ਹੀਟਮੈਪ
ਹੀਟਮੈਪ ਟੂਲ ਇੱਕ ਮੈਟ੍ਰਿਕਸ ਡੇਟਾ ਫਾਈਲ ਨੂੰ ਇਨਪੁਟ ਵਜੋਂ ਸਵੀਕਾਰ ਕਰਦਾ ਹੈ ਅਤੇ ਉਪਭੋਗਤਾਵਾਂ ਨੂੰ ਡੇਟਾ ਨੂੰ ਫਿਲਟਰ ਕਰਨ, ਸਧਾਰਣ ਕਰਨ ਅਤੇ ਕਲੱਸਟਰ ਕਰਨ ਦੀ ਆਗਿਆ ਦਿੰਦਾ ਹੈ। ਹੀਟਮੈਪ ਲਈ ਪ੍ਰਾਇਮਰੀ ਵਰਤੋਂ ਦਾ ਕੇਸ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਨਮੂਨਿਆਂ ਵਿਚਕਾਰ ਜੀਨ ਪ੍ਰਗਟਾਵੇ ਦੇ ਪੱਧਰ ਦਾ ਕਲੱਸਟਰ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਹੈ।
ਜੀਨ ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ
ਜੀਨ ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ ਟੂਲ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਡੇਟਾਬੇਸਾਂ ਦੇ ਵਿਰੁੱਧ ਇਨਪੁਟ FASTA ਫਾਈਲਾਂ ਦੇ ਕ੍ਰਮ ਅਲਾਈਨਮੈਂਟ ਦੇ ਅਧਾਰ ਤੇ ਜੀਨ ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ ਕਰਦਾ ਹੈ।
ਮੁੱਢਲਾ ਸਥਾਨਕ ਅਲਾਈਨਮੈਂਟ ਖੋਜ ਟੂਲ (BLAST)
BLAST ਟੂਲ NCBI BLAST ਦਾ ਇੱਕ BMKCloud ਏਕੀਕ੍ਰਿਤ ਸੰਸਕਰਣ ਹੈ ਅਤੇ ਇਸਨੂੰ BMKCloud ਖਾਤੇ ਵਿੱਚ ਅਪਲੋਡ ਕੀਤੇ ਡੇਟਾ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਕੇ ਉਹੀ ਫੰਕਸ਼ਨ ਕਰਨ ਲਈ ਵਰਤਿਆ ਜਾ ਸਕਦਾ ਹੈ।
CDS_UTR ਭਵਿੱਖਬਾਣੀ
CDS_UTR ਭਵਿੱਖਬਾਣੀ ਟੂਲ ਨੂੰ ਜਾਣੇ-ਪਛਾਣੇ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਡੇਟਾਬੇਸਾਂ ਅਤੇ ORF ਭਵਿੱਖਬਾਣੀ ਨਤੀਜਿਆਂ ਦੇ ਵਿਰੁੱਧ BLAST ਨਤੀਜਿਆਂ ਦੇ ਅਧਾਰ ਤੇ ਦਿੱਤੇ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟ ਕ੍ਰਮਾਂ ਵਿੱਚ ਕੋਡਿੰਗ ਖੇਤਰਾਂ (CDS) ਅਤੇ ਗੈਰ-ਕੋਡਿੰਗ ਖੇਤਰਾਂ (UTR) ਦੀ ਭਵਿੱਖਬਾਣੀ ਕਰਨ ਲਈ ਤਿਆਰ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਹੈ।
ਮੈਨਹਟਨ ਪਲਾਟ
ਮੈਨਹਟਨ ਪਲਾਟ ਟੂਲ ਉੱਚ ਨਮੂਨਾ ਪ੍ਰਯੋਗਾਂ ਦੇ ਪ੍ਰਦਰਸ਼ਨ ਨੂੰ ਸਮਰੱਥ ਬਣਾਉਂਦਾ ਹੈ ਅਤੇ ਆਮ ਤੌਰ 'ਤੇ ਜੀਨੋਮ-ਵਾਈਡ ਐਸੋਸੀਏਸ਼ਨ ਸਟੱਡੀਜ਼ (GWAS) ਵਿੱਚ ਵਰਤਿਆ ਜਾਂਦਾ ਹੈ।
ਸਰਕੋਸ ਡਾਇਗ੍ਰਾਮ
CIRCOS ਡਾਇਗ੍ਰਾਮ ਟੂਲ ਜੀਨੋਮ ਵਿੱਚ ਜੀਨੋਮਿਕ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾਵਾਂ ਨੂੰ ਕਿਵੇਂ ਵੰਡਿਆ ਜਾਂਦਾ ਹੈ, ਇਸਦਾ ਕੁਸ਼ਲ ਦ੍ਰਿਸ਼ਟੀਕੋਣ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਆਮ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾਵਾਂ ਵਿੱਚ ਮਾਤਰਾਤਮਕ ਸਥਾਨ, SNPs, InDels, ਢਾਂਚਾਗਤ ਅਤੇ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਰੂਪ ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ।
ਜੀਨ ਓਨਟੋਲੋਜੀ (GO) ਸੰਸ਼ੋਧਨ
GO ਐਨਰਚਮੈਂਟ ਟੂਲ ਫੰਕਸ਼ਨਲ ਐਨਰਚਮੈਂਟ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਇਸ ਟੂਲ ਵਿੱਚ ਪ੍ਰਾਇਮਰੀ ਸਾਫਟਵੇਅਰ TopGO-ਬਾਇਓਕੰਡਕਟਰ ਪੈਕੇਜ ਹੈ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਡਿਫਰੈਂਸ਼ੀਅਲ ਐਕਸਪ੍ਰੈਸ਼ਨ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ, GO ਐਨਰਚਮੈਂਟ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਅਤੇ ਨਤੀਜਿਆਂ ਦਾ ਵਿਜ਼ੂਅਲਾਈਜ਼ੇਸ਼ਨ ਸ਼ਾਮਲ ਹੈ।
ਵੇਟਿਡ ਜੀਨ ਕੋ-ਐਕਸ਼ਪਸ਼ਨ ਨੈੱਟਵਰਕ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ (WGCNA)
WGCNA ਜੀਨ ਸਹਿ-ਪ੍ਰਗਟਾਵੇ ਮਾਡਿਊਲਾਂ ਦੀ ਖੋਜ ਲਈ ਇੱਕ ਵਿਆਪਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਵਰਤਿਆ ਜਾਣ ਵਾਲਾ ਡੇਟਾ ਮਾਈਨਿੰਗ ਤਰੀਕਾ ਹੈ। ਇਹ ਮਾਈਕ੍ਰੋਐਰੇ ਅਤੇ NGS ਜੀਨ ਪ੍ਰਗਟਾਵੇ ਡੇਟਾ ਸਮੇਤ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਸਮੀਕਰਨ ਡੇਟਾਸੈੱਟ 'ਤੇ ਲਾਗੂ ਹੁੰਦਾ ਹੈ।
ਇੰਟਰਪ੍ਰੋਸਕੈਨ
ਇੰਟਰਪ੍ਰੋਸਕੈਨ ਟੂਲ ਇੰਟਰਪ੍ਰੋ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਕ੍ਰਮ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਅਤੇ ਵਰਗੀਕਰਨ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ।
GO KEGG ਐਨਰੀਚਮੈਂਟ
GO KEGG ਐਨਰੀਚਮੈਂਟ ਟੂਲ ਇੱਕ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕੀਤੇ ਗਏ ਜੀਨ ਸੈੱਟ ਅਤੇ ਸੰਬੰਧਿਤ ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ ਦੇ ਅਧਾਰ ਤੇ ਇੱਕ GO ਐਨਰੀਚਮੈਂਟ ਹਿਸਟੋਗ੍ਰਾਮ, KEGG ਐਨਰੀਚਮੈਂਟ ਹਿਸਟੋਗ੍ਰਾਮ ਅਤੇ KEGG ਐਨਰੀਚਮੈਂਟ ਮਾਰਗ ਤਿਆਰ ਕਰਨ ਲਈ ਤਿਆਰ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਹੈ।
