גענאָם-ברייטע פֿאַראייניקונג אַנאַליז
אַרבעטספֿלוס
סערוויס מעלות
●ברייטע עקספּערטיז און פּובליקאַציע רעקאָרדסמיט אנגעזאמלטער עקספּעריענץ אין GWAS, האט BMKGene פארענדיקט הונדערטער מינים פראיעקטן אין באפעלקערונג GWAS פאָרשונג, געהאלפן פארשער צו ארויסגעבן מער ווי 100 ארטיקלען, און דער קומולאַטיווער אימפּאַקט פאַקטאָר האט דערגרייכט 500.
● קאָמפּרעהענסיווע ביאָאינפאָרמאַטיק אַנאַליז: וואָרקפלאָו כולל SNP-טרייט פֿאַראייניקונג אַנאַליז, צושטעלנדיק אַ סכום פון קאַנדידאַט גענעס און זייער קאָראַספּאַנדינג פאַנגקשאַנאַל אַנאָטאַציע.
●העכסט קוואַליפֿיצירטע ביאָאינפאָרמאַטיק מאַנשאַפֿט און קורצע אַנאַליז ציקלמיט גרויס דערפאַרונג אין אַוואַנסירטע גענאָמיק אַנאַליז, גיט BMKGene'ס מאַנשאַפֿט קאָמפּרעהענסיוו אַנאַליזעס מיט אַ שנעלער טורנאַראַונד צייט.
●נאָך-פאַרקויף שטיצע:אונדזער צוזאג גייט ווייטער ווי נאָר פּראָיעקט פֿאַרענדיקונג, מיט אַ 3-חודש נאָך-פֿאַרקויף סערוויס פּעריאָד. בעת דעם צייט, פאָרשלאָגן מיר פּראָיעקט נאָכפֿאָלגן, הילף מיט פּראָבלעם לייזונג, און פֿראַגע-און-ענטפֿער סעסיעס צו אַדרעסירן יעדע פֿראַגע וואָס איז פֿאַרבונדן מיט די רעזולטאַטן.
סערוויס ספּעציפֿיקאַציעס און רעקווייערמענץ
| טיפ פון סיקווענסינג | רעקאָמענדירטע באַפעלקערונג וואָג | סיקווענסינג סטראַטעגיע | נוקלעאָטיד רעקווייערמענץ |
| גאַנצע גענאָם סיקווענסינג | 200 מוסטערן | 10 מאָל | קאָנצענטראַציע: ≥ 1 נ״ג/µל גאַנץ סומע ≥ 30נג לימיטירטע אדער קיין דעגראַדאַציע אדער קאַנטאַמאַניישאַן |
| ספּעציפֿיש-לאָקוס אַמפּלאַפייד פראַגמענט (SLAF) | טאַג טיפקייט: 10x נומער פון טאַגס: < 400 מעגאבייט: WGS איז רעקאמענדירט < 1 גיגאבייט: 100 טויזנט טאַגן 1 גיגאבייט > 2 גיגאבייט: 300K טאַגס מאַקס 500k טאַגס | קאָנצענטראַציע ≥ 5 נ״ג/µל גאַנץ סומע ≥ 80 נ״ג נאַנאָדראָפּ OD260/280=1.6-2.5 אַגאַראָז געל: קיין אָדער באַגרענעצטע דעגראַדאַציע אָדער קאַנטאַמאַניישאַן
|
מאַטעריאַל אויסוואַל
פֿאַרשידענע ווערייאַטיז, אונטערספּעסיעס, לאַנדראַסעס/גענעבאַנקן/געמישטע משפּחות/ווילדע רעסורסן
פֿאַרשידענע ווערייאַטיז, אונטערספּעסיעס, לאַנדראַסעס
האַלב-געשוויסטער משפּחה/פול-געשוויסטער משפּחה/ווילדע רעסורסן
סערוויס ארבעט פלוס
עקספּערימענט פּלאַן
מוסטער ליפערונג
רנאַ עקסטראַקציע
ביבליאָטעק קאַנסטרוקציע
סיקווענסינג
דאַטן אַנאַליז
נאך-פארקויף סערוויסעס
כולל די פאלגענדע אנאליז:
- גענאָם-ברייטע פֿאַראייניקונג אַנאַליז: LM, LMM, EMMAX, FASTLMM מאָדעל
- פונקציאָנעלע אַנאָטאַציע פון קאַנדידאַט גענעס
SNP-טרייט אסאסיאציע אנאליז – מאנהעטן פלאט
SNP-טרייט פֿאַראייניקונג אַנאַליז – QQ פּלאָט
אויספאָרשן די פֿאָרשריטן וואָס זענען געוואָרן ערמעגליכט דורך BMKGene'ס de GWAS סערוויסעס דורך אַ קוראַטירטע זאַמלונג פֿון פּובליקאַציעס:
לו, ל. און אנדערע (2023) 'איינבליק אין די גענעטישע באזע פון אַמאָניאַק טאָלעראַנץ אין ראַזער קלאַם סינאָנאָוואַקולאַ קאָנסטריקטאַ דורך גענאָם-ברייט אַסאָוסייישאַן שטודיע',אַקוואַקולטור, 569, ז. 739351. דוי: 10.1016/דזש.אַקוואַקולטורע.2023.739351.
לי, קס. און אנדערע (2022) 'מולטי-אמיקס אנאליזן פון 398 פוקס-טייל הירזש אַקסעסיעס אַנטפּלעקן גענאָמישע געגנטן פארבונדן מיט דאָמעסטיקאַציע, מעטאַבאָליט טרייץ, און אַנטי-ינפלאַמאַטאָרישע ווירקונגען',מאָלעקולאַרער פלאַנץ, 15 (8), זז 1367-1383. דאָי: 10.1016/דזש.מאָלפּ.2022.07.003.
לי, דזש. און אנדערע (2022) 'גענאָם-ברייטע פֿאַראייניקונג מאַפּינג פֿון הוללעס קוים פֿענאָטיפּן אין טריקעניש סביבה',גרענעצן אין פלאַנצן וויסנשאַפֿט, 13, ז. 924892. דוי: 10.3389/FPLS.2022.924892/BIBTEX.
זשאַאָ, קס. און אַנדערע (2021) 'GmST1, וואָס קאָדירט אַ סולפאָטראַנספעראַזע, גיט קעגנשטעל צו סויבין מאָסאַיק ווירוס שטאַמען G2 און G3',פלאַנץ, צעל און סביבה, 44 (8), זז 2777-2792. דאָי: 10.1111/PCE.14066.
