קליין רנאַ סיקוואַנסינג-יללומינאַ
איינריכטונגען
● גרייס סעלעקציע פון רנאַ פריערדיק צו ביבליאָטעק צוגרייטונג
● ביאָינפאָרמאַטיק אַנאַליסיס סענטערד אַרום מירנאַ פּראָגנאָז און זייער טאַרגאַץ
סערוויס אַדוואַנטאַגעס
●פולשטענדיק ביאָינפאָרמאַטיקס אַנאַליסיס:ענייבאַלינג די לעגיטימאַציע פון ביידע באַוווסט און ראָמאַן מירנאַס, לעגיטימאַציע פון מירנאַ טאַרגאַץ און קאָראַספּאַנדינג פאַנגקשאַנאַל אַנאָטיישאַן און ענריטשמענט מיט קייפל דאַטאַבייסיז (KEGG, GO)
●שטרענג קוואַליטי קאָנטראָל: מיר ינסטרומענט האַרץ קאָנטראָל פונקטן אין אַלע סטאַגעס, פֿון מוסטער און ביבליאָטעק צוגרייטונג צו סיקוואַנסינג און ביאָינפאָרמאַטיקס.דעם מאַטיקיאַלאַס מאָניטאָרינג ינשורז די עקספּרעס פון קאַנסיסטאַנטלי הויך-קוואַליטעט רעזולטאַטן.
●פּאָסטן-סאַלעס שטיצן: אונדזער היסכייַוועס יקסטענדז ווייַטער פון פּרויעקט קאַמפּלישאַן מיט אַ 3-חודש נאָך-פאַרקויף דינסט צייַט.בעשאַס דעם צייט, מיר פאָרשלאָגן פּרויעקט נאָכגיין-אַרויף, טראָובלעשאָאָטינג הילף און ק & א סעשאַנז צו אַדרעס קיין פֿראגן שייַכות צו די רעזולטאַטן.
●ברייט עקספּערטיז: מיט אַ שפּור רעקאָרד פון הצלחה קלאָוזינג איבער קייפל סרנאַ פּראַדזשעקס וואָס קאַווערינג איבער 100 מינים אין פאַרשידן פאָרשונג דאָומיינז, אונדזער מאַנשאַפֿט ברענגט אַ עשירות פון דערפאַרונג צו יעדער פּרויעקט.
מוסטער רעקווירעמענץ און עקספּרעס
| ביבליאָטעק | פּלאַטפאָרמע | רעקאַמענדיד דאַטן | Data QC |
| גרייס אויסגעקליבן | Illumina SE50 | 10M-20M לייענט | Q30≥85% |
מוסטער רעקווירעמענץ:
נוקלעאָטידע:
| קאָנס. (נג/μל) | סומע (μg) | ריינקייַט | אָרנטלעכקייַט |
| ≥ 80 | ≥ 0.5 | OD260/280=1.7-2.5 אָד260/230=0.5-2.5 לימיטעד אָדער קיין פּראָטעין אָדער דנאַ קאַנטאַמאַניישאַן געוויזן אויף געל. | RIN≥6.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; לימיטעד אָדער קיין באַסעלינע הייך |
● געוויקסן:
וואָרצל, סטעם אָדער פּעטאַל: 450 מג
בלאַט אָדער זוימען: 300 מג
פרוכט: 1.2 ג
● כייַע:
האַרץ אָדער קישקע: 450 מג
וויסעראַ אָדער מאַרך: 240 מג
מוסקל: 600 מג
ביינער, האָר אָדער הויט: 1.5 ג
● אַרטראַפּאָדס:
ינסעקץ: 9ג
קראַסטאַסיאַ: 450 מג
● גאַנץ בלוט: 2 טובז
● צעלן: 106 סעלז
● סערום און פּלאַזמע:6 מל
רעקאַמענדיד מוסטער עקספּרעס
קאנטעינער:
2 מל סענטריפודזש רער (צין שטער איז נישט רעקאַמענדיד)
מוסטער לייבלינג: גרופע + רעפּלאַקייט למשל A1, A2, A3;ב 1, ב 2, ב 3 ... ...
טראַנספּאָרט:
1.דריי-אייז: סאַמפּאַלז דאַרפֿן צו זיין פּאַקט אין באַגס און בעריד אין טרוקן-אייז.
2.RNAstable טובז: רנאַ סאַמפּאַלז קענען זיין דאַר אין רנאַ סטייבאַלאַזיישאַן רער (למשל רנאַסטאַבלע®) און שיפּט אין צימער טעמפּעראַטור.
סערוויס אַרבעט לויפן
עקספּערימענט פּלאַן
מוסטער עקספּרעס
רנאַ יקסטראַקשאַן
ביבליאָטעק קאַנסטראַקשאַן
סיקוואַנסינג
דאַטאַ אַנאַליסיס
נאָך-פאַרקויף באַדינונגען
ביאָינפאָרמאַטיקס
לעגיטימאַציע פון מירנאַ: סטרוקטור און טיפקייַט
דיפערענטשאַל אויסדרוק פון מירנאַ - כייעאַרטשיקאַל קלאַסטערינג
פאַנגקשאַנאַל אַנאַטיישאַן פון ציל פון דיפערענטשאַלי אויסגעדריקט מירנאַס
ויספאָרשן די פאָרשונג אַדוואַנטידזשיז פאַסילאַטייטיד דורך BMKGene 'sRNA סיקוואַנסינג באַדינונגס דורך אַ קוראַטעד זאַמלונג פון אויסגאבעס.
Chen, H. Et al.(2023) 'וויראַל ינפעקשאַנז ינכיבאַט סאַפּאָנין ביאָסינטהעסיס און פאָטאָסינטהעסיס אין פּאַנאַקס נאָטאָגינסענג', פּלאַנט פיזיאַלאַדזשי און ביאָטשעמיסטרי, 203, פּ.108038. דאָי: 10.1016/דזש.פּלאַפי.2023.108038.
לי, ה. עט על.(2023) 'די פאַבריק FYVE פעלד-מיט פּראָטעין FREE1 אַססאָסיאַטעס מיט מייקראָופּראַסעסער קאַמפּאָונאַנץ צו פאַרשטיקן מירנאַ ביאָגענעסיס', EMBO ריפּאָרץ, 24 (1).דאָי: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
יו, J. עט על.(2023) 'די מיקראָרנאַ Ame-Bantam-3p קאָנטראָלס לאַרוואַל פּופּאַל אנטוויקלונג דורך טאַרגאַטינג די קייפל עפּאַדערמאַל גראָוט פאַקטאָר-ווי דאָומיינז 8 גענע (megf8) אין די האָניקבעע, Apis mellifera', ינטערנאַטיאָנאַל דזשאָורנאַל פון מאָלעקולאַר ססיענסעס, 24 (6), פּ. .5726. דאָי: 10.3390/IJMS24065726/S1.
זשאַנג, עם עט על.(2018) 'ינאַגרייטיד אַנאַליסיס פון מירנאַ און גענעס פֿאַרבונדן מיט פלייש קוואַליטי ריווילז אַז Gga-MiR-140-5p אַפעקץ ינטראַמוסקולאַר פעט דעפּאַזישאַן אין טשיקאַנז', סעליאַלער פיזיאַלאַדזשי און ביאָטשעמיסטרי, 46 (6), פּפּ. 2421-2433.דאָי: 10.1159/000489649.
