● סערוויס פארלאנגט געוועב מוסטערן, אנשטאט עקסטראקטירטע נוקלעאיק זויערן, צו קאנסערווירן די דנ״א-פראטעין אינטעראקציעס.
● די ATAC מעטאָדע נעמט אַרײַן געוועב דיסאָסיאַציע, און דערנאָך קערן איזאָלאַציע, Tn5 באַהאַנדלונג און רייניקונג, PCR אַמפּליפיקאַציע, גרייס סעלעקציע און סיקווענסינג.
● סיקווענסינג אין אילומינאַ נאָוואַסעק
●הויך סענסיטיוויטי:נידעריגע סטאַרטינג צעל קוואַנטיטי איז גענוג פֿאַר ביבליאָטעק צוגרייטונג און סיקווענסינג.
●העכסט אינפאָרמאַטיווע טעכניק: גלייכצייטיג אַנטפּלעקט די גענאָמישע לאָקאַציעס פון אָפֿענעם כראָמאַטין און אַקטיווע רעגולאַטאָרישע עלעמענטן ווי טראַנסקריפּציע פאַקטאָר ביינדינג זייטלעך.
●גוטע עקספּערימענטאַלע רעפּראָדוסיביליטיטעכנישע רעפּליקאַטן ווייַזן ויסגעצייכנט ריפּיטאַביליטי.
●ברייטע עקספּערטיזמיט הונדערטער ATAC סיקווענסינג פראיעקטן וואס זענען ערפאלגרייך פארענדיגט געווארן, ברענגט BMKGENE איבער א יארצענדלינג דערפארונג, א העכסט באגאבטע אנאליז מאַנשאַפֿט, פולשטענדיק אינהאַלט, און אויסגעצייכנטע נאָך-פארקויף שטיצע.
●מעגלעכקייט צו פאַרבינדן מיט טראַנסקריפּטאָמיקס אַנאַליסיסערמעגלעכן די אינטעגרירטע אנאליז פון ATAC seq מיט אנדערע אומיקס דאטן ווי RNA-seq.
● קאָמפּרעהענסיווע ביאָאינפאָרמאַטישע אַנאַליז: ערמעגליכן ניט נאר די אידענטיפיקאציע פון די אפענע ראיאנען פון די כראָמאַטין און זייער קארעספאנדירנדיקע פונקציאנאליטעט (פראמאטערס, UTs, עקסאָנס, אינטראנס) נאר אויך די אנאליז פון די אונטערשיידן צווישן כראָמאַטין אפענע ראיאנען צווישן מוסטערן.
| ביבליאָטעק | סיקווענסינג סטראַטעגיע | רעקאָמענדירטע דאַטן רעזולטאַט | קוואַליטעט קאָנטראָל |
| אַטאַק-סעק | אילומינאַ PE150 | > 20 מיליאָן לייענט דעפּענדינג אויף גענאָם גרייס (מענטש: 50 מיליאָן לייענונגען) | ק30≥85% |
מוסטערן טיפּ: געוועבן, לעבעדיקע אָדער פאַרפרוירענע צעלן, בלוט
● צעל נומער: ≥ 106צעלן
● געוועב וואָג: ≥ 200 מג פריש געוועב
● בלוט: ≥ 4 מל
כולל די פאלגענדע אנאליז:
● קאָנטראָל פון רוי דאַטן קוואַליטעט;
● שפּיץ־רוף באַזירט אויף מאַפּינג צו רעפֿערענץ־גענאָם;
● גענע אנאטאציע אויף שפּיץ לאָקאַציע;
● מאָטיוו אַנאַליז: אידענטיפֿיקאַציע פֿון טראַנסקריפּציע פֿאַקטאָר ביינדינג זייטלעך (TFBS);
● דיפערענציעלע שפּיץ אַנאַליז און אַנאָטאַציע.
1. היץ־מאַפּע אויף ATAC לייענט די פֿאַרשפּרייטונג ביי TSS און שכנותדיקע געגנטן (±3 קב)
2. פאַרשפּרייטונג פון אָפֿענע כראָמאַטין געגנט אין פֿאַרשידענע גענאָם קאָמפּאָנענטן
3. דיפערענציעלע שפּיץ רופן צווישן גרופּעס
אויספאָרשן די פאָרשונג פֿאָרשריטן וואָס זענען געוואָרן ערמעגליכט דורך BMKGene'ס ATAC סיקוואַנסינג באַדינונגען דורך אַ קוראַטירטע זאַמלונג פון פּובליקאַציעס.
פו, א.און אנדערע.(2023) 'טעלאָמער-צו-טעלאָמער גענאָם פֿאַרזאַמלונג פֿון ביטערע מעלאָנע (מאָמאָרדיקאַ טשאַראַנטיאַ ל. וואַרי. אַבריוויאַטאַ סער.) אַנטפּלעקט פרוכט אַנטוויקלונג, זאַץ און רייפּאַנינג גענעטישע קעראַקטעריסטיקס',גאָרטנצוכט פאָרשונג, קסנומקס (קסנומקס). דאָי: 10.1093/HR/UHAC228.
גאָנג, ב.און אנדערע.(2023) 'עפּיגענעטישע און טראַנסקריפּציאָנעלע אַקטיוואַציע פון דער סעקרעטאָרישער קינאַזע FAM20C ווי אַן אָנקאָגענע אין גליאָמאַ',זשורנאַל פון גענעטיק און גענאָמיקס, 50 (6), זז 422-433. דאָי: 10.1016/J.JGG.2023.01.008.
ער, י.און אנדערע.(2023) 'בוטיראט קערט איבער פעראפטאסיס קעגנשטעל אין קאלעקטראלע קענסער דורך אינדוצירן c-Fos-אפהענגיקע xCT סאַפּרעשאַן',רעדאָקס ביאָלאָגיע, 65, ז. 102822. דוי: 10.1016/J.REDOX.2023.102822.