פּראָדוקטן

*דעמאָ רעזולטאַטן געוויזן דאָ זענען אַלע פֿון גענאָמעס ארויס מיט Biomarker Technologies

1.LTR אַרייַנלייגן צייט אָפּשאַצונג: די פיגור געוויזן אַ יינציק ביימאָדאַל פאַרשפּרייטונג אין LTR-RTs ינסערשאַן צייט אין וויינינג קאָרן גענאָמע, קאַמפּערד מיט אנדערע מינים.די לעצטע שפּיץ איז געווען אַרום 0.5 מיליאָן יאר צוריק.

לי גואַנג עט על.,נאַטור גענעטיקס, 2021

2. פילאָגעני און דזשין משפּחה אַנאַליסיס אויף טשאַיאָטע (Sechium edule): דורך אַנאַלייזינג טשאַיאָטע און די אנדערע 13 פֿאַרבונדענע מינים אין דזשין משפּחה, Chayote איז געפונען צו זיין מערסט ענג שייַכות מיט שלאַנג גאָרד (Trichosanthes anguina).טשאַיאָטע דערייווד פון שלאַנג גאָרד אין אַרום 27-45 מיאַ און גאַנץ גענאָמע דופּליקאַטיאָן (WGD) איז באמערקט אין טשאַיאָטע אין 25±4 מיאַ, וואָס איז די דריט ווגד געשעעניש אין cucuibitaceae.

פו א עט על.,כאָרטיקאַלטשער פאָרשונג, 2021

3. סינטעני אַנאַליסיס: עטלעכע גענעס שייַכות צו פיטאָהאָרמאָונז אין פרוכט אַנטוויקלונג זענען געפונען אין טשאַיאָטע, שלאַנג גאָרד און קאַבאַק.די קאָראַליישאַן צווישן טשאַיאָטע און קאַבאַק איז אַ ביסל העכער ווי צווישן טשאַיאָטע און שלאַנג גאָרד.

פו א עט על.,כאָרטיקאַלטשער פאָרשונג, 2021

4.גענע משפּחה אַנאַליסיס: KEGG ענריטשמענט אויף דזשין משפּחה יקספּאַנשאַן און צונויפצי אין G.thurberi און G.davidsonii גענאָמעס געוויזן אַז סטערויד ביאָסינטהעסיס און בראַססינאָסטערויד ביאָסינטהעסיס פֿאַרבונדענע גענעס זענען יקספּאַנדיד.

יאַנג ז עט על.,BMC ביאָלאָגי, 2021

5. גאַנץ גענאָמע דופּליקאַטיאָן אַנאַליסיס: 4DTV און Ks פאַרשפּרייטונג אַנאַליסיס געוויזן גאַנץ גענאָמע דופּליקאַטיאָן געשעעניש.פּיקס פון ינטראַספּעסיעס געוויזן דופּליקאַטיאָן געשעענישן.פּיקס פון ינטערספּעסיעס געוויזן ספּעסיפיקאַטיאָן געשעענישן.די אַנאַליסיס האט אנגעוויזן אַז קאַמפּערד מיט די אנדערע דריי ענג פֿאַרבונדענע מינים, אָ europaea איז לעצטנס דורכגעגאנגען דורך אַ גרויס וואָג דזשין דופּליקיישאַן.

ראַו ג עט על.,כאָרטיקאַלטשער פאָרשונג, 2021

BMK קאַסע

רויז אָן פּיצל: גענאָמיק ינסייץ לינגקט צו נעץ אַדאַפּטיישאַן

ארויס: נאַשאַנאַל וויסנשאַפֿט איבערבליק, 2021

סיקוואַנסינג סטראַטעגיע:

בייסיעטאָרןלעסס' (ר.וויטשוראַינאַן) גענאָמע:
בעערעך.93 X PacBio + אַפּפּראָקס.90 X Nanopore + 267 X Illumina

שליסל רעזולטאַטן

1. הויך קוואַליטעט ר.וויטשוראַיאַנאַ גענאָמע איז קאַנסטראַקטאַד ניצן לאַנג-לייענען סיקוואַנסינג טעקניקס, וואָס טראָגן אַ פֿאַרזאַמלונג פון 530.07 מב (עסטימאַטעד גענאָמע גרייס איז געווען בעערעך 525.9 מב דורך לויפן סיטאָמעטרי און 525.5 דורך גענאָמע יבערבליק; העטעראָזיגאָסיטי איז געווען אַרום 1.03%).BUSCO עסטימאַטעד כעזשבן איז געווען 93.9%.אין פאַרגלייַך מיט "אַלט רייטלענ" (האַפּלאָאָב), די קוואַליטעט און קאַמפּליטנאַס פון דעם גענאָמע איז באשטעטיקט דורך די באַזע אַקיעראַסי פון איין באַזע און LTR פֿאַרזאַמלונג אינדעקס (LAI = 20.03).R.wichuriana גענאָמע כּולל 32,674 פּראָטעין קאָודינג גענעס.

2.מולטי-אָמיקס שלאָס אַנאַליסיס, קאַנסיסטינג פון קאָמפּאַראַטיווע גענאָמיקס, טראַנסקריפּטאָמיקס, קטל אַנאַליסיס פון גענעטיק באַפעלקערונג, אנטפלעקט די קריטיש ספּעסיפיקאַטיאָן צווישן R. wichuraiana און Rosa chinensis.אויך, די ווערייישאַן פון פֿאַרבונדענע גענעס אין QTL איז מסתּמא צו זיין פארבונדן מיט סטעם שטעכיק מוסטערונג.

קאָמפּאַראַטיווע גענאָמיקס אַנאַליסיס צווישן Basye's Thornless און Rosa chinensis אַרייַנגערעכנט סינטעני אַנאַליסיס, דזשין משפּחה קנויל, יקספּאַנשאַן און צונויפצי אַנאַליסיס, אנטפלעקט אַ גרויס נומער פון ווערייישאַנז, וואָס שייך צו קריטיש טרייץ אין רויזן.די יינציק יקספּאַנשאַן אין NAC און FAR1 / FRS דזשין משפּחה איז געווען זייער מסתּמא צו זיין פארבונדן מיט קעגנשטעל צו שוואַרץ אָרט.

זשאָנג, עם, עט על."רויז אָן פּיצל: גענאָמיק ינסייץ לינגקט צו נעץ אַדאַפּטיישאַן"נאַשאַנאַל וויסנשאַפֿט איבערבליק, 2021;, נוואַב092.