tạp chí quốc tế về khoa học phân tử | 6.208 | Nhận dạng và phát triển chỉ thị DNA cho loài nhuyễn thể lúa mì-Leymus 2Ns (2D) Thay thế nhiễm sắc thể Disomic | Phát triển SLAF-Marker |
