-
Ohun ọgbin / Animal De novo Genome Sequencing
De novoitọka itọka si ikole ti ẹda kan 'gbogbo genome nipa lilo awọn imọ-ẹrọ titele, fun apẹẹrẹ PacBio, Nanopore, NGS, ati bẹbẹ lọ, laisi jiini itọkasi kan.Ilọsiwaju iyalẹnu ni ipari kika ti awọn imọ-ẹrọ itẹlera iran kẹta ti mu awọn aye tuntun ni apejọ awọn genomes eka, gẹgẹbi awọn ti o ni heterozygosity giga, ipin giga ti awọn agbegbe atunwi, polyploids, bbl Pẹlu ipari kika ni awọn mewa ti ipele kilobases, awọn kika atẹle wọnyi jẹ ki o ṣiṣẹ. ipinnu awọn eroja ti atunwi, awọn agbegbe pẹlu awọn akoonu GC ajeji ati awọn agbegbe eka miiran.
Platform: PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48/ Illumina NovaSeq6000
-
Hi-C orisun Genome Apejọ
Hi-C jẹ ọna ti a ṣe lati mu iṣeto chromosome mu nipa apapọ awọn ibaraẹnisọrọ orisun-isunmọ-isunmọ ati ilana-ọna-giga.Kikankikan ti awọn ibaraenisepo wọnyi ni a gbagbọ pe o ni ibatan ni odi pẹlu ijinna ti ara lori awọn chromosomes.Nitorinaa, data Hi-C le ṣe itọsọna iṣakojọpọ, pipaṣẹ ati iṣalaye awọn ilana ti o pejọ ninu jiomeji osere ati didari awọn wọnyẹn sori nọmba kan ti awọn chromosomes.Imọ-ẹrọ yii n fun apejọ jiini ipele-chromosome ni agbara ni isansa ti maapu jiini ti o da lori olugbe.Gbogbo ẹyọ-ara kan nilo Hi-C.
Platform: Illumina NovaSeq6000 / DNBSEQ
-
Genetics ti itiranya
Jiini ti itiranya jẹ iṣẹ ṣiṣe atẹle ti o kun ti a ṣe apẹrẹ fun ipese itumọ pipe lori alaye itankalẹ ti awọn ohun elo ti o da lori awọn iyatọ jiini, pẹlu SNPs, InDels, SVs ati CNVs.O pese gbogbo awọn itupalẹ ipilẹ ti o nilo fun ṣiṣe apejuwe awọn iyipada itiranya ati awọn ẹya jiini ti awọn olugbe, gẹgẹbi igbekalẹ olugbe, oniruuru jiini, awọn ibatan phylogeny, bbl O tun ni awọn iwadii lori ṣiṣan pupọ, eyiti o funni ni agbara idiyele ti iwọn olugbe ti o munadoko, akoko iyatọ.
-
Ifiwera Genomics
Awọn jinomiki afiwera ni itumọ ọrọ gangan tumọ si ifiwera awọn ilana jiini pipe ati awọn ẹya ti awọn oriṣiriṣi oriṣiriṣi.Ẹkọ yii ni ifọkansi lati ṣafihan itankalẹ eya, iṣẹ apilẹṣẹ, ẹrọ ilana ilana jiini ni ipele jiini nipa idamo awọn ọna lẹsẹsẹ ati awọn eroja ti o tọju tabi iyatọ laarin awọn oriṣiriṣi oriṣiriṣi.Iwadii jinomiki afiwera ti o wọpọ pẹlu awọn itupale ninu idile apilẹṣẹ, idagbasoke itankalẹ, ẹda ẹda-ara gbogbo, titẹ yiyan, ati bẹbẹ lọ.
-
Bulked Segregant onínọmbà
Itupalẹ ipinya pupọ (BSA) jẹ ilana kan ti a lo lati ṣe idanimọ iyara ti awọn asami jiini ti o somọ phenotype.Bisesenlo akọkọ ti BSA ni yiyan awọn ẹgbẹ meji ti awọn ẹni-kọọkan pẹlu awọn atako phenotypes lalailopinpin, iṣakojọpọ DNA ti gbogbo eniyan lati dagba olopobobo DNA meji, idamo awọn ilana iyatọ laarin awọn adagun meji.Ilana yii ti ni iṣẹ lọpọlọpọ ni idamo awọn asami jiini ti o ni nkan ṣe pataki nipasẹ awọn jiini ti a fojusi ni awọn genomes ọgbin/eranko.
