בולקט סעגרעגאַנט אַנאַליסיס
סערוויס אַדוואַנטאַגעס
Takagi עט על., דער פאַבריק זשורנאַל, 2013
● פּינטלעך לאָוקאַלאַזיישאַן: מיקסינג בולקס מיט 30+30 צו 200+200 מענטשן צו מינאַמייז הינטערגרונט ראַש;ניט-סאַנאַנאַמאַס מיוטאַטאַנץ-באזירט קאַנדידאַט געגנט פּראָגנאָז.
● פולשטענדיק אַנאַליסיס: אין-טיפקייַט קאַנדידאַט דזשין פונקציע אַנאָטאַציע, אַרייַנגערעכנט NR, SwissProt, GO, KEGG, COG, KOG, עטק.
● פאַסטער טערנעראַונד צייט: גיך דזשין לאָוקאַלאַזיישאַן ין 45 ארבעטן טעג.
● ברייט דערפאַרונג: BMK האט קאַנטריביוטיד אין טויזנטער פון טרייץ לאָוקאַלאַזיישאַן, קאַווערינג פאַרשידן מינים ווי קראַפּס, וואַסער פּראָדוקטן, וואַלד, בלומען, פירות, אאז"ו ו.
סערוויס ספּעסאַפאַקיישאַנז
באפעלקערונג:
סעגרעגאַטינג נאָכקום פון עלטערן מיט אַפּאָוזינג פענאָטיפּעס.
למשל פ 2 נאָכקום, באַקקראָססינג (בק), רעקאָמבינאַנט ינברעד שורה (ריל)
מיקסינג בעקן
פֿאַר קוואַליטאַטיווע טרייץ: 30-50 מענטשן (מינימום 20) / פאַרנעם
פֿאַר קוואַנטיטאַטיווע טראַטיס: שפּיץ 5% צו 10% מענטשן מיט עקסטרעם פענאָטיפּעס אין דער גאנצער באַפעלקערונג (מינימום 30+30).
רעקאַמענדיד סיקוואַנסינג טיפקייַט
אין מינדסטער 20 קס / פאָטער און 1 קס / זאמען יחיד (למשל פֿאַר זאמען מיקסינג בעקן פון 30 + 30 יחיד, סיקוואַנסינג טיפקייַט וועט זיין 30 קס פּער פאַרנעם)
ביאָינפאָרמאַטיקס אַנאַליסיס
● גאַנץ גענאָמע ריסעקווענסינג
● דאַטאַ פּראַסעסינג
● סנפּ / ינדעל פאַך
● קאַנדידאַט געגנט זיפּונג
● קאַנדידאַט דזשין פונקציאָנירן אַנאָטאַציע
מוסטער רעקווירעמענץ און עקספּרעס
מוסטער רעקווירעמענץ:
נוקלעאָטידע:
| גDNA מוסטער | געוועב מוסטער |
| קאַנסאַנטריישאַן: ≥30 נג/μל | געוויקסן: 1-2 ג |
| סומע: ≥2 μג (באַנד ≥15 μl) | אַנימאַלס: 0.5-1 ג |
| ריינקייַט: OD260/280= 1.6-2.5 | גאַנץ בלוט: 1.5 מל |
סערוויס אַרבעט לויפן
עקספּערימענט פּלאַן
מוסטער עקספּרעס
רנאַ יקסטראַקשאַן
ביבליאָטעק קאַנסטראַקשאַן
סיקוואַנסינג
דאַטאַ אַנאַליסיס
נאָך-פאַרקויף באַדינונגען
1.Association אַנאַליסיס באַזע אויף עוקלידיאַן דיסטאַנסע (עד) צו ידענטיפיצירן קאַנדידאַט געגנט.אין די פאלגענדע פיגור
X-אַקס: טשראָמאָסאָם נומער;יעדער פּונקט רעפּראַזענץ אַן עד ווערט פון אַ SNP.די שווארצע שורה שטימען צו פיטאַד עד ווערט.א העכער עד ווערט ינדיקייץ אַ מער באַטייטיק פאַרבאַנד צווישן דעם פּלאַץ און די פענאָטיפּע.רויט לאָך שורה רעפּראַזענץ שוועל פון באַטייַטיק פאַרבאַנד.
2.אַססאָסיאַטיאָן אַנאַליסיס באזירט קיין סנפּ-אינדעקס
X-אַקס: טשראָמאָסאָם נומער;יעדער פּונקט רעפּראַזענץ די SNP-אינדעקס ווערט.די שוואַרץ שורה שטייט פֿאַר פיטאַד SNP-אינדעקס ווערט.די גרעסערע די ווערט איז, די מער באַטייַטיק די פאַרבאַנד איז.
BMK קאַסע
די הויפּט-ווירקונג קוואַנטיטאַטיווע טרייט לאָקוס Fnl7.1 ענקאָודאַז אַ שפּעט עמבריאָגענעסיס שעפעדיק פּראָטעין פֿאַרבונדן מיט פרוכט האַלדז לענג אין וגערקע
ארויס: פּלאַנט ביאָטעטשנאָלאָגי זשורנאַל, 2020
סיקוואַנסינג סטראַטעגיע:
עלטערן (Jin5-508, YN): גאַנץ גענאָמע ריסעקווענסינג פֿאַר 34 × און 20 ×.
דנאַ פּאָאָלס (50 לאַנג-האַלדז און 50 קורץ-האַלדז): רעסעקווענסינג פֿאַר 61 × און 52 ×
שליסל רעזולטאַטן
אין דעם לערנען, סעגרעגאַטינג באַפעלקערונג (F2 און F2:3) איז דזשענערייטאַד דורך אַריבער די לאַנג-האַלדז וגערקע שורה Jin5-508 און קורץ-האַלדז YN.צוויי דנאַ פּאָאָלס זענען קאַנסטראַקטאַד דורך 50 עקסטרעם לאַנג-האַלדז מענטשן און 50 עקסטרעם קורץ-האַלדז מענטשן.הויפּט-ווירקונג QTL איז יידענאַפייד אויף Chr07 דורך BSA אַנאַליסיס און טראדיציאנעלן QTL מאַפּינג.דער קאַנדידאַט געגנט איז געווען ווייַטער נעראָוד דורך פייַן-מאַפּינג, דזשין אויסדרוק קוואַנטאַפאַקיישאַן און טראַנסגעניק יקספּעראַמאַנץ, וואָס אנטפלעקט שליסל דזשין אין קאַנטראָולינג האַלדז-לענג, CsFnl7.1.אין אַדישאַן, פּאָלימאָרפיסם אין CsFnl7.1 פּראָמאָטער געגנט איז געווען פארבונדן מיט קאָראַספּאַנדינג אויסדרוק.ווייַטער פילאָגענעטיק אַנאַליסיס סאַגדזשעסטיד אַז Fnl7.1 לאָקוס איז זייער מסתּמא צו זיין ערידזשאַנייטאַד פון ינדיאַ.
 QTL-מאַפּינג אין BSA אַנאַליסיס צו ידענטיפיצירן קאַנדידאַט געגנט פֿאַרבונדן מיט וגערקע האַלדז לענג |  LOD פּראָופיילז פון וגערקע האַלדז-לענג QTL יידענאַפייד אויף Chr07 |
זו, X., עט על."די הויפּט-ווירקונג קוואַנטיטאַטיווע טרייט לאָקוס Fnl7.1 ענקאָודאַז אַ שפּעט עמבריאָגענעסיס שעפעדיק פּראָטעין פֿאַרבונדן מיט פרוכט האַלדז לענג אין וגערקע."פּלאַנט ביאָטעטשנאָלאָגי זשורנאַל 18.7 (2020).
