Ìtẹ̀léra Metatranscriptome
Àwọn Ẹ̀yà Iṣẹ́
● Ìparẹ́ rRNA lẹ́yìn náà ni ìpèsè ìkàwé mRNA ìtọ́sọ́nà tẹ̀lé e.
● Ṣíṣe ìtẹ̀lé lórí Illumina NovaSeq.
Àwọn Àǹfààní Iṣẹ́
●Ṣe ìkẹ́kọ̀ọ́ nípa àwọn ìyípadà àwọn agbègbè onímọ̀ nípa ohun alumọ́ọ́nì:Èyí máa ń ṣẹlẹ̀ ní ìpele ìkọ̀wé àti láti ṣe àwárí àwọn jínì tuntun tó ṣeéṣe.
●Ṣíṣàlàyé Ìbáṣepọ̀ Àwùjọ Àwọn Kòkòrò Ààrin pẹ̀lú Olùgbàlejò tàbí Àyíká.
●Àgbéyẹ̀wò Ìwádìí Àìlera Onímọ̀-ẹ̀rọ Gbogbogbò: Èyí fúnni ní òye lórí àwọn àkójọpọ̀ ìṣàkójọpọ̀ àwùjọ àti iṣẹ́-ṣíṣe, àti ìṣàyẹ̀wò ìfarahàn ìran-ìran ọ̀tọ̀ọ̀tọ̀.
●Àlàyé nípa Ìran Gíga Tó Gbòòrò:Lílo ibi ìpamọ́ ìṣiṣẹ́ ìran tuntun fún ìwífún nípa ìfihàn ìran tó ní ìmọ́ nípa àwọn àwùjọ àwọn kòkòrò àrùn.
●Atilẹyin lẹhin-Tita:Ìdúróṣinṣin wa kọjá píparí iṣẹ́ náà pẹ̀lú àkókò iṣẹ́ oṣù mẹ́ta lẹ́yìn títà. Ní àkókò yìí, a ń ṣe àtúnṣe iṣẹ́ náà, ìrànlọ́wọ́ lórí ìṣòro, àti àwọn ìbéèrè àti ìdáhùn láti dáhùn àwọn ìbéèrè èyíkéyìí tí ó bá jẹ mọ́ àbájáde rẹ̀.
Àwọn Ìlànà Iṣẹ́
| Pẹpẹ ìtẹ̀léra | Ìlànà Ìtẹ̀léra | Dátà tí a ṣeduro | Iṣakoso Didara Dátà |
| Illumina NovaSeq | PE150 | 12Gb | Q30≥85% |
Awọn ibeere ayẹwo
| Ìfojúsùn (ng/µL) | Àpapọ̀ iye (µg) | Ìwọ̀n (µL) | OD260/280 | OD260/230 | RIN |
| ≥50 | ≥1.0 | ≥20 | 1.8-2.0 | 1.0-2.5 | ≥6.5 |
Ìṣàn Iṣẹ́ Iṣẹ́
Ifijiṣẹ apẹẹrẹ
Ìkọ́lé ìkàwé
Ṣíṣe ìtẹ̀léra
Ìtúpalẹ̀ Dátà
Awọn iṣẹ lẹhin-tita
Pẹlu awọn wọnyi onínọmbà:
● Ṣíṣe Ìṣàkóso Dídára Dátà Ìtẹ̀léra
● Àkójọpọ̀ Ìwé Àkọsílẹ̀
● Àlàyé àti Ìṣọ̀pọ̀ Àwọn Owó-orí
● Àlàyé Iṣẹ́ àti Ọ̀pọ̀lọpọ̀
● Ìṣàyẹ̀wò Ìṣirò Ìfarahàn àti Ìyàtọ̀
Pínpín ìpín-orí ti àyẹ̀wò kọ̀ọ̀kan:
Ìṣàyẹ̀wò onírúurú Beta: UPGMA
Àlàyé iṣẹ́ – GO opoiye
Ìyàtọ̀ nínú iye owó orí - LEFSE
Ṣawari awọn ilọsiwaju ti awọn iṣẹ BMKGene's meta transcriptomics sequencing ṣe iranlọwọ nipasẹ akojọpọ awọn atẹjade ti a ṣeto.
Lu, Z. àti àwọn ẹlòmíràn (2023) ‘Ìfaradà ásíìdì fún àwọn bakitéríà tí ń lo lactate gẹ́gẹ́ bí Bacteroidales ṣe ń ṣe ìrànlọ́wọ́ láti dènà àrùn ruminal acidosis nínú àwọn ewúrẹ́ tí a mú mọ́ oúnjẹ tí ó ní ìṣọ̀kan púpọ̀’,Ounjẹ Ẹranko, 14, ojú ìwé 130–140. doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.
Song, Z. àti àwọn ẹlòmíràn (2017) ‘Ṣíṣí àwọn microbiota iṣẹ́ pàtàkì nínú ìṣẹ̀dá ìpìlẹ̀ líle nípa lílo àwọn amplicons àti metatranscriptomics sequencing’,Àwọn Ààlà ní Microbiology, 8(Oṣù Keje). doi: 10.3389/FMICB.2017.01294/KÚN.
Wang, W. àti àwọn ẹlòmíràn (2022) ‘Àwọn àrùn Mycovirus tuntun tí a ṣàwárí láti inú ìwádìí Metatranscriptomics ti Phytopathogenic Alternaria Fungus’,Àwọn fáírọ́ọ̀sì, 14(11), ojú ìwé 2552. doi: 10.3390/V14112552/S1.
Wei, J. àti àwọn ẹlòmíràn (2022) ‘Àyẹ̀wò metatranscriptome tó jọra fi ìbàjẹ́ àwọn metabolites kejì ewéko hàn nípasẹ̀ àwọn beetles àti àwọn àjọpọ̀ ìfun wọn’,Molikula Ẹ̀kọ́ nípa Ìṣẹ̀dá Èkìtì, 31 (15), oju-iwe 3999-4016. doi: 10.1111 / MEC.16557.
