מעטאַטראַנסקריפּטאָם סיקוואַנסינג
סערוויס פֿעיִקייטן
● ררנאַ דיפּלישאַן נאכגעגאנגען דורך דירעקטיאָנאַל מרנאַ ביבליאָטעק צוגרייטונג.
● סיקוואַנסינג אויף Illumina NovaSeq.
סערוויס אַדוואַנטאַגעס
●לערנען די ענדערונגען פון קאָמפּלעקס מיקראָביאַל קהילות:דאָס כאַפּאַנז אויף די טראַנסקריפּטיאָנאַל מדרגה און ויספאָרשן פּאָטענציעל נייַע גענעס.
●דערקלערן מיקראָביאַל קאַמיוניטי ינטעראַקשאַנז מיט דער באַלעבאָס אָדער סוויווע.
●פולשטענדיק ביאָינפאָרמאַטיק אַנאַליסיס: דאָס גיט ינסייץ אויף קהל טאַקסאָנאָמיק און פאַנגקשאַנאַל חיבורים, ווי געזונט ווי דיפערענטשאַל דזשין אויסדרוק אַנאַליסיס.
●ברייט גענע אַנאַטיישאַן:ניצן אַרויף-צו-טאָג דזשין פונקציאָנירן דאַטאַבייסיז פֿאַר ינפאָרמאַטיוו דזשין אויסדרוק אינפֿאָרמאַציע פון מייקראָוביאַל קהילות.
●פּאָסטן-סאַלעס שטיצן:אונדזער היסכייַוועס יקסטענדז ווייַטער פון פּרויעקט קאַמפּלישאַן מיט אַ 3-חודש נאָך-פאַרקויף דינסט צייַט. בעשאַס דעם צייט, מיר פאָרשלאָגן פּרויעקט נאָכגיין-אַרויף, טראָובלעשאָאָטינג הילף און ק & א סעשאַנז צו אַדרעס קיין פֿראגן שייַכות צו די רעזולטאַטן.
סערוויס ספּעסאַפאַקיישאַנז
| סיקוואַנסינג פּלאַטפאָרמע | סיקוואַנסינג סטראַטעגיע | דאַטן רעקאַמענדיד | דאַטאַ קוואַליטי קאָנטראָל |
| Illumina NovaSeq | PE150 | 12 גב | Q30≥85% |
מוסטער רעקווירעמענץ
| קאַנסאַנטריישאַן (נג / μ ל) | גאַנץ סומע (µg) | באַנד (µL) | OD260/280 | OD260/230 | RIN |
| ≥50 | ≥1.0 | ≥20 | 1.8-2.0 | 1.0-2.5 | ≥6.5 |
סערוויס אַרבעט לויפן
מוסטער עקספּרעס
ביבליאָטעק קאַנסטראַקשאַן
סיקוואַנסינג
דאַטאַ אַנאַליסיס
נאָך-פאַרקויף באַדינונגען
כולל די פאלגענדע אַנאַליסיס:
● סיקוואַנסינג דאַטאַ קוואַליטי קאָנטראָל
● טראַנסקריפּט אַסעמבלי
● טאַקסאָנאָמיק אַנאַטיישאַן און שעפע
● פאַנגקשאַנאַל אַנאַטיישאַן און שעפע
● עקספּרעססיאָן קוואַנטיפיקאַטיאָן און דיפפערענטשאַל אַנאַליסיס
טאַקסאָנאָמיק פאַרשפּרייטונג פון יעדער מוסטער:
ביתא דייווערסיטי אַנאַליסיס: UPGMA
פאַנגקשאַנאַל אַנאָטאַציע - גיין שעפע
דיפערענטשאַל טאַקסאָנאָמיע זעט - LEFSE
ויספאָרשן די אַדוואַנטידזשיז פאַסילאַטייטיד דורך BMKGene ס מעטאַ טראַנסקריפּטאָמיקס סיקוואַנסינג באַדינונגס דורך אַ קוראַטעד זאַמלונג פון אויסגאבעס.
לו, ז עט על. (2023) 'זויער טאָלעראַנץ פון לאַקטייט-ניצן באַקטיריאַ פון די סדר Bacteroidales קאַנטריביוץ צו פאַרהיטונג פון רומינאַל אַסידאָסיס אין גאָוץ צוגעפאסט צו אַ הויך-קאַנסאַנטרייט דיעטע',כייַע דערנערונג, 14 , זז׳ 130—140 . דאָי: 10.1016/דזש.אַנינו.2023.05.006.
ליד, ז עט על. (2017) 'אַנראַוואַלינג האַרץ פאַנגקשאַנאַל מיקראָביאָטאַ אין בעקאַבאָלעדיק האַרט-שטאַט פערמאַנטיישאַן דורך הויך-טראַפּוט אַמפּליקאָנס און מעטאַטראַנסקריפּטאָמיקס סיקוואַנסינג',פראָנטיערס אין מיקראָביאָלאָגי, 8 (יולי). דאָי: 10.3389/FMICB.2017.01294/פול.
וואַנג, וו. עט על. (2022) 'ראָמאַן מיקאָווירוס דיסקאַווערד פֿון אַ מעטאַטראַנסקריפּטאָמיקס יבערבליק פון די פיטאָפּאַטאַדזשעניק אַלטערנאַריאַ פונגוס',ווירוסעס, 14 (11), פּ. 2552. דאָי: 10.3390/V14112552/S1.
ווי, י עט על. (2022) 'פּאַראַלעל מעטאַטראַנסקריפּטאָם אַנאַליסיס ריווילז דערנידעריקונג פון פאַבריק צווייטיק מעטאַבאָליטעס דורך ביטאַלז און זייער קישקע סימביאַנץ',מאָלעקולאַר עקאָלאָגי, 31 (15), פּפּ. 3999-4016. דאָי: 10.1111/מעק.16557.
