BMKCloud Log in
条形banner-03

פּראָדוקטן

פּלאַנט / כייַע גאַנץ גענאָמע סיקוואַנסינג

גאַנץ גענאָמע שייַעך-סיקוואַנסינג, אויך באקאנט ווי WGS, ינייבאַלז די ריווילינג פון ביידע פּראָסט און זעלטן מיוטיישאַנז אויף די גאנצע גענאָמע אַרייַנגערעכנט סינגלע נוקלעאָטידע פּאָלימאָרפיסם (SNP), ינסערשאַן דילישאַן (InDel), סטרוקטור ווערייישאַן (SV), און קאָפּיע נומער ווערייישאַן (CNV) ).SVs מאַכן אַ גרעסערע טייל פון די ווערייישאַן באַזע ווי SNPs און האָבן אַ גרעסערע פּראַל אויף די גענאָמע, וואָס האט אַ באַטייטיק ווירקונג אויף לעבעדיק אָרגאַניזאַמז.לאנג-לייענען ריסעקווענסינג אַלאַוז מער גענוי לעגיטימאַציע פון ​​גרויס פראַגמאַנץ און קאָמפּליצירט ווערייישאַנז ווייַל לאַנג לייענען מאַכן עס פיל גרינגער צו כראָמאָסאָמאַל אַריבער קאָמפּליצירט מקומות אַזאַ ווי טאַנדאַם ריפּיץ, GC / AT-רייַך מקומות און כייפּער-ווייאַבאַל מקומות.

פּלאַטפאָרמע: Illumina, PacBio, Nanopore


סערוויס דעטאַילס

דעמאָ רעזולטאַט

פעאַטורעד ויסגאַבע

1.סערוויס אַדוואַנטאַגעס

ברייט דערפאַרונג אין גענאָמע סיקוואַנסינג פֿאַר איבער 1000 מינים.

איבער 800 ארויס קאַסעס מיט אַ אַקיומיאַלאַטיוו פּראַל פאַקטאָר פון איבער 4000.

פולשטענדיק ביאָינפאָרמאַטיקס אַנאַליסיס אויף ווערייישאַן פאַך און פונקציע אַנאַליסיס.

2. סערוויס ספּעסאַפאַקיישאַנז

פּלאַטפאָרמע

ביבליאָטעק

רעקאַמענדיד סעק טיפקייַט

Illumina

PE 150

פֿאַר SNP, ינדעל רופן ≥ 10x

פֿאַר SV, CNY פאַך ≥ 30x

 

 

נאַנאָפּאָרע

 

8 קב

פֿאַר SV, CNY פאַך ≥ 20x

Pacbio

CCS

15 קב

פֿאַר SNP, InDel, SV, CNY פאַך ≥ 10x

3. מוסטער רעקווירעמענץ

פּלאַטפאָרמע

קאָנס.(נג/μL)

 

סומע (נג)

 

ריינקייַט

 

אַגאַראָסע געל

 

OD260/280

OD260/230

1. קלאָר הויפּט באַנד מיט קיין אָדער לימיטעדדערנידעריקונג באמערקט אויף געל.

2. קיין אָדער לימיטעד רנאַ אָדער פּראָטעין קאַנטאַמאַניישאַן

 

Illumina

≥1

≥30

 

-

-

נאַנאָפּאָרע

 

≥30

דעפּענדס אויף דאַטן טראָגן

10μג / צעל

1.7-2.2

≥1.5

Pacbio

CCS

≥50

1.7-2.2

1.8-2.5

4. ביאָינפאָרמאַטיאָן אַנאַליסיס

wps_doc_3

5. סערוויס אַרבעט לויפן

מוסטער עקספּרעס

מוסטער עקספּרעס

פּילאָט עקספּערימענט

דנאַ יקסטראַקשאַן

ביבליאָטעק צוגרייטונג

ביבליאָטעק קאַנסטראַקשאַן

סיקוואַנסינג

סיקוואַנסינג

דאַטאַ אַנאַליסיס

דאַטאַ אַנאַליסיס

数据上传-03

דאַטאַ עקספּרעס


  • פֿריִער:
  • ווייַטער:

  • 1) סטאַטיסטיק פון גענאָמע מאַפּינג

    טיש 1 סטאַטיסטיק פון מאַפּינג רעזולטאַט

    wps_doc_5

    פיגורע 1 פאַרשפּרייטונג פון אַרייַנלייגן גרייס און לייענט קאַווערידזש.

    wps_doc_14 wps_doc_6

     

    2) וואַריאַט דעטעקשאַן

    פיגורע 2 סטאַטיסטיק און אַנאַטיישאַן פון SNP / INDEL / SV צווישן סאַמפּאַלז

    wps_doc_7 wps_doc_8

     

    פיגורע 3 גענאָמע-ברייט פאַרשפּרייטונג פון וואַטיאַטיאָנס

    wps_doc_9

    3) פאַנגקשאַנאַל אַנאָטאַציע פון ​​ווערייישאַנז

    wps_doc_10 wps_doc_11 wps_doc_12

     

    2019

    נאַטור קאָמוניקאַציע

    ריסעקווענסינג פון גאַנץ דזשינאָום ריווילז די אָנהייב פון Brassica napus און גענעטיק לאָקי ינוואַלווד אין זיין פֿאַרבעסערונג

    2020

    PNAS

    די עוואָלוטיאָנאַרי אָנהייב און דאָמעסטיקאַטיאָן געשיכטע פון ​​גאָלדפיש (Carassius auratus)

    2021

    פּלאַנט ביאָטעטשנאָלאָגי זשורנאַל

    רעפערענץ גענאָמעס פון די צוויי קאַלטאַווייטאַד דזשוט מינים

    2021

    פּלאַנט ביאָטעטשנאָלאָגי זשורנאַל

    גענאָמיק סיגנאַטשערז פון גרינס און אָילסעעד אַללאָפּאָללאָיד בראַססיקאַ דזשונסעאַ און גענעטיק לאָקי קאַנטראָולינג די אַקיומיאַליישאַן פון גלוקאָסינאָלאַטעס

    2019

    מאָלעקולאַר פּלאַנט

    גאַנץ דזשינאָום רעסקווענסינג פון אַ וועלט-ברייט זאַמלונג פון רייפּסיד אַקסעססיאָנס ריווילז די גענעטיק יקער פון זייער עקאָטיפּע דיווערדזשאַנס

    2022

    כאָרטיקאַלטשער פאָרשונג

    גענאָמע-ברייט פאַרבאַנד אַנאַליסיס גיט מאָלעקולאַר ינסייץ אין די נאַטירלעך ווערייישאַן פון קאַווענע זוימען גרייס

    2021

    זשורנאַל פון עקספּערימענטאַל באָטאַני

    גענאָמע-ברייט פאַרבאַנד לערנען יידענאַפייד וועריאַנץ פון GhSAD1 קאַנפערינג קאַלט טאָלעראַנץ אין וואַטע

    2021

    זשורנאַל פון עקספּערימענטאַל באָטאַני

    גענאָמע-ברייט אַססאָסיאַטיאָן לערנען און טראַנסקריפּטאָמע פאַרגלייַך אַנטדעקן ראָמאַן QTL און קאַנדידאַט גענעס וואָס קאָנטראָלירן די גרייס פון די פּעטאַל אין רייפּסיד

    באַקומען אַ ציטירן

    שרייב דיין אָנזאָג דאָ און שיקן עס צו אונדז

    שיקן דיין אָנזאָג צו אונדז: