BMKCloud Wọlé

Àwọn ọjà

Ìtẹ̀lé DNA/RNA – Ìtẹ̀lé Nanopore

Ìtẹ̀lé ONT jẹ́ ìmọ̀ ẹ̀rọ ìtẹ̀lé àmì itanna kan ṣoṣo tí a gbé kalẹ̀ lórí àwọn nanopores, ìlànà ìtẹ̀lé àmì kọ̀ọ̀kan jẹ́ bákan náà. DNA/RNA onípele méjì yóò so mọ́ amuaradagba nanoporous tí a fi sínú biofilm náà, tí yóò sì sinmi lábẹ́ ìdarí amuaradagba motor, lábẹ́ ìṣiṣẹ́ ìyàtọ̀ folti láti ẹ̀gbẹ́ méjèèjì ti biofilm náà, àwọn okùn DNA/RNA yóò kọjá nípasẹ̀ amuaradagba ikanni nanopore ní ìwọ̀n kan. Nítorí ìyàtọ̀ àwọn ohun-ìní kẹ́míkà ti àwọn ìpìlẹ̀ tó yàtọ̀ síra lórí okùn DNA/RNA, nígbà tí ìpìlẹ̀ kan tàbí molecule DNA kan bá kọjá nípasẹ̀ ikanni nanopore, yóò fa ìyípadà àwọn àmì iná mànàmáná tó yàtọ̀ síra. Nípa wíwá àti bá àwọn àmì wọ̀nyí mu, a lè ṣírò àwọn irú ìpìlẹ̀ tó báramu, a sì lè parí wíwá ìtẹ̀lé náà ní àkókò gidi.

Pe wa

Àwọn Àlàyé Iṣẹ́

Àbájáde Àfihàn

Àwọn Àlàyé Iṣẹ́ Àwọn Ẹ̀yà Ara

Pẹpẹ	Iwọn Ibi Ìkàwé	Ìmújáde Dátà Ìrònú (Fún Sẹ́ẹ̀lì kọ̀ọ̀kan)	Ìgbésẹ̀ ìpìlẹ̀ kan ṣoṣo	Àwọn ohun èlò ìlò
Nanopore	8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNA-PCR	70-90Gb/Sẹ́ẹ̀lì	85-92%	Ipe SV, De novo, Itẹlera gigun ni kikun, Iso-Seq, Àlàyé ìran, Ṣíṣàwárí methylation DNA

Àwọn Àǹfààní Iṣẹ́

● Ìrírí tó ju ọdún márùn-ún lọ lórí ìtàkùn ìtẹ̀lé PacBio pẹ̀lú ẹgbẹẹgbẹ̀rún àwọn iṣẹ́ tí a ti pa pẹ̀lú onírúurú irúgbìn.
● BMKGENE jẹ́ alábáṣiṣẹpọ̀ osise ti Oxford Nanopore, pẹ̀lú ìwé-ẹ̀rí RNA/DNA onípele méjì.
● Àwọn àpẹẹrẹ pàtàkì ti àwọn ẹ̀rọ ìṣàfihàn ìṣàfihàn pẹ̀lú ohun èlò pípé àti ìṣiṣẹ́ ìṣàfihàn tó tó wà.
● Láti orí pẹpẹ Nanopore, ó lé ní ìwádìí Denovo ẹranko àti ewéko mẹ́wàá tí a ti tẹ̀ jáde nínú àwọn ìwé ìròyìn olókìkí kárí ayé.

Awọn ibeere ayẹwo

Irú Àpẹẹrẹ

Iye owo

Ìfojúsùn (Qubit ®)

Iwọn didun

Ìwà mímọ́

Àwọn mìíràn

DNA Jiini

Dá lórí ìbéèrè Dátà

≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.2;

OD260/230≥1.5；

Òkè tó mọ́ kedere ní 260 nm, kò sí àbàwọ́n kankan

A gbọ́dọ̀ wọn ìfojúsùn nípa lílo Qubit àti Qubit/Nanopore ≤ 2

Àpapọ̀ RNA

≥1.2μg

≥100μg/μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.5;

OD260/230=0.5-2.5; kò sí àbàwọ́n kankan

Iye RIN ≥7.5

Ìṣàn Iṣẹ́ Iṣẹ́

Ìmúrasílẹ̀ àpẹẹrẹ

Ìkọ́lé ìkàwé

Ṣíṣe ìtẹ̀léra

Ìtúpalẹ̀ Dátà

Ifijiṣẹ ise agbese

Ti tẹlẹ: Awọn ile-ikawe ti a ti ṣe tẹlẹ ti Illumina

Itele: Ìtẹ̀léra Àwọn Ẹ̀yà Pàtàkì-Locus Amplified Fragment Sequencing (SLAF-Seq)

Ìṣàyẹ̀wò Dídára Dátà ti Àyẹ̀wò DNA

Táblì 1. Àwọn ìṣirò lórí dátà mímọ́.

BMKID	rawSeqNum	rawSumBase	cleanSeqNum	cleanSumBase	cleanN50Len	cleanN90Len	cleanMeanLen	cleanMaxLen	cleanMeanQual
DNA_BMK01	1,218,239	26.37	1,121,736	25.90	28,014	15,764	23,090	143,181	9

Ìṣàyẹ̀wò Dídára Dátà ti Àyẹ̀wò RNA

Táblì 1. Àwọn ìṣirò lórí dátà mímọ́.

Orukọ faili	ID Onibara	KáàdìNọ́mbà	BaseNum	N50	Gígùn Àárín Gbùngbùn	Gígùn Tó Pọ̀ Jùlọ	Àròpọ̀ Ìwọ̀n-oṣù
RNA_BMK001	C2	8,947,708	4,047,230,083	398	452	129,227	Q12