עוואָלוציאָנערע גענעטיק
סערוויס מעלות
טאַקאַגי און אַנדערע,דער פלאַנצן זשורנאַל, 2013
●קאָמפּרעהענסיוו ביאָאינפאָרמאַטיש אַנאַליז:ערמעגליכן די שאצונג פון גענעטישע דייווערסיטי, וואס שפיגלט אפ דעם עוואלוציאנערן פאטענציאל פון מינים, און אנטפלעקט א פארלעסלעכע פילאגענעטישע באציאונג צווישן מינים מיט מינימיזירטן איינפלוס פון קאנווערגענטער עוואלוציע און פאראלעלער עוואלוציע.
●אפציאָנעלע קאַסטאַמייזד אַנאַליז: ווי צום ביישפּיל די שאַצונג פון דיווערגענץ צייט און גיכקייט באַזירט אויף וועריאַציעס אויף נוקלעאָטיד און אַמינאָ זויערן מדרגה.
●ברייטע עקספּערטיז און פּובליקאַציע רעקאָרדסBMKGene האט אנגעזאמלט מאסיווע עקספיריענס אין פאפולאציע און עוואלוציאנערע גענעטיק פראיעקטן פאר איבער 15 יאר, באדעקט טויזנטער מינים, א.א.וו. און בייגעשטייערט צו איבער 1000 הויך-לעוועל פראיעקטן ארויסגעגעבן אין Nature Communications, Molecular Plants, Plant Biotechnology Journal, א.א.וו.
● העכסט קוואַליפֿיצירטע ביאָאינפאָרמאַטיק מאַנשאַפֿט און קורצע אַנאַליז ציקלמיט גרויס דערפאַרונג אין אַוואַנסירטע גענאָמיק אַנאַליז, גיט BMKGene'ס מאַנשאַפֿט קאָמפּרעהענסיוו אַנאַליזעס מיט אַ שנעלער טורנאַראַונד צייט.
● שטיצע נאָך פֿאַרקויף:אונדזער צוזאג גייט ווייטער ווי נאָר פּראָיעקט פֿאַרענדיקונג, מיט אַ 3-חודש נאָך-פֿאַרקויף סערוויס פּעריאָד. בעת דעם צייט, פאָרשלאָגן מיר פּראָיעקט נאָכפֿאָלגן, הילף מיט פּראָבלעם לייזונג, און פֿראַגע-און-ענטפֿער סעסיעס צו אַדרעסירן יעדע פֿראַגע וואָס איז פֿאַרבונדן מיט די רעזולטאַטן.
סערוויס ספּעציפֿיקאַציעס און רעקווייערמענץ
| טיפ פון סיקווענסינג | רעקאָמענדירטע באַפעלקערונג וואָג | סיקווענסינג סטראַטעגיע | נוקלעאָטיד רעקווייערמענץ |
| גאַנצע גענאָם סיקווענסינג | ≥ 30 יחידים, מיט ≥ 10 יחידים פון יעדער סובגרופּע
| 10 מאָל | קאָנצענטראַציע: ≥ 1 נ״ג/µל גאַנץ סומע ≥ 30נג לימיטירטע אדער קיין דעגראַדאַציע אדער קאַנטאַמאַניישאַן |
| ספּעציפֿיש-לאָקוס אַמפּלאַפייד פראַגמענט (SLAF) | טאַג טיפקייט: 10 מאָל נומער פון טאַגס: <400 מעגאבייט: WGS איז רעקאמענדירט <1 גיגאבייט: 100 טויזנט טאַגס 1 גיגאבייט >2 גיגאבייט: 300K טאַגס מאַקס 500k טאַגס | קאָנצענטראַציע ≥ 5 נ״ג/µל גאַנץ סומע ≥ 80 נ״ג נאַנאָדראָפּ OD260/280=1.6-2.5 אַגאַראָז געל: קיין אָדער באַגרענעצטע דעגראַדאַציע אָדער קאַנטאַמאַניישאַן
|
סערוויס ארבעט פלוס
עקספּערימענט פּלאַן
מוסטער ליפערונג
ביבליאָטעק קאַנסטרוקציע
סיקווענסינג
דאַטן אַנאַליז
נאך-פארקויף סערוויסעס
די סערוויס נעמט אריין אנאליז פון באפעלקערונג סטרוקטור (פילאגענעטישער בוים, PCA, באפעלקערונג סטראטיפיקאציע טשאַרט), באפעלקערונג דייווערסיטי, און באפעלקערונג סעלעקציע (לינקידזש דיסעקוויליבריום, סעלעקטיוו סוויפּ-סעלעקציע פון אַדוואַנטיידזשאַס זייטלעך). די סערוויס קען אויך אַרייַננעמען קאַסטאַמייזד אנאליז (למשל דיווערדזשענס צייט, דזשין פלאָו).
*דעמאָ רעזולטאַטן וואָס ווערן דאָ געוויזן זענען אַלע פֿון גענאָמען פֿאַרעפֿנטלעכט מיט BMKGENE
1. עוואָלוציע אַנאַליז אנטהאלט קאנסטרוקציע פון פילאָגענעטישן בוים, פּאָפּולאַציע סטרוקטור און PCA באַזירט אויף גענעטישע וואַריאַציעס.
פילאָגענעטישער בוים רעפּרעזענטירט טאַקסאָנאָמישע און עוואָלוציאָנערע באַציִונגען צווישן מינים מיט אַ געמיינזאַמען אָוועס.
PCA האט ציל צו וויזואַליזירן נאָענטקייט צווישן סוב-פּאָפּולאַציעס.
באַפעלקערונג סטרוקטור ווײַזט די אנוועזנהייט פון גענעטיש באַזונדערע סוב-באַפעלקערונג אין טערמינען פון אַלעל פרעקווענצן.
טשען, און אנדערע,פּי-ען-עס, 2020
2. סעלעקטיוו סוויפּ
סעלעקטיוו סוויפּ באַציט זיך צו אַ פּראָצעס דורך וועלכן אַ גינסטיגע פּלאַץ ווערט אויסגעקליבן און די אָפטקייטן פון פֿאַרבונדענע נייטראַלע זייטלעך ווערן געוואקסן און די פון נישט-פֿאַרבונדענע זייטלעך ווערן פֿאַרקלענערט, וואָס רעזולטירט אין אַ רעדוקציע פון רעגיאָנאַלע.
גענאָם-ברייטע דעטעקציע אויף סעלעקטיווע סוויפּ געגנטן ווערט פּראַסעסט דורך קאַלקולירן פּאָפּולאַציע גענעטישער אינדעקס (π, Fst, טאַדזשימאַ'ס D) פון אַלע SNPs אין אַ גליטשנדיק פֿענצטער (100 Kb) ביי אַ געוויסן שריט (10 Kb).
נוקלעאָטיד דייווערסיטי (π)
טאַדזשימאַ'ס ד
פיקסאַציע אינדעקס (Fst)
וואו, און אנדערע,מאָלעקולאַרער פלאַנץ, 2018
3. גענע פלוס
וואו, און אנדערע,מאָלעקולאַרער פלאַנץ, 2018
4. דעמאגראפישע געשיכטע
זשאַנג, און אַנדערע,נאַטור עקאָלאָגיע און עוואָלוציע, 2021
5. דיווערדזשענס צייט
זשאַנג, און אַנדערע,נאַטור עקאָלאָגיע און עוואָלוציע, 2021
אויספאָרשן די פֿאָרשריטן וואָס זענען געוואָרן ערמעגליכט דורך BMKGene'ס עוואָלוציאָנערע גענעטיק סערוויסעס דורך אַ קוראַטירטע זאַמלונג פֿון פּובליקאַציעס:
האַסאַניאַר, AK און אַנדערע (2023) 'אנטדעקונג פון SNP מאָלעקולאַרע מאַרקערס און קאַנדידאַט גענעס פֿאַרבונדן מיט סאַקברויד ווירוס קעגנשטעל אין Apis cerana cerana לאַרוואַע דורך גאַנץ-גענאָם ריסיקווענסינג',אינטערנאציאנאלער זשורנאַל פון מאָלעקולאַרע וויסנשאַפֿטן, 24 (7). דאָי: 10.3390/IJMS24076238.
טשיי, דזש. און אנדערע (2022) 'די אויפדעקונג פון א ווילדן, גענעטיש ריין כינעזישן ריזן-סאַלאַמאַנדער שאַפט נייע קאָנסערוואַציע-מעגלעכקייטן',זאָאָלאָגישע פאָרשונג, 2022, באַנד 43, אויסגאַבע 3, בלעטער: 469-480, 43(3), זז. 469–480. doi: 10.24272/J.ISSN.2095-8137.2022.101.
האַן, מ. און אַנדערע (2022) 'פילאָגעאָגראַפֿישער מוסטער און באַפֿעלקערונג עוואָלוציע געשיכטע פֿון אינדיגענער Elymus sibiricus L. אויף טשינגהאַי-טיבעטישער פּלאַטאָ',גרענעצן אין פלאַנצן וויסנשאַפֿט, 13, ז. 882601. דוי: 10.3389/FPLS.2022.882601/BIBTEX.
וואַנג, דזש. און אַנדערע (2022) 'גענאָמישע איינזיכטן אין לאָנגאַן עוואָלוציע פֿון אַ כראָמאָסאָם-לעוועל גענאָם פֿאַרזאַמלונג און פּאָפּולאַציע גענאָמיק פֿון לאָנגאַן אַקסעסיעס',גאָרטנצוכט פאָרשונג, 9. דוי: 10.1093/HR/UHAC021.
