ਰੈਫਰੈਂਸ ਜੀਨੋਮ ਦੇ ਨਾਲ mRNA-seq (NGS)
RNA-seq ਜੀਵਨ ਅਤੇ ਫਸਲ ਵਿਗਿਆਨ ਵਿੱਚ ਇੱਕ ਮਿਆਰੀ ਸੰਦ ਹੈ, ਜੋ ਜੀਨੋਮ ਅਤੇ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਵਿਚਕਾਰ ਪਾੜੇ ਨੂੰ ਪੂਰਾ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਇਸਦੀ ਤਾਕਤ ਨਵੀਆਂ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਾਂ ਦੀ ਖੋਜ ਕਰਨ ਅਤੇ ਇੱਕ ਪਰਖ ਵਿੱਚ ਉਹਨਾਂ ਦੇ ਪ੍ਰਗਟਾਵੇ ਨੂੰ ਮਾਪਣ ਵਿੱਚ ਹੈ। ਇਹ ਤੁਲਨਾਤਮਕ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੋਮਿਕ ਅਧਿਐਨਾਂ ਲਈ ਵਿਆਪਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਵਰਤਿਆ ਜਾਂਦਾ ਹੈ, ਵੱਖ-ਵੱਖ ਗੁਣਾਂ ਜਾਂ ਫੀਨੋਟਾਈਪਾਂ ਨਾਲ ਸਬੰਧਤ ਜੀਨਾਂ 'ਤੇ ਰੌਸ਼ਨੀ ਪਾਉਂਦਾ ਹੈ, ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਮਿਊਟੈਂਟਾਂ ਦੀ ਜੰਗਲੀ-ਕਿਸਮਾਂ ਨਾਲ ਤੁਲਨਾ ਕਰਨਾ ਜਾਂ ਖਾਸ ਸਥਿਤੀਆਂ ਵਿੱਚ ਜੀਨ ਪ੍ਰਗਟਾਵੇ ਨੂੰ ਪ੍ਰਗਟ ਕਰਨਾ। BMKCloud mRNA(Reference) APP mRNA-seq(NGS) ਬਾਇਓਇਨਫਾਰਮੈਟਿਕਸ ਪਾਈਪਲਾਈਨ ਵਿੱਚ ਪ੍ਰਗਟਾਵੇ ਦੀ ਮਾਤਰਾ, ਵਿਭਿੰਨ ਪ੍ਰਗਟਾਵੇ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ (DEG), ਅਤੇ ਕ੍ਰਮ ਬਣਤਰ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਨੂੰ ਏਕੀਕ੍ਰਿਤ ਕਰਦਾ ਹੈ ਅਤੇ ਸਮਾਨ ਸੌਫਟਵੇਅਰ ਦੀਆਂ ਸ਼ਕਤੀਆਂ ਨੂੰ ਜੋੜਦਾ ਹੈ, ਸਹੂਲਤ ਅਤੇ ਉਪਭੋਗਤਾ-ਮਿੱਤਰਤਾ ਨੂੰ ਯਕੀਨੀ ਬਣਾਉਂਦਾ ਹੈ। ਉਪਭੋਗਤਾ ਆਪਣੇ RNA-seq ਡੇਟਾ ਨੂੰ ਕਲਾਉਡ 'ਤੇ ਅਪਲੋਡ ਕਰ ਸਕਦੇ ਹਨ, ਜਿੱਥੇ ਐਪ ਇੱਕ ਵਿਆਪਕ, ਇੱਕ-ਸਟਾਪ ਬਾਇਓਇਨਫਾਰਮੈਟਿਕ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਹੱਲ ਪੇਸ਼ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਇਸ ਤੋਂ ਇਲਾਵਾ, ਇਹ ਗਾਹਕਾਂ ਦੇ ਅਨੁਭਵ ਨੂੰ ਤਰਜੀਹ ਦਿੰਦਾ ਹੈ, ਉਪਭੋਗਤਾਵਾਂ ਦੀਆਂ ਖਾਸ ਜ਼ਰੂਰਤਾਂ ਦੇ ਅਨੁਸਾਰ ਵਿਅਕਤੀਗਤ ਕਾਰਜਾਂ ਦੀ ਪੇਸ਼ਕਸ਼ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਉਪਭੋਗਤਾ ਪੈਰਾਮੀਟਰ ਸੈੱਟ ਕਰ ਸਕਦੇ ਹਨ ਅਤੇ ਪਾਈਪਲਾਈਨ ਮਿਸ਼ਨ ਆਪਣੇ ਆਪ ਜਮ੍ਹਾਂ ਕਰ ਸਕਦੇ ਹਨ, ਇੰਟਰਐਕਟਿਵ ਰਿਪੋਰਟ ਦੀ ਜਾਂਚ ਕਰ ਸਕਦੇ ਹਨ, ਡੇਟਾ/ਡਾਇਗ੍ਰਾਮ ਦੇਖ ਸਕਦੇ ਹਨ ਅਤੇ ਡੇਟਾ ਮਾਈਨਿੰਗ ਨੂੰ ਪੂਰਾ ਕਰ ਸਕਦੇ ਹਨ, ਜਿਵੇਂ ਕਿ: ਟਾਰਗੇਟ ਜੀਨ ਚੋਣ, ਫੰਕਸ਼ਨਲ ਕਲੱਸਟਰਿੰਗ, ਡਾਇਗ੍ਰਾਮਿੰਗ, ਆਦਿ।
ਪਲੇਟਫਾਰਮ:ਇਲੂਮੀਨਾ, ਐਮਜੀਆਈ
ਰਣਨੀਤੀ:ਆਰਐਨਏ-ਸੈਕਿਊ
ਲੇਆਉਟ: ਪੈਰੀਡ, ਸਾਫ਼-ਡਾਟਾ।
ਲਾਇਬ੍ਰੇਰੀ ਦੀ ਕਿਸਮ:fr-unstranded, fr-firststrand ਜਾਂ fr-secondstrand
ਪੜ੍ਹਨ ਦੀ ਲੰਬਾਈ:150 ਬੀਪੀ
ਫਾਈਲ ਕਿਸਮ:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz ਜਾਂ *.fq.gz। ਸਿਸਟਮ ਕਰੇਗਾ.fastq ਫਾਈਲਾਂ ਨੂੰ ਉਹਨਾਂ ਦੇ ਫਾਈਲ ਨਾਮਾਂ ਅਨੁਸਾਰ ਆਪਣੇ ਆਪ ਜੋੜੋ,ਉਦਾਹਰਨ ਲਈ *_1.fastq ਨੂੰ *._2.fastq ਨਾਲ ਜੋੜਿਆ ਗਿਆ।
ਨਮੂਨਿਆਂ ਦੀ ਗਿਣਤੀ:ਗਿਣਤੀ 'ਤੇ ਕੋਈ ਪਾਬੰਦੀਆਂ ਨਹੀਂ ਹਨ।ਨਮੂਨਿਆਂ ਦੀ ਗਿਣਤੀ, ਪਰ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਦਾ ਸਮਾਂ ਗਿਣਤੀ ਦੇ ਨਾਲ ਵਧੇਗਾਨਮੂਨੇ ਵਧਦੇ ਹਨ।
ਸਿਫ਼ਾਰਸ਼ੀ ਡੇਟਾ ਮਾਤਰਾ:ਪ੍ਰਤੀ ਨਮੂਨਾ 6G
