-
Giải trình tự mRNA có độ dài đầy đủ-Nanopore
Giải trình tự RNA đã là một công cụ vô giá để phân tích bản mã toàn diện.Không nghi ngờ gì nữa, trình tự đọc ngắn truyền thống đã đạt được nhiều bước phát triển quan trọng ở đây.Tuy nhiên, nó thường gặp phải những hạn chế trong nhận dạng đồng dạng có độ dài đầy đủ, định lượng, độ chệch PCR.
Giải trình tự nanopore tự phân biệt với các nền tảng giải trình tự khác, ở chỗ các nucleotide được đọc trực tiếp mà không cần tổng hợp DNA và tạo ra khả năng đọc lâu ở hàng chục kilobase.Điều này cho phép đọc ra trực tiếp bảng điểm có độ dài đầy đủ và giải quyết những thách thức trong các nghiên cứu ở cấp độ đồng dạng.
Nền tảng：Nanopore PromethION
Thư viện:cDNA-PCR
-
De novo Giải trình tự một số bản sao có độ dài đầy đủ -PacBio
De novogiải trình tự phiên mã có độ dài đầy đủ, còn được gọi làDe novoIso-Seq tận dụng những lợi thế của trình tự PacBio về độ dài đọc, cho phép giải trình tự các phân tử cDNA có chiều dài đầy đủ mà không bị đứt đoạn nào.Điều này hoàn toàn tránh được bất kỳ lỗi nào được tạo ra trong các bước lắp ráp bản ghi và tạo các tập hợp thống nhất với độ phân giải cấp đồng dạng.Bộ gen đơn này cung cấp thông tin di truyền mạnh mẽ dưới dạng “bộ gen tham chiếu” ở cấp độ bộ gen phiên mã.Ngoài ra, kết hợp với dữ liệu trình tự thế hệ tiếp theo, dịch vụ này cho phép định lượng chính xác biểu thức cấp đồng dạng.
Nền tảng ： PacBio Sequel IIThư viện: Thư viện chuông SMRT -
Giải trình tự mRNA của sinh vật nhân chuẩn-Illumina
giải trình tự mRNA cho phép định hình tất cả các mRNA được phiên mã từ các tế bào trong các điều kiện cụ thể.Đây là một công nghệ mạnh mẽ để tiết lộ hồ sơ biểu hiện gen, cấu trúc gen và cơ chế phân tử của các quá trình sinh học nhất định.Cho đến nay, giải trình tự mRNA đã được sử dụng rộng rãi trong nghiên cứu cơ bản, chẩn đoán lâm sàng, phát triển thuốc, v.v.
Nền tảng: Illumina NovaSeq 6000
-
Giải trình tự mRNA dựa trên không tham chiếu-Illumina
giải trình tự mRNA thông qua kỹ thuật giải trình tự thế hệ tiếp theo (NGS) để bắt RNA thông tin (mRNA) dạng Eukaryote tại một thời kỳ cụ thể mà một số chức năng đặc biệt đang được kích hoạt.Bản sao dài nhất được ghép nối được gọi là 'Unigene' và được sử dụng làm trình tự tham chiếu cho các phân tích tiếp theo, là một phương tiện hiệu quả để nghiên cứu cơ chế phân tử và mạng lưới điều hòa của loài mà không cần tham chiếu.
Sau khi tập hợp dữ liệu một nhóm phiên mã và chú thích chức năng thống nhất
(1) Phân tích SNP, phân tích SSR, dự đoán CDS và cấu trúc gen sẽ được định dạng trước.
(2) Định lượng biểu hiện đồng nhất trong mỗi mẫu sẽ được thực hiện.
(3) Sự đồng nhất biểu hiện khác biệt giữa các mẫu (hoặc nhóm) sẽ được phát hiện dựa trên biểu hiện đồng nhất
(4) Phân tích phân cụm, chú thích chức năng và làm giàu các hợp nhất được biểu thị khác biệt sẽ được thực hiện
-
Giải trình tự dài không mã hóa-Illumina
RNA dài không mã hóa (lncRNA) là một loại phân tử RNA có chiều dài vượt quá 200 nt, được đặc trưng bởi điện thế mã hóa cực kỳ thấp.LncRNA, là thành viên chính trong RNA không mã hóa, chủ yếu được tìm thấy trong nhân và huyết tương.Sự phát triển trong công nghệ giải trình tự và tin sinh học cho phép xác định nhiều lncRNA mới và liên kết chúng với các chức năng sinh học.Các bằng chứng tích lũy cho thấy lncRNA tham gia rộng rãi vào quá trình điều hòa biểu sinh, điều hòa phiên mã và điều hòa sau phiên mã.
-
Giải trình tự RNA nhỏ-Illumina
RNA nhỏ đề cập đến một lớp phân tử RNA không mã hóa thường có chiều dài nhỏ hơn 200nt, bao gồm RNA vi mô (miRNA), RNA can thiệp nhỏ (siRNA) và RNA tương tác piwi (piRNA).
MicroRNA (miRNA) là một lớp RNA nhỏ nội sinh với chiều dài khoảng 20-24nt, đóng nhiều vai trò điều hòa quan trọng trong tế bào.miRNA tham gia vào nhiều quá trình sống thể hiện sự biểu hiện cụ thể của mô - cụ thể và theo từng giai đoạn và được bảo tồn cao ở các loài khác nhau.
-
giải trình tự vòng tròn-Illumina
Giải trình tự toàn bộ bộ phiên mã được thiết kế để lập hồ sơ tất cả các loại phân tử RNA, bao gồm RNA mã hóa (mRNA) và RNA không mã hóa (bao gồm lncRNA, circleRNA và miRNA) được phiên mã bởi các tế bào cụ thể tại một thời điểm nhất định.Giải trình tự toàn bộ bộ gen phiên mã, còn được gọi là “giải trình tự ARN toàn phần” nhằm mục đích tiết lộ mạng lưới điều hòa toàn diện ở cấp độ bộ phiên mã.Tận dụng công nghệ NGS, trình tự của toàn bộ sản phẩm phiên mã có sẵn để phân tích ceRNA và phân tích RNA khớp, cung cấp bước đầu tiên hướng tới việc xác định đặc tính chức năng.Tiết lộ mạng lưới điều hòa của ceRNA dựa trên vòng sinh học-miRNA-mRNA.
-
Giải trình tự toàn bộ bản sao - Illumina
Giải trình tự toàn bộ bộ phiên mã được thiết kế để lập hồ sơ tất cả các loại phân tử RNA, bao gồm RNA mã hóa (mRNA) và RNA không mã hóa (bao gồm lncRNA, circleRNA và miRNA) được phiên mã bởi các tế bào cụ thể tại một thời điểm nhất định.Giải trình tự toàn bộ bộ gen phiên mã, còn được gọi là “giải trình tự ARN toàn phần” nhằm mục đích tiết lộ mạng lưới điều hòa toàn diện ở cấp độ bộ phiên mã.Tận dụng công nghệ NGS, trình tự của toàn bộ sản phẩm phiên mã có sẵn để phân tích ceRNA và phân tích RNA khớp, cung cấp bước đầu tiên hướng tới việc xác định đặc tính chức năng.Tiết lộ mạng lưới điều hòa của ceRNA dựa trên vòng sinh học-miRNA-mRNA.
-
Giải trình tự RNA của tế bào nhân sơ
Giải trình tự RNA của tế bào nhân sơ sử dụng giải trình tự thế hệ tiếp theo (NGS) để tiết lộ sự hiện diện và số lượng của RNA tại một thời điểm nhất định, bằng cách phân tích bộ phiên mã đang thay đổi của tế bào.Giải trình tự ARN nhân sơ của công ty chúng tôi, đặc biệt nhằm vào các sinh vật nhân sơ có bộ gen tham chiếu, cung cấp cho bạn hồ sơ phiên mã, phân tích cấu trúc gen, v.v. Nó đã được ứng dụng rộng rãi vào nghiên cứu khoa học cơ bản, nghiên cứu và phát triển thuốc, v.v.
Nền tảng: Illumina NovaSeq 6000
-
Metatranscriptome Trình tự
Giải trình tự siêu mã xác định sự biểu hiện gen của vi khuẩn (cả sinh vật nhân thực và sinh vật nhân sơ) trong môi trường tự nhiên (tức là đất, nước, biển, phân và ruột.). Cụ thể, dịch vụ này cho phép bạn thu thập toàn bộ hồ sơ biểu hiện gen của các cộng đồng vi sinh vật phức tạp, phân tích phân loại của các loài, phân tích làm giàu chức năng của các gen được biểu hiện khác nhau và hơn thế nữa.
Nền tảng: Illumina NovaSeq 6000
