לאַנגע נישט-קאָדירונג סיקווענסינג-ילומינאַ
סערוויס מעלות
●געמיינזאמע אנאליז פון mRNA און lncRNAדורך קאמבינירן די קוואַנטיפֿיקאַציע פֿון mRNA טראַנסקריפּטן מיט דער שטודיע פֿון lncRNA און זייערע צילן, איז מעגלעך צו באַקומען אַ טיפֿן איבערבליק פֿון דעם רעגולאַטאָרישן מעקאַניזם וואָס ליגט אונטער דער צעלולערער רעאַקציע.
●ברייטע עקספּערטיזמיר האָבן פּראַסעסט איבער 230,000 מוסטערן, וואָס דעקן פֿאַרשידענע מוסטער און פּראָיעקט צילן. מיר ברענגען דעם רייַכטום פון עקספּערטיז צו יעדן פּראָיעקט.
●געמיינזאמע אנאליז פון mRNA און lncRNAמיר קאָמבינירן די קוואַנטיפֿיקאַציע פֿון mRNA טראַנסקריפּטן מיט דער שטודיע פֿון lncRNA און זייערע צילן, מאַכנדיג עס מעגלעך צו באַקומען אַ טיפֿן איבערבליק פֿון דעם רעגולאַטאָרישן מעקאַניזם וואָס ליגט אונטער דער צעלולערער רעאַקציע.
●שטרענגע קוואַליטעט קאָנטראָלמיר אימפּלעמענטירן קערן קאָנטראָל פּונקטן איבער אַלע סטאַגעס, פֿון מוסטער צוגרייטונג ביז ביבליאָטעק צוגרייטונג, סיקווענסינג און ביאָאינפֿאָרמאַטיק. אונדזער קערפֿול מאָניטאָרינג גאַראַנטירט די צושטעל פֿון קאָנסיסטענט הויך-קוואַליטעט רעזולטאַטן.
●קאָמפּרעהענסיוו אַנאָטאַציעמיר ניצן קייפל דאַטאַבייסעס צו פונקציאָנעל אַנאָטירן די דיפערענציעל אויסגעדריקטע גענעס (DEGs) און דורכפירן קאָרעספּאָנדירנדיקע ענריטשמענט אַנאַליזעס. די קאָמפּרעהענסיווע צוגאַנג גיט איינבליקן אין די צעלולאַרע און מאָלעקולאַרע פּראָצעסן וואָס ליגן אונטער דער טראַנסקריפּטאָם רעאַקציע, און זיכערט אַז איר באַקומט אַלע מעגלעכע אינפֿאָרמאַציע וועגן די דאַטן פון אייער עקספּערימענט.
●נאָך-פאַרקויף שטיצעמיר פֿאַרשטייען ווי וויכטיק עס איז צו זײַן אנוועזנד, דעריבער גייט אונדזער פֿאַרפֿליכטונג ווײַטער ווי נאָר די פֿאַרענדיקונג פֿון פּראָיעקטן, מיט אַ 3-חודשיקן נאָך-פֿאַרקויף סערוויס פּעריאָד. בעת דעם צײַט, אָפֿערן מיר פּראָיעקט נאָכפֿאָלגן, הילף מיט פּראָבלעם-לייזונג, און פֿראַגע-און-ענטפֿער סעסיעס צו אַדרעסירן יעדע פֿראַגע וואָס איז פֿאַרבונדן מיט די רעזולטאַטן.
מוסטער רעקווייערמענץ און ליפערונג
| ביבליאָטעק | פּלאַטפאָרמע | רעקאָמענדירטע דאַטן | דאַטן QC |
| rRNA אויסגעשעפּט ריכטונגס-ביבליאָטעק | אילומינאַ PE150 | 10-16 גיגאבייט | ק30≥85% |
נוקלעאָטידן:
| קאָנצ. (נג/μל) | סומע (μg) | ריינקייט | אָרנטלעכקייט |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 באגרענעצטע אדער קיין פּראָטעין אדער דנאַ קאַנטאַמאַניישאַן געוויזן אויף געל. | רין ≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; לימיטעד אָדער קיין באַסעליין הייך |
● פלאַנצן:
וואָרצל, שטאַם אָדער בלעטל: 450 מג
בלאַט אָדער זוימען: 300 מג
פרוכט: 1.2 ג
● חיה:
האַרץ אָדער קישקע: 450 מג
אינעווייניג אדער מוח: 240 מג
מוסקל: 600 מג
ביינער, האָר אָדער הויט: 1.5 ג
● אַרטראָפּאָדן:
אינסעקטן: 9 ג
קראַסטאַסעאַ: 450 מג
● גאַנץ בלוט:2 רערן
● צעלן: 106 צעלן
● סערום און פּלאַזמע6 מל
רעקאָמענדירטע מוסטער ליפערונג
קאַנטיינער: 2 מל צענטריפוגע רער (בלויע פאָליע איז נישט רעקאָמענדירט)
מוסטער באצייכענונג: גרופּירן+רעפּליקאַטן למשל A1, A2, A3; B1, B2, B3.
שיפמענט:
1. טרוקן-אייז: מוסטערן דאַרפֿן זײַן פֿאַרפּאַקט אין זעקלעך און באַגראָבן אין טרוקן-אייז.
2. RNAstable טובעס: RNA מוסטערן קענען געטריקנט ווערן אין RNA סטאַביליזאַציע טוב (למשל RNAstable®) און געשיקט ווערן ביי צימער טעמפּעראַטור.
סערוויס ארבעט פלוס
עקספּערימענט פּלאַן
מוסטער ליפערונג
רנאַ עקסטראַקציע
ביבליאָטעק קאַנסטרוקציע
סיקווענסינג
דאַטן אַנאַליז
נאך-פארקויף סערוויסעס
ביאָאינפאָרמאַטיק
- רויע דאַטן
- דאַטן QC
- גענאָם אויסריכטונג
- גענע סטרוקטור (אַלטערנאַטיווע ספּלייסינג, גענע סטרוקטור אָפּטימיזאַציע און ראָמאַן גענע פאָרויסזאָגן)
- גענע אויסדרוק קוואַנטיפיקאַציע
- דיפערענציעלע אויסדרוק אנאליז
- DEG אַנאָטאַציע און ענריטשמענט + דיפערענציעל אויסגעדריקט lncRNA ציל גענעס
- טראַנסקריפּט אידענטיפיקאציע
- lncRNA אידענטיפיקאציע (lncRNA קאנסערוואציע און באקאנטע lncRNA)
- lncRNA ציל גענעס פּראָגנאָז
- lncRNA אויסדרוק קוואַנטיפיקאַציע
- געמיינזאמע אנאליז מיט mRNA דאטן
דיפערענציעלע גענע אויסדרוק (DEGs) אנאליז
קוואַנטיפיקאַציע פון lncRNA אויסדרוק – קלאַסטערינג
באַרייַכערונג פון lncRNA ציל גענעס
געמיינזאמע mRNA און lncRNA פאזיציע אנאליז – סירקאס פלאט (מיטלער קרייז איז mRNA און אינערער קרייז איז lncRNA)
אויספאָרשן די פֿאָרשריטן וואָס זענען געוואָרן ערמעגליכט דורך BMKGene'ס lncRNA סיקוואַנסינג סערוויסעס דורך אַ קוראַטירטע זאַמלונג פֿון פּובליקאַציעס.
דזשי, ה. און אנדערע (2020) 'אידענטיפיצירן, פונקציאָנעלע פאָרויסזאָגן, און שליסל lncRNA וועריפיקאַציע פון קאַלט דרוק-פֿאַרבונדענע lncRNAs אין ראַץ לעבער',וויסנשאפטלעכע באריכטן2020 10:1, 10(1), זז. 1–14. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.
דזשיאַ, ז. און אַנדערע (2021) 'אינטעגראַטיווע טראַנסקריפּטאָמישע אַנאַליז אַנטפּלעקט דעם אימונעם מעханіזם פֿאַר אַ CyHV-3-רעזיסטענטן געוויינטלעכן קאַרפּ שטאַם',גרענעצן אין אימונאָלאָגיע, 12 , ז . 687151. דאָי: 10.3389/פיממו.2021.687151/ביבטעקס.
וואַנג, XJ און אַנדערע (2022) 'מולטי-אָמיקס אינטעגראַציע-באַזירטע פּריאָריטיזאַציע פון קאָנקורירנדיקע ענדאָגענאָוס RNA רעגולאַציע נעטוואָרקס אין קליין צעל לונג ראַק: מאָלעקולאַר קעראַקטעריסטיקס און מעדיצין קאַנדידאַטן',גרענעצן אין אָנקאָלאָגיע, 12 , ז . 904865. דאָי: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
קסיאַאָ, ל. און אַנדערע (2020) 'גענעטישע דיסעקציע פון די גענע קאָ-עקספּרעסיע נעץ וואָס ליגט אונטער פאָטאָסינטעז אין פּאָפּולוס',פלאַנצן ביאָטעכנאָלאָגיע זשורנאַל, 18(4), זז. 1015–1026. doi: 10.1111/PBI.13270.
זשענג, ה. און אנדערע (2022) 'א גלאבאלע רעגולאטורישע נעץ פאר דיסרעגולירטע גענע אויסדרוק און אבנארמאלע מעטאבאלישע סיגנאלירונג אין אימונע צעלן אין דער מיקרא-סביבה פון גרייווס'ס קרענק און האשימאטא'ס טיירוידיטיס',גרענעצן אין אימונאָלאָגיע, 13 , ז . 879824. דאָי: 10.3389/פיממו.2022.879824/ביבטעקס.
