Ìwádìí Ìbáṣepọ̀ Gbogbo Jínómù
Iṣẹ́ ṣíṣiṣẹ́
Àwọn Àǹfààní Iṣẹ́
●Àwọn ìmọ̀ àti àkọsílẹ̀ ìtẹ̀jáde tó gbòòròPẹ̀lú ìrírí tí a kó jọ nínú GWAS, BMKGene ti parí ọgọ́rọ̀ọ̀rún iṣẹ́ àgbékalẹ̀ irúgbìn nínú ìwádìí GWAS, ó ti ran àwọn olùwádìí lọ́wọ́ láti tẹ àwọn àpilẹ̀kọ tó lé ní ọgọ́rùn-ún jáde, àti pé àpapọ̀ ipa náà dé 500.
● Ìwádìí bioinformatics tó péye: iṣiṣẹ́ iṣẹ́ náà ní ìṣàyẹ̀wò ìsopọ̀ SNP-trait, tí ó ń fi àwọn jiini olùdíje àti àtúnyẹ̀wò iṣẹ́ wọn tí ó báramu hàn.
●Ẹgbẹ bioinformatics ti o ni oye giga ati iyipo itupalẹ kukurupẹ̀lú ìrírí tó ga nínú ìwádìí ìjìnlẹ̀ nípa ìjìnlẹ̀ tó ti pẹ́, ẹgbẹ́ BMKGene ń ṣe àwọn ìwádìí tó péye pẹ̀lú àkókò ìyípadà kíákíá.
●Atilẹyin Lẹhin-Tita:Ìdúróṣinṣin wa kọjá píparí iṣẹ́ náà pẹ̀lú àkókò iṣẹ́ oṣù mẹ́ta lẹ́yìn títà. Ní àkókò yìí, a ń ṣe àtúnṣe iṣẹ́ náà, ìrànlọ́wọ́ lórí ìṣòro, àti àwọn ìbéèrè àti ìdáhùn láti dáhùn àwọn ìbéèrè èyíkéyìí tí ó bá jẹ mọ́ àbájáde rẹ̀.
Awọn pato ati awọn ibeere fun iṣẹ naa
| Iru tito lẹsẹsẹ | Iwọn olugbe ti a ṣeduro | Ọgbọ́n ìtẹ̀léra | Awọn ibeere Nucleotide |
| Ìtẹ̀léra gbogbo ìṣẹ̀dá ìran | Àwọn àpẹẹrẹ 200 | 10x | Ìfojúsùn: ≥ 1 ng/µL Àròpọ̀ iye≥ 30ng Ìbàjẹ́ tàbí ìbàjẹ́ tó lopin tàbí kò sí |
| Ìpínpín Àfikún-Ibi-Specific-Locus (SLAF) | Ijinle ami: 10x Iye àwọn àmì ìsàlẹ̀: <400 Mb: A gbani nímọ̀ràn WGS <1Gb: Àwọn àmì 100K 1Gb > 2Gb: Àwọn àmì 300K Àwọn àmì tó pọ̀jù 500k | Ìfojúsùn ≥ 5 ng/µL Àròpọ̀ iye ≥ 80 ng Geli Agarose: ko si tabi ibajẹ tabi idoti opin
|
Àṣàyàn Ohun Èlò
Oríṣiríṣi oríṣiríṣi, ẹ̀yà ara, ẹ̀yà ilẹ̀/ìran/àwọn ìdílé àdàlú/àwọn ohun àlùmọ́nì ìgbẹ́
Awọn oriṣiriṣi oriṣiriṣi, awọn ẹya ara ilu, ati awọn ẹya ilẹ
Ìdílé ìdajì ọmọ/ìdílé ọmọ-ìyá/àwọn ohun àlùmọ́ọ́nì ìgbẹ́
Ìṣàn Iṣẹ́ Iṣẹ́
Apẹrẹ idanwo
Ifijiṣẹ apẹẹrẹ
Ìyọkúrò RNA
Ìkọ́lé ìkàwé
Ṣíṣe ìtẹ̀léra
Ìtúpalẹ̀ Dátà
Awọn iṣẹ lẹhin-tita
Pẹlu awọn wọnyi onínọmbà:
- Ìṣàyẹ̀wò ìsopọ̀ gbogbo-ẹ̀dá-ẹ̀dá: LM, LMM, EMMAX, àwòṣe FASTLMM
- Àlàyé iṣẹ́ ti àwọn jínì olùdíje
Ìwádìí ìṣọ̀kan SNP-ẹ̀dá-ẹ̀dá – ìtàn Manhattan
Ìṣàyẹ̀wò ìsopọ̀ SNP-ìwà – ìtàn QQ
Ṣawari awọn ilọsiwaju ti awọn iṣẹ BMKGene's de GWAS ṣe iranlọwọ nipasẹ akojọpọ awọn atẹjade ti a ṣeto:
Lv, L. àti àwọn ẹlòmíràn (2023) 'Ìmọ̀ nípa ìpìlẹ̀ ìfaradà ammonia nínú afẹ́fẹ́ amúǹkantí Sinonovacula constricta nípasẹ̀ ìwádìí àpapọ̀ genome',Ẹja omi, 569, ojú ìwé 739351. doi: 10.1016/J.AQUACULTURE.2023.739351.
Li, X. àti àwọn ẹlòmíràn (2022) ‘Àwọn ìwádìí onípele-pupọ ti àwọn àfikún millet 398 fi àwọn agbègbè genomic tí ó níí ṣe pẹ̀lú ìtọ́jú ara, àwọn ànímọ́ metabolite, àti àwọn ipa ìdènà ìgbóná ara hàn’,Ohun ọgbin molikula, 15 (8), ojú ìwé 1367–1383. doi: 10.1016 / j.molp.2022.07.003.
Li, J. àti àwọn ẹlòmíràn (2022) ‘Àwòrán Ìbáṣepọ̀ Gídíónì-Gbogbo ti Àwọn Ìrísí Hulless Barely ní Àyíká Ọ̀gbẹ’,Àwọn Ààlà Nínú Ìmọ̀ Ìjìnlẹ̀ Ohun Ọ̀gbìn, 13, ojú ìwé 924892. doi: 10.3389/FPLS.2022.924892/BIBTEX.
Zhao, X. àti àwọn ẹlòmíràn (2021) 'GmST1, èyí tí ó ń ṣàfihàn sulfotransferase, ń fún àwọn ẹ̀yà kòkòrò àrùn soybean mosaic G2 àti G3 ní agbára láti dènà wọn',Ohun ọgbin, Sẹ́ẹ̀lì àti Àyíká, 44 (8), ojú ìwé 2777–2792. doi: 10.1111 / PCE.14066.
