-
Ilana Isọju Ajẹsara Chromatin (ChiP-seq)
ChIP-Seq n pese profaili jiini jakejado ti awọn ibi-afẹde DNA fun iyipada itan-akọọlẹ, awọn ifosiwewe transcription, ati awọn ọlọjẹ miiran ti o ni ibatan DNA.O daapọ yiyan ti chromatin immuno-precipitation (ChiIP) lati gba awọn ile-iṣẹ amuaradagba-DNA kan pato pada, pẹlu agbara ti atẹle-iran ti o tẹle (NGS) fun ilana-giga ti DNA ti a gba pada.Ni afikun, nitori awọn eka amuaradagba-DNA ti gba pada lati inu awọn sẹẹli alãye, awọn aaye asopọ le ṣe afiwe ni oriṣiriṣi awọn iru sẹẹli ati awọn tisọ, tabi labẹ awọn ipo oriṣiriṣi.Awọn ohun elo wa lati ilana transcriptional si awọn ipa ọna idagbasoke si awọn ilana arun ati kọja.
Platform: Illumina NovaSeq Platform
-
Ilana Metagenomic -NGS
Metagenome n tọka si akojọpọ awọn ohun elo jiini lapapọ ti agbegbe ti o dapọ ti awọn oganisimu, gẹgẹbi awọn metagenome ayika, metagenome eniyan, ati bẹbẹ lọ O ni awọn jinomes ti awọn microorganisms mejeeji ti o le gbin ati ti a ko le gbin.Ilana ti Metagenomic jẹ ohun elo molikula ti a lo lati ṣe itupalẹ awọn ohun elo genomic adalu ti a fa jade lati inu awọn apẹẹrẹ ayika, eyiti o pese alaye alaye ni oniruuru eya ati opo, eto olugbe, ibatan phylogenetic, awọn jiini iṣẹ ati nẹtiwọọki ibamu pẹlu awọn ifosiwewe ayika.
Syeed:Illumina NovaSeq Platform
-
Metagenomic Sequencing-Nanopore
Metagenomics jẹ ohun elo molikula ti a lo lati ṣe itupalẹ awọn ohun elo genomic ti o dapọ ti a fa jade lati awọn apẹẹrẹ ayika, eyiti o pese alaye alaye ni oniruuru eya ati opo, eto olugbe, ibatan phylogenetic, awọn jiini iṣẹ ati nẹtiwọọki ibamu pẹlu awọn ifosiwewe ayika, ati bẹbẹ lọ Awọn iru ẹrọ ilana atẹle Nanopore ti ṣafihan laipẹ. si awọn ẹkọ metagenomic.Iṣe to dayato si ni ipari kika ni ilọsiwaju pupọ si isalẹ ṣiṣan metagenomic, ni pataki apejọ metagenome.Gbigba awọn anfani ti kika-ipari, Nanopore-orisun metagenomic iwadi ni anfani lati se aseyori diẹ lemọlemọfún ijọ akawe pẹlu shot-ibon metagenomics.O ti ṣe atẹjade pe awọn metagenomics ti o da lori Nanopore ni aṣeyọri ti ipilẹṣẹ ni pipe ati tiipa awọn genomes kokoro arun lati awọn microbiomes (Moss, EL, et. al,Biotech iseda, 2020)
Syeed:Nanopore PromethION P48
-
Gbogbo genome bisulfite titele
DNA methylation ni ipo karun ni cytosine (5-mC) ni ipa ipilẹ lori ikosile pupọ ati iṣẹ ṣiṣe cellular.Awọn ilana methylation ajeji ti ni nkan ṣe pẹlu ọpọlọpọ awọn ipo ati awọn arun, gẹgẹbi akàn.WGBS ti di boṣewa goolu fun kikọ ẹkọ methylation jakejado-genome ni ipinnu ipilẹ ẹyọkan.
Platform: Illumina NovaSeq Platform
-
Igbeyewo fun Transposase-Wiwọle Chromatin pẹlu Atẹle Gbigbe Giga (ATAC-seq)
ATAC-seq jẹ ọna itọsẹ-giga ti o ga fun itupalẹ iraye si chromatin jakejado-genome, eyiti o ṣe pataki fun iṣakoso epigenetic agbaye ti ikosile jiini.Awọn oluyipada ti o tẹle ni a fi sii si awọn agbegbe chromatin ti o ṣii nipasẹ transposase Tn5 hyperactive.Lẹhin imudara PCR, ile-ikawe ti o tẹle ni a ṣe.Gbogbo awọn agbegbe chromatin ti o ṣii ni a le gba labẹ ipo aaye-akoko kan pato, kii ṣe opin nikan si awọn aaye abuda ti ifosiwewe transcription, tabi agbegbe kan ti a ti yipada itan-akọọlẹ kan.
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
Subunit ti o wa lori 16S ati 18S rRNA ti o ni awọn mejeeji ni ipamọ giga ati awọn ẹkun-iyipada hyper jẹ itẹka molikula pipe fun idanimọ prokaryotic ati awọn oganisimu eukaryotic.Ni anfani ti ṣiṣe atẹle, awọn amplicons wọnyi le jẹ ifọkansi ti o da lori awọn apakan ti a fipamọ ati awọn agbegbe hyper-ayipada ni a le ṣe afihan ni kikun fun idanimọ makirobia ti o ṣe idasi si awọn iwadii ti o bo itusilẹ oniruuru microbial, taxonomy, phylogeny, bbl. Ilana ti ipasẹ PacBio ngbanilaaye lati gba awọn kika gigun ti o peye gaan, eyiti o le bo awọn amplicons gigun ni kikun (isunmọ 1.5 Kb).Wiwo ti o gbooro ti aaye jiini ṣe alekun ipinnu gaan ni asọye eya ni awọn kokoro arun tabi agbegbe elu.
Syeed:PacBio Sequel II
-
16S / 18S / IT Amplicon Sequencing-NGS
16S/18S/ITS amplicon sequencing ni ifọkansi ni ṣiṣafihan phylogeny, taxonomy, ati opo eya ni agbegbe makirobia nipasẹ ṣiṣewadii awọn ọja PCR ti awọn asami jiini ti itọju ile ti o ni awọn ibaraẹnisọrọ mejeeji ati awọn ẹya hypervariable.Ifihan itẹka molikula pipe wọnyi nipasẹ Woeses et al, (1977) n fun profaili microbiome ti ko ni ipinya ni agbara.Tito lẹsẹsẹ ti 16S (kokoro), 18S ( elu) ati Inu transcribed spacer(ITS, elu) ngbanilaaye idanimọ ti awọn ẹya lọpọlọpọ ati awọn ẹya toje ati ti a ko mọ.Imọ-ẹrọ yii ti di ohun elo ti a lo lọpọlọpọ ati ohun elo pataki ni idamo akojọpọ makirobia ti o yatọ ni ọpọlọpọ awọn agbegbe, gẹgẹbi ẹnu eniyan, ifun, feces, ati bẹbẹ lọ.
Syeed:Illumina NovaSeq Platform
-
Kokoro ati Olu Gbogbo Jiini Tun-sequencing
Bakteria ati olu gbogbo genome tun-sequencing jẹ ohun elo to ṣe pataki lati pari awọn genomes ti kokoro arun ti a mọ ati elu, bakannaa lati ṣe afiwe awọn genomes pupọ tabi lati ṣe maapu awọn genomes ti awọn oganisimu tuntun.O ṣe pataki pupọ lati ṣe lẹsẹsẹ gbogbo awọn genomes ti kokoro arun ati elu lati le ṣe agbekalẹ awọn genomes itọkasi deede, lati ṣe idanimọ makirobia ati awọn iwadii jiini afiwera miiran.
Platform: Illumina NovaSeq Platform
-
PacBio-Full-ipari 16S/18S/ITS Amplicon Sequencing
Amplicon (16S / 18S / ITS) Syeed ti ni idagbasoke pẹlu awọn ọdun ti iriri ni itupalẹ iṣẹ akanṣe oniruuru makirobia, eyiti o ni itupalẹ ipilẹ idiwọn ati itupalẹ ara ẹni: itupalẹ ipilẹ ni wiwa akoonu itupalẹ akọkọ ti iwadii makirobia lọwọlọwọ, akoonu itupalẹ jẹ ọlọrọ ati okeerẹ, ati awọn abajade itupalẹ ni a gbekalẹ ni irisi awọn ijabọ akanṣe;Awọn akoonu ti ti ara ẹni onínọmbà jẹ orisirisi.Awọn ayẹwo ni a le yan ati pe a le ṣeto awọn paramita ni irọrun ni ibamu si ijabọ itupalẹ ipilẹ ati idi iwadi, lati mọ awọn ibeere ti ara ẹni.Windows ọna eto, o rọrun ati ki o yara.
-
PacBio-kikun-ipari Transcriptome (ti kii ṣe itọkasi)
Gbigbe Awọn imọ-ẹrọ Pacific Biosciences (PacBio) Isoform data titele bi titẹ sii, Ohun elo yii ni anfani lati ṣe idanimọ awọn ilana iwe-kikọ ipari ipari (laisi apejọ).Nipa ṣiṣe aworan awọn ilana gigun ni kikun lodi si jiini itọkasi, awọn iwe afọwọkọ le jẹ iṣapeye nipasẹ awọn Jiini ti a mọ, awọn iwe afọwọkọ, awọn agbegbe ifaminsi, bbl Ni idi eyi, idanimọ deede diẹ sii ti awọn ẹya mRNA, gẹgẹbi pipin yiyan, ati bẹbẹ lọ, le ṣaṣeyọri.Itupalẹ apapọ pẹlu data itọsẹ transcriptome NGS n jẹ ki alaye asọye diẹ sii ati iwọn deede diẹ sii ni ikosile ni ipele tiransikiripiti, eyiti o ni anfani pupọ ni ikosile iyatọ isale ati itupalẹ iṣẹ.
-
Idinku Aṣoju Bisulfite Sequencing (RRBS)
Iwadi methylation DNA ti jẹ koko-ọrọ ti o gbona nigbagbogbo ninu iwadii aisan, ati pe o ni ibatan pẹkipẹki si ikosile pupọ ati awọn ami-ara-pheno.RRBS jẹ ọna ti o peye, daradara ati ti ọrọ-aje fun iwadii DNA methylation.Imudara ti olupolowo ati awọn agbegbe erekusu CpG nipasẹ enzymatic cleavage (Msp I), ni idapo pẹlu ilana ilana Bisulfite, pese wiwa methylation DNA ti o ga.
Platform: Illumina NovaSeq Platform
-
Ilana prokaryotic mRNA
Itọpa mRNA n fun ni agbara ni kikun ti gbogbo awọn iwe afọwọkọ mRNA laarin awọn sẹẹli labẹ awọn ipo kan pato.Imọ-ẹrọ gige-eti yii ṣiṣẹ bi ohun elo ti o lagbara, ṣiṣafihan awọn profaili ikosile jiini intricate, awọn ẹya pupọ, ati awọn ọna ṣiṣe molikula ti o ni nkan ṣe pẹlu awọn ilana isedale oniruuru.Ti a gba jakejado ni iwadii ipilẹ, awọn iwadii ile-iwosan, ati idagbasoke oogun, tito lẹsẹsẹ mRNA n funni ni awọn oye si awọn intricacies ti awọn dainamiki cellular ati ilana jiini.Ṣiṣe ayẹwo prokaryotic mRNA wa jẹ ti a ṣe deede fun awọn transcriptomes prokaryotic, ti o kan idinku rRNA ati igbaradi ile ikawe itọsọna.
Syeed: Illumina NovaSeq X
