ਹੀਟਮੈਪ
ਮੈਟ੍ਰਿਕਸ ਡੇਟਾ ਫਾਈਲ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਹੀਟ ਮੈਪ ਡਰਾਇੰਗ ਲਈ ਕੀਤੀ ਜਾਂਦੀ ਹੈ, ਜੋ ਮੈਟ੍ਰਿਕਸ ਡੇਟਾ ਨੂੰ ਫਿਲਟਰ, ਸਧਾਰਣ ਅਤੇ ਕਲੱਸਟਰ ਕਰ ਸਕਦੀ ਹੈ।ਇਹ ਜ਼ਿਆਦਾਤਰ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਨਮੂਨਿਆਂ ਵਿਚਕਾਰ ਜੀਨ ਸਮੀਕਰਨ ਪੱਧਰ ਦੇ ਕਲੱਸਟਰ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਲਈ ਵਰਤਿਆ ਜਾਂਦਾ ਹੈ।
ਜੀਨ ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ
ਜੀਨ ਫੰਕਸ਼ਨ ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਡੇਟਾਬੇਸ ਦੇ ਵਿਰੁੱਧ FASTA ਫਾਈਲ ਵਿੱਚ ਕ੍ਰਮ ਮੈਪਿੰਗ ਦੁਆਰਾ ਕੀਤੀ ਜਾਂਦੀ ਹੈ।
ਜੀਨ ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ
ਮੂਲ ਸਥਾਨਕ ਅਲਾਈਨਮੈਂਟ ਖੋਜ ਟੂਲ
CDS_UTR_ਪੂਰਵ-ਅਨੁਮਾਨ
ਇਹ ਟੂਲ ਜਾਣੇ-ਪਛਾਣੇ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਡੇਟਾਬੇਸ ਅਤੇ ORF ਪੂਰਵ-ਅਨੁਮਾਨ ਦੇ ਵਿਰੁੱਧ ਧਮਾਕੇ ਦੇ ਆਧਾਰ 'ਤੇ ਦਿੱਤੇ ਗਏ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟ ਕ੍ਰਮਾਂ ਵਿੱਚ ਕੋਡਿੰਗ ਖੇਤਰਾਂ (CDS) ਅਤੇ ਗੈਰ-ਕੋਡਿੰਗ ਖੇਤਰਾਂ (UTR) ਦੀ ਭਵਿੱਖਬਾਣੀ ਕਰਨ ਲਈ ਤਿਆਰ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਹੈ।
ਮੈਨਹਟਨ ਪਲਾਟ
ਮੈਨਹਟਨ ਪਲਾਟ ਵੱਡੀ ਗਿਣਤੀ ਵਿੱਚ ਡੇਟਾ ਪੁਆਇੰਟਾਂ ਦੇ ਨਾਲ ਡੇਟਾ ਦੇ ਪ੍ਰਦਰਸ਼ਨ ਨੂੰ ਸਮਰੱਥ ਬਣਾਉਂਦਾ ਹੈ।ਇਹ ਆਮ ਤੌਰ 'ਤੇ ਜੀਨੋਮ-ਵਾਈਡ ਐਸੋਸੀਏਸ਼ਨ ਅਧਿਐਨ (GWAS) ਵਿੱਚ ਵਰਤਿਆ ਜਾਂਦਾ ਹੈ।
ਸਰਕੋਸ
CIRCOS ਡਾਇਗ੍ਰਾਮ ਜੀਨੋਮ 'ਤੇ SNP, InDeL, SV, CNV ਵੰਡਾਂ ਦੀ ਸਿੱਧੀ ਪੇਸ਼ਕਾਰੀ ਨੂੰ ਸਮਰੱਥ ਬਣਾਉਂਦਾ ਹੈ।
GO_Enrichment
TopGO ਇੱਕ ਸੰਦ ਹੈ ਜੋ ਕਾਰਜਸ਼ੀਲ ਸੰਸ਼ੋਧਨ ਲਈ ਤਿਆਰ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਹੈ।ਟੌਪਜੀਓ-ਬਾਇਓਕੰਡਕਟਰ ਪੈਕੇਜ ਵਿੱਚ ਵਿਭਿੰਨ ਸਮੀਕਰਨ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ, ਜੀਓ ਸੰਸ਼ੋਧਨ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਅਤੇ ਨਤੀਜਿਆਂ ਦੀ ਕਲਪਨਾ ਸ਼ਾਮਲ ਹੈ।ਇਹ "ਗ੍ਰਾਫ" ਨਾਮਕ ਆਉਟਪੁੱਟ ਦੇ ਨਾਲ ਇੱਕ ਫੋਲਡਰ ਤਿਆਰ ਕਰੇਗਾ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ topGO_BP, topGO_CC ਅਤੇ topGO_MF ਲਈ ਨਤੀਜੇ ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ।
ਡਬਲਯੂ.ਜੀ.ਸੀ.ਐਨ.ਏ
WGCNA ਜੀਨ ਕੋ-ਐਕਸਪ੍ਰੇਸ਼ਨ ਮੋਡੀਊਲ ਦੀ ਖੋਜ ਕਰਨ ਲਈ ਇੱਕ ਵਿਆਪਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਵਰਤਿਆ ਜਾਣ ਵਾਲਾ ਡਾਟਾ ਮਾਈਨਿੰਗ ਤਰੀਕਾ ਹੈ।ਇਹ ਮਾਈਕ੍ਰੋਏਰੇ ਡੇਟਾ ਅਤੇ ਅਗਲੀ ਪੀੜ੍ਹੀ ਦੇ ਕ੍ਰਮ ਤੋਂ ਉਤਪੰਨ ਹੋਏ ਜੀਨ ਸਮੀਕਰਨ ਡੇਟਾ ਸਮੇਤ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਸਮੀਕਰਨ ਡੇਟਾਸੈੱਟ 'ਤੇ ਲਾਗੂ ਹੁੰਦਾ ਹੈ।
ਇੰਟਰਪ੍ਰੋਸਕੈਨ
ਇੰਟਰਪ੍ਰੋ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਕ੍ਰਮ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਅਤੇ ਵਰਗੀਕਰਨ
GO_KEGG_Enrichment
ਇਹ ਟੂਲ GO ਐਨਰਿਚਮੈਂਟ ਹਿਸਟੋਗ੍ਰਾਮ, ਕੇਈਜੀਜੀ ਐਨਰਿਚਮੈਂਟ ਹਿਸਟੋਗ੍ਰਾਮ ਅਤੇ ਕੇਈਜੀਜੀ ਐਨਰੀਚਮੈਂਟ ਪਾਥਵੇਅ ਨੂੰ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕੀਤੇ ਜੀਨ ਸੈੱਟ ਅਤੇ ਸੰਬੰਧਿਤ ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ ਦੇ ਆਧਾਰ 'ਤੇ ਤਿਆਰ ਕਰਨ ਲਈ ਡਿਜ਼ਾਈਨ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਹੈ।