ਜੀਨੋਮ ਵਿਕਾਸ
ਕੁਦਰਤ
ਸੰਚਾਰ
ਜੀਨੋਮ ਕ੍ਰਮ ਗਲੋਬਲ ਫੈਲਾਅ ਰੂਟਾਂ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦੇ ਹਨ ਅਤੇ ਸਮੁੰਦਰੀ ਘੋੜੇ ਦੇ ਵਿਕਾਸ ਵਿੱਚ ਕਨਵਰਜੈਂਟ ਜੈਨੇਟਿਕ ਅਨੁਕੂਲਨ ਦਾ ਸੁਝਾਅ ਦਿੰਦੇ ਹਨ
PacBio |ਇਲੁਮਿਨਾ |ਹਾਇ-ਸੀ |WGS |ਜੈਨੇਟਿਕ ਵਿਭਿੰਨਤਾ |ਜਨਸੰਖਿਆ ਇਤਿਹਾਸ |ਜੀਨ ਪ੍ਰਵਾਹ
ਬਾਇਓਮਾਰਕਰ ਟੈਕਨੋਲੋਜੀਜ਼ ਦੁਆਰਾ ਪੈਕਬਿਓ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ, ਜੀਨੋਮ ਡੀ ਨੋਵੋ ਅਸੈਂਬਲੀ ਅਤੇ ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ ਸੇਵਾਵਾਂ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕੀਤੀਆਂ ਗਈਆਂ ਸਨ।
ਹਾਈਲਾਈਟਸ
1. 15.5 Mb ਦੇ ਕੰਟੀਗ N50 ਦੇ ਨਾਲ ਇੱਕ ਉੱਚ ਗੁਣਵੱਤਾ ਵਾਲਾ ਕ੍ਰੋਮੋਸੋਮ-ਪੱਧਰ ਦਾ ਸਮੁੰਦਰੀ ਘੋੜਾ (ਹਿਪੋਕੈਂਪਸ ਇਰੈਕਟਸ) ਜੀਨੋਮ ਪ੍ਰਾਪਤ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਸੀ।
2. ਦੁਨੀਆ ਭਰ ਦੀਆਂ 21 ਸਮੁੰਦਰੀ ਘੋੜਿਆਂ ਦੀਆਂ ਸਪੀਸੀਜ਼ ਦੇ ਕੁੱਲ 358 ਜੀਨੋਮ ਰੀਕਿਊਂਸ ਕੀਤੇ ਗਏ ਸਨ।
3. ਓਲੀਗੋਸੀਨ ਦੇ ਅਖੀਰ ਵਿੱਚ ਵਿਕਸਤ ਹੋਏ ਸਮੁੰਦਰੀ ਘੋੜੇ ਅਤੇ ਬਾਅਦ ਵਿੱਚ ਸਰਕਮ-ਗਲੋਬਲ ਬਸਤੀੀਕਰਨ ਰੂਟਾਂ ਦੀ ਪਛਾਣ ਕੀਤੀ ਗਈ ਹੈ ਅਤੇ ਸਮੁੰਦਰੀ ਧਾਰਾਵਾਂ ਅਤੇ ਪੈਲੀਓਟੈਂਪੋਰਲ ਸਮੁੰਦਰੀ ਰਸਤੇ ਦੇ ਖੁੱਲਣ ਵਿੱਚ ਬਦਲਦੀ ਗਤੀਸ਼ੀਲਤਾ ਨਾਲ ਜੁੜੇ ਹੋਏ ਹਨ।
4. ਆਵਰਤੀ "ਬੋਨੀ ਸਪਾਈਨਸ" ਅਡੈਪਟਿਵ ਫੀਨੋਟਾਈਪ ਦਾ ਜੈਨੇਟਿਕ ਅਧਾਰ ਇੱਕ ਮੁੱਖ ਵਿਕਾਸਸ਼ੀਲ ਜੀਨ ਵਿੱਚ ਸੁਤੰਤਰ ਬਦਲ ਨਾਲ ਜੁੜਿਆ ਹੋਇਆ ਹੈ।
5.ਸਮੁੰਦਰੀ ਕਰੰਟਾਂ ਰਾਹੀਂ ਰਾਫਟਿੰਗ ਖਰਾਬ ਫੈਲਾਅ ਲਈ ਮੁਆਵਜ਼ਾ ਦਿੰਦੀ ਹੈ ਅਤੇ ਤੇਜ਼ੀ ਨਾਲ ਅਨੁਕੂਲਤਾ ਨਵੇਂ ਨਿਵਾਸ ਸਥਾਨਾਂ ਨੂੰ ਬਸਤੀ ਬਣਾਉਣ ਦੀ ਸਹੂਲਤ ਦਿੰਦੀ ਹੈ
ਪ੍ਰਾਪਤੀਆਂ
ਚਿੱਤਰ 1 358 ਸਮੁੰਦਰੀ ਘੋੜਿਆਂ ਦੇ ਨਮੂਨਿਆਂ ਦੀ ਜੈਨੇਟਿਕ ਵਿਭਿੰਨਤਾ ਅਤੇ ਫਾਈਲੋਜੈਨੇਟਿਕ ਸਬੰਧ
a22 ਕ੍ਰੋਮੋਸੋਮਸ ਵਿੱਚ 21 ਸਮੁੰਦਰੀ ਘੋੜਿਆਂ ਦੀਆਂ ਨਸਲਾਂ ਦੇ ਨਿਊਕਲੀਓਟਾਈਡ ਵਿਭਿੰਨਤਾ (π) ਦੇ ਨਮੂਨੇ ਵਾਲੇ ਸਮੁੰਦਰੀ ਘੋੜਿਆਂ ਲਈ ਭੂਗੋਲਿਕ ਨਮੂਨੇ ਦੇ ਸਥਾਨ।b 358 ਸਮੁੰਦਰੀ ਘੋੜਿਆਂ ਦੇ ਜੀਨੋਮ-ਵਿਆਪਕ SNPs ਨਾਲ ਬਣੇ ਨੇਬਰਜੋਇਨਿੰਗ ਟ੍ਰੀ।(a) ਵਿੱਚ ਸਥਾਨ ਪਿੰਨ ਚਿੰਨ੍ਹ ਅਤੇ (b) ਵਿੱਚ ਸ਼ਾਖਾ ਪਿਛੋਕੜ ਇੱਕ ਦੂਜੇ ਨਾਲ ਮੇਲ ਖਾਂਦੇ ਹਨ।
ਚਿੱਤਰ 2 ਸਮੁੰਦਰੀ ਘੋੜਿਆਂ ਦਾ ਬਸਤੀੀਕਰਨ ਅਤੇ ਜਨਸੰਖਿਆ ਇਤਿਹਾਸ
a21 ਸਮੁੰਦਰੀ ਘੋੜਿਆਂ ਦੀਆਂ ਕਿਸਮਾਂ ਲਈ ਫਾਈਲੋਜੈਨੇਟਿਕ ਟ੍ਰੀ ਅਤੇ ਵਿਭਿੰਨਤਾ ਸਮਾਂ ਅਨੁਮਾਨ।ਬ੍ਰਾਂਚ ਲਾਈਨ ਦੀ ਮੋਟਾਈ ਆਬਾਦੀ ਦੇ ਆਕਾਰ ਦੇ ਅਨੁਮਾਨਾਂ (Ne) ਨਾਲ ਮੇਲ ਖਾਂਦੀ ਹੈ ਅਤੇ ਰੰਗ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਵੰਸ਼ਾਂ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦੇ ਹਨ।ਚਿੰਨ੍ਹ I–III ਕੈਲੀਬ੍ਰੇਸ਼ਨ ਬਿੰਦੂਆਂ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦੇ ਹਨ।b–d ਵਖਰੇਵੇਂ ਦੇ ਸਮੇਂ, ਵੰਡ, ਵਿਕਾਰਨ ਘਟਨਾਵਾਂ, ਅਤੇ ਸਮੁੰਦਰੀ ਕਰੰਟਾਂ (ਚਿੱਟੇ ਤੀਰ) ਦੇ ਅਧਾਰ ਤੇ ਸਮੁੰਦਰੀ ਘੋੜਿਆਂ ਦੇ ਉਪਨਿਵੇਸ਼ ਰੂਟਾਂ (ਰੰਗੀਨ ਤੀਰ)।b ਸਮੁੰਦਰੀ ਘੋੜਿਆਂ ਦੇ ਵਿਭਿੰਨਤਾ ਅਤੇ ਵਿਸ਼ਵ ਪੱਧਰ 'ਤੇ 18-23 Ma ਵਿੱਚ ਫੈਲਣ ਤੋਂ ਪਹਿਲਾਂ ਇੰਡੋ-ਆਸਟ੍ਰੇਲੀਅਨ ਦੀਪ ਸਮੂਹ ਹਿਪੋਕੈਂਪਸ ਜੀਨਸ ਦਾ ਮੂਲ ਕੇਂਦਰ (ਲਾਲ ਨਿਸ਼ਾਨ) ਸੀ।c ਸਮੁੰਦਰੀ ਘੋੜਿਆਂ ਨੇ ਸ਼ੁਰੂਆਤੀ ਟੈਥੀਅਨ ਸਮੁੰਦਰੀ ਰਸਤੇ ਰਾਹੀਂ ਅਟਲਾਂਟਿਕ ਮਹਾਸਾਗਰ ਦਾ ਬਸਤੀੀਕਰਨ ਕੀਤਾ, ਜਿਸ ਦੇ ਬੰਦ ਹੋਣ ਤੋਂ ਬਾਅਦ (7-13 Ma ਦੌਰਾਨ ਟਰਮੀਨਲ ਘਟਨਾ), ਇਸ ਟੈਥੀਅਨ ਵੰਸ਼ ਨੂੰ ਇਸਦੀ ਹਿੰਦ ਮਹਾਸਾਗਰ ਭੈਣ ਵੰਸ਼ ਤੋਂ ਵੱਖ ਕਰ ਦਿੱਤਾ।ਬਾਅਦ ਵਾਲੇ, ਬਾਅਦ ਵਿੱਚ ਅਰਬ ਸਾਗਰ ਵਿੱਚ ਤੇਜ਼ੀ ਨਾਲ ਵਿਭਿੰਨਤਾ (ਪੀਲੀ ਨਿਸ਼ਾਨੀ), ਸਮੁੰਦਰੀ ਘੋੜਿਆਂ ਦੀ ਵਿਭਿੰਨਤਾ ਦਾ ਦੂਜਾ ਕੇਂਦਰ ਸਥਾਪਤ ਕੀਤਾ।d ਅਟਲਾਂਟਿਕ ਮਹਾਸਾਗਰ ਦੀ ਇੱਕ ਦੂਜੀ ਸਮੁੰਦਰੀ ਘੋੜੇ ਦੀ ਬਸਤੀੀਕਰਨ ਦੀ ਘਟਨਾ ਹਿੰਦ ਮਹਾਸਾਗਰ ਤੋਂ ਲਗਭਗ 5Ma ਦੱਖਣੀ ਅਫ਼ਰੀਕਾ ਦੇ ਸਿਰੇ ਤੋਂ ਲੰਘਦੀ ਹੋਈ, ਅਤੇ ਅੰਤ ਵਿੱਚ ਲਗਭਗ 3.6 Ma ਵਿੱਚ ਅਜੇ ਵੀ ਖੁੱਲ੍ਹੇ ਪਨਾਮਾ ਸਮੁੰਦਰੀ ਰਸਤੇ ਰਾਹੀਂ ਪੂਰਬੀ ਪ੍ਰਸ਼ਾਂਤ ਮਹਾਸਾਗਰ ਵਿੱਚ ਪਹੁੰਚੀ।
ਚਿੱਤਰ 3 ਪ੍ਰਭਾਵੀ ਆਬਾਦੀ ਦੇ ਆਕਾਰ ਵਿਚ ਜੀਨ ਦਾ ਪ੍ਰਵਾਹ ਅਤੇ ਉਤਰਾਅ-ਚੜ੍ਹਾਅ
aਦੱਖਣੀ ਅਟਲਾਂਟਿਕ ਮਹਾਸਾਗਰ ਵਿੱਚ ਵੱਸਣ ਵਾਲੀਆਂ ਪ੍ਰਜਾਤੀਆਂ ਵਿਚਕਾਰ ਜੀਨ ਦੇ ਪ੍ਰਵਾਹ ਦਾ ਪਤਾ ਲਗਾਇਆ ਗਿਆ।ਜੀਨ ਦੇ ਪ੍ਰਵਾਹ ਨੂੰ ਜੀ-ਫੋਸੀਐਸ ਦੁਆਰਾ ਘਟਾਏ ਗਏ ਮਾਈਗ੍ਰੇਸ਼ਨ ਦਰ ਵਜੋਂ ਸਫੈਦ ਲਾਈਨਾਂ ਦੇ ਨੇੜੇ ਦਿਖਾਇਆ ਗਿਆ ਹੈ।ਤੀਰਾਂ ਦੀ ਮੋਟਾਈ ਅਤੇ ਦਿਸ਼ਾ ਕ੍ਰਮਵਾਰ ਜੀਨ ਦੇ ਪ੍ਰਵਾਹ ਦੀ ਦਰ ਅਤੇ ਦਿਸ਼ਾ ਨਾਲ ਮੇਲ ਖਾਂਦੀ ਹੈ।b PSMC ਦੁਆਰਾ ਪ੍ਰਭਾਵੀ ਆਬਾਦੀ ਦੇ ਆਕਾਰ ਵਿੱਚ ਉਤਰਾਅ-ਚੜ੍ਹਾਅ।x ਧੁਰਾ ਵਰਤਮਾਨ ਤੋਂ ਪਹਿਲਾਂ ਦੇ ਸਾਲਾਂ ਵਿੱਚ ਸਮੇਂ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦਾ ਹੈ ਜਦੋਂ ਕਿ y ਧੁਰਾ ਪ੍ਰਭਾਵੀ ਆਬਾਦੀ ਦੇ ਆਕਾਰ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦਾ ਹੈ।ਚਾਰਟ ਮੁੱਖ ਤੌਰ 'ਤੇ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਵੰਡ ਖੇਤਰਾਂ ਵਾਲੀ ਹਰੇਕ ਜਾਤੀ ਲਈ ਭੂਗੋਲਿਕ ਵੰਡ ਦੇ ਅਨੁਸਾਰ ਸੰਗਠਿਤ ਕੀਤੇ ਜਾਂਦੇ ਹਨ।c ਪਿਛਲੇ 1 ਮਿਲੀਅਨ ਸਾਲਾਂ ਦੌਰਾਨ ਮੀਟਰ 33 ਵਿੱਚ ਸਮੁੰਦਰ ਦਾ ਪੱਧਰ ਬਦਲਦਾ ਹੈ।ਪੀਲੀ ਲਾਈਨ ਆਖਰੀ ਗਲੋਬਲ ਇੰਟਰਗਲੇਸ਼ੀਅਲ ਪੀਕ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦੀ ਹੈ ਜਦੋਂ ਕਿ ਸਿਆਨ ਸ਼ੇਡ ਆਖਰੀ ਗਲੇਸ਼ੀਅਲ ਅਧਿਕਤਮ ਮਿਆਦ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦੀ ਹੈ।
ਚਿੱਤਰ 4 ਰੀੜ੍ਹ ਦੀ ਹੱਡੀ ਦਾ ਵਿਕਾਸ।
aਖੱਬੇ, ਸਪੀਸੀਜ਼ ਟ੍ਰੀ ਸਮੁੰਦਰੀ ਘੋੜਿਆਂ ਵਿੱਚ ਰੀੜ੍ਹ ਦੀ ਸੁਤੰਤਰ ਵਿਕਾਸ ਦਰਸਾਉਂਦਾ ਹੈ।ਸ਼ਾਖਾ ਦੀ ਲੰਬਾਈ ਪ੍ਰਤੀ ਸਾਈਟ ਦੇ ਬਦਲਾਂ ਦੀ ਸੰਖਿਆ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦੀ ਹੈ।ਚਾਰ ਸਪਾਈਨੀ ਸਮੁੰਦਰੀ ਘੋੜਿਆਂ ਦੀਆਂ ਕਿਸਮਾਂ ਨੂੰ ਨੀਲੇ ਰੰਗ ਵਿੱਚ ਉਜਾਗਰ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਹੈ।ਮੋਟੀਆਂ ਸ਼ਾਖਾਵਾਂ bmp3 ਜੀਨ ਲਈ ਗੈਰ-ਸਮਰਥਕ-ਤੋਂ-ਸਮਰਥਕ ਬਦਲ (dN/dS) ਦੀਆਂ ਉੱਚ ਦਰਾਂ ਨਾਲ ਮੇਲ ਖਾਂਦੀਆਂ ਹਨ।bmp3 ਜੀਨ ਲਈ ਕੈਨੋਨੀਕਲ ਅਤੇ ਜਨਰਲਾਈਜ਼ਡ ਮੈਕਡੋਨਲਡ ਅਤੇ ਕ੍ਰੀਟਮੈਨ ਟੈਸਟ (MKT) ਪਿੱਠਭੂਮੀ ਦੇ ਰੰਗਾਂ ਦੁਆਰਾ ਉਜਾਗਰ ਕੀਤੇ ਗਏ ਵੱਖੋ-ਵੱਖਰੇ ਸਪਾਈਨੀ ਅਤੇ ਗੈਰ-ਸਪਾਈਨੀ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾਵਾਂ ਵਾਲੀਆਂ ਤਿੰਨ ਜੋੜਾ-ਵਿਆਹੀ ਭੈਣ ਸਪੀਸੀਜ਼ ਲਈ ਕੀਤੇ ਗਏ ਸਨ, ਜਿਨ੍ਹਾਂ ਦੇ ਮਹੱਤਵ ਦੇ ਪੱਧਰਾਂ ਨੂੰ ਕ੍ਰਮਵਾਰ ਨੀਲੇ ਅਤੇ ਲਾਲ ਫੌਂਟ ਨਾਲ p ਮੁੱਲ ਦੁਆਰਾ ਦਰਸਾਇਆ ਗਿਆ ਸੀ।ਸੱਜੇ ਪਾਸੇ, ਬੀਐਮਪੀ3 ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਵਿੱਚ ਅਮੀਨੋ ਐਸਿਡ ਬਦਲਾਂ ਦੀ ਤੁਲਨਾ, ਸਪਾਈਨੀ ਸਮੁੰਦਰੀ ਘੋੜਿਆਂ ਵਿੱਚ ਪੌਲੀਮੋਰਫਿਕ ਅਤੇ ਸਥਿਰ ਬਦਲਾਵਾਂ ਨੂੰ ਕ੍ਰਮਵਾਰ ਲਾਲ ਅਤੇ ਨੀਲੇ ਚੱਕਰਾਂ ਨਾਲ ਦਰਸਾਇਆ ਗਿਆ ਹੈ।b ਗੈਰ-ਕਟੀਦਾਰ ਸਪੀਸੀਜ਼ ਦੇ ਮੁਕਾਬਲੇ ਸਪਾਈਨੀ ਸਮੁੰਦਰੀ ਘੋੜਿਆਂ ਵਿੱਚ bmp3 ਵਿੱਚ dN/dS ਮੁੱਲਾਂ ਦੀ ਵੰਡ।c bmp3 ਦੁਆਰਾ ਏਨਕੋਡ ਕੀਤੇ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਲਈ ਪੁਨਰਗਠਿਤ ਫਾਈਲੋਜੈਨੇਟਿਕ ਟ੍ਰੀ ਵਿੱਚ ਸੁਤੰਤਰ ਵਿਕਾਸ।d ਹਿਪੋਕੈਂਪਸ ਇਰੈਕਟਸ ਵਿੱਚ bmp3 ਦੇ ਸੀਟੂ ਹਾਈਬ੍ਰਿਡਾਈਜ਼ੇਸ਼ਨ ਵਿੱਚ ਪੂਰਾ-ਮਾਉਂਟ।
ਹਵਾਲਾ
ਲੀ ਸੀ ਐਟ ਅਲ.ਜੀਨੋਮ ਕ੍ਰਮ ਗਲੋਬਲ ਡਿਸਪਰਸਲ ਰੂਟਾਂ ਨੂੰ ਪ੍ਰਗਟ ਕਰਦੇ ਹਨ ਅਤੇ ਸਮੁੰਦਰੀ ਘੋੜੇ ਦੇ ਵਿਕਾਸ ਵਿੱਚ ਕਨਵਰਜੈਂਟ ਜੈਨੇਟਿਕ ਅਨੁਕੂਲਨ ਦਾ ਸੁਝਾਅ ਦਿੰਦੇ ਹਨ।ਨੈਟ ਕਮਿਊਨ।2021 ਫਰਵਰੀ 17;12(1):1094।
ਖਬਰਾਂ ਅਤੇ ਹਾਈਲਾਈਟਸ ਇਸ ਦਾ ਉਦੇਸ਼ ਬਾਇਓਮਾਰਕਰ ਟੈਕਨੋਲੋਜੀਜ਼ ਨਾਲ ਨਵੀਨਤਮ ਸਫਲ ਮਾਮਲਿਆਂ ਨੂੰ ਸਾਂਝਾ ਕਰਨਾ, ਅਧਿਐਨ ਦੌਰਾਨ ਲਾਗੂ ਕੀਤੀਆਂ ਗਈਆਂ ਪ੍ਰਮੁੱਖ ਤਕਨੀਕਾਂ ਦੇ ਨਾਲ-ਨਾਲ ਵਿਗਿਆਨਕ ਪ੍ਰਾਪਤੀਆਂ ਨੂੰ ਹਾਸਲ ਕਰਨਾ ਹੈ।
ਪੋਸਟ ਟਾਈਮ: ਜਨਵਰੀ-06-2022