ਪਲਾਂਟ/ਐਨੀਮਲ ਡੀ ਨੋਵੋ ਜੀਨੋਮ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ
ਦੇ ਨੋਵੋਸੀਕੁਐਂਸਿੰਗ ਦਾ ਮਤਲਬ ਹੈ ਕਿਸੇ ਪ੍ਰਜਾਤੀ ਦੇ ਪੂਰੇ ਜੀਨੋਮ ਨੂੰ ਇੱਕ ਸੰਦਰਭ ਜੀਨੋਮ ਦੀ ਅਣਹੋਂਦ ਵਿੱਚ ਸੀਕੁਐਂਸਿੰਗ ਤਕਨਾਲੋਜੀਆਂ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਕੇ ਬਣਾਉਣਾ। ਤੀਜੀ-ਪੀੜ੍ਹੀ ਦੇ ਸੀਕੁਐਂਸਿੰਗ ਦੀ ਸ਼ੁਰੂਆਤ ਅਤੇ ਵਿਆਪਕ ਗੋਦ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਲੰਬੇ ਰੀਡ ਹਨ, ਨੇ ਰੀਡਾਂ ਵਿਚਕਾਰ ਓਵਰਲੈਪ ਵਧਾ ਕੇ ਜੀਨੋਮ ਅਸੈਂਬਲੀ ਨੂੰ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ ਵਧਾਇਆ ਹੈ। ਇਹ ਵਾਧਾ ਖਾਸ ਤੌਰ 'ਤੇ ਚੁਣੌਤੀਪੂਰਨ ਜੀਨੋਮ ਨਾਲ ਨਜਿੱਠਣ ਵੇਲੇ ਢੁਕਵਾਂ ਹੁੰਦਾ ਹੈ, ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਉੱਚ ਹੇਟਰੋਜ਼ਾਈਗੋਸਿਟੀ, ਦੁਹਰਾਉਣ ਵਾਲੇ ਖੇਤਰਾਂ ਦਾ ਉੱਚ ਅਨੁਪਾਤ, ਪੌਲੀਪਲੋਇਡ, ਅਤੇ ਦੁਹਰਾਉਣ ਵਾਲੇ ਤੱਤਾਂ ਵਾਲੇ ਖੇਤਰ, ਅਸਧਾਰਨ GC ਸਮੱਗਰੀ, ਜਾਂ ਉੱਚ ਜਟਿਲਤਾ ਜੋ ਆਮ ਤੌਰ 'ਤੇ ਸਿਰਫ਼ ਸ਼ਾਰਟ-ਰੀਡ ਸੀਕੁਐਂਸਿੰਗ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਕੇ ਮਾੜੀ ਤਰ੍ਹਾਂ ਇਕੱਠੇ ਕੀਤੇ ਜਾਂਦੇ ਹਨ।
ਸਾਡਾ ਵਨ-ਸਟਾਪ ਹੱਲ ਏਕੀਕ੍ਰਿਤ ਸੀਕੁਐਂਸਿੰਗ ਸੇਵਾਵਾਂ ਅਤੇ ਬਾਇਓਇਨਫਾਰਮੈਟਿਕ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ ਜੋ ਇੱਕ ਉੱਚ-ਗੁਣਵੱਤਾ ਵਾਲਾ ਡੀ ਨੋਵੋ ਅਸੈਂਬਲਡ ਜੀਨੋਮ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਇਲੂਮੀਨਾ ਦੇ ਨਾਲ ਇੱਕ ਸ਼ੁਰੂਆਤੀ ਜੀਨੋਮ ਸਰਵੇਖਣ ਜੀਨੋਮ ਦੇ ਆਕਾਰ ਅਤੇ ਜਟਿਲਤਾ ਦੇ ਅਨੁਮਾਨ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ, ਅਤੇ ਇਸ ਜਾਣਕਾਰੀ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਪੈਕਬੀਓ ਹਾਈਫਾਈ ਨਾਲ ਲੰਬੇ ਸਮੇਂ ਤੋਂ ਪੜ੍ਹੇ ਜਾਣ ਵਾਲੇ ਸੀਕੁਐਂਸਿੰਗ ਦੇ ਅਗਲੇ ਪੜਾਅ ਦੀ ਅਗਵਾਈ ਕਰਨ ਲਈ ਕੀਤੀ ਜਾਂਦੀ ਹੈ, ਜਿਸ ਤੋਂ ਬਾਅਦਨਵਾਂ ਕੀ ਹੈਕੰਟਿਗਜ਼ ਦਾ ਇਕੱਠ। HiC ਅਸੈਂਬਲੀ ਦੀ ਬਾਅਦ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕੰਟਿਗਜ਼ ਨੂੰ ਜੀਨੋਮ ਨਾਲ ਜੋੜਨ ਦੇ ਯੋਗ ਬਣਾਉਂਦੀ ਹੈ, ਇੱਕ ਕ੍ਰੋਮੋਸੋਮ-ਪੱਧਰੀ ਅਸੈਂਬਲੀ ਪ੍ਰਾਪਤ ਕਰਦੀ ਹੈ। ਅੰਤ ਵਿੱਚ, ਜੀਨੋਮ ਨੂੰ ਜੀਨ ਪੂਰਵ-ਅਨੁਮਾਨ ਦੁਆਰਾ ਅਤੇ ਪ੍ਰਗਟ ਕੀਤੇ ਜੀਨਾਂ ਨੂੰ ਕ੍ਰਮਬੱਧ ਕਰਕੇ, ਛੋਟੇ ਅਤੇ ਲੰਬੇ ਪਾਠਾਂ ਵਾਲੇ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੋਮਜ਼ ਦਾ ਸਹਾਰਾ ਲੈ ਕੇ ਐਨੋਟੇਟ ਕੀਤਾ ਜਾਂਦਾ ਹੈ।
ਸੇਵਾ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾਵਾਂ
● ਇੱਕ-ਸਟਾਪ ਹੱਲ ਵਿੱਚ ਮਲਟੀਪਲ ਸੀਕੁਐਂਸਿੰਗ ਅਤੇ ਬਾਇਓਇਨਫਾਰਮੈਟਿਕ ਸੇਵਾਵਾਂ ਦਾ ਏਕੀਕਰਨ:
ਜੀਨੋਮ ਦੇ ਆਕਾਰ ਦਾ ਅੰਦਾਜ਼ਾ ਲਗਾਉਣ ਅਤੇ ਅਗਲੇ ਕਦਮਾਂ ਦੀ ਅਗਵਾਈ ਕਰਨ ਲਈ ਇਲੂਮੀਨਾ ਨਾਲ ਜੀਨੋਮ ਸਰਵੇਖਣ;
ਲਈ ਲੰਮੀ ਪੜ੍ਹਾਈ ਦੀ ਕ੍ਰਮਬੱਧਤਾਨਵਾਂ ਕੀ ਹੈਕੰਟਿਗਜ਼ ਦੀ ਅਸੈਂਬਲੀ;
ਕ੍ਰੋਮੋਸੋਮ ਐਂਕਰਿੰਗ ਲਈ ਹਾਈ-ਸੀ ਸੀਕੁਐਂਸਿੰਗ;
ਜੀਨਾਂ ਦੀ ਵਿਆਖਿਆ ਲਈ mRNA ਸੀਕੁਐਂਸਿੰਗ;
ਅਸੈਂਬਲੀ ਦੀ ਪ੍ਰਮਾਣਿਕਤਾ।
● ਦਿਲਚਸਪੀ ਵਾਲੀਆਂ ਪ੍ਰਜਾਤੀਆਂ ਲਈ ਨਵੇਂ ਜੀਨੋਮ ਬਣਾਉਣ ਜਾਂ ਮੌਜੂਦਾ ਸੰਦਰਭ ਜੀਨੋਮ ਦੇ ਸੁਧਾਰ ਲਈ ਢੁਕਵੀਂ ਸੇਵਾ।
ਸੇਵਾ ਦੇ ਫਾਇਦੇ
ਵਿੱਚ ਸੀਕੁਐਂਸਿੰਗ ਪਲੇਟਫਾਰਮਾਂ ਅਤੇ ਬਾਇਓਇਨਫਾਰਮੈਟਿਕਸ ਦਾ ਵਿਕਾਸਨਵਾਂ ਕੀ ਹੈਜੀਨੋਮ ਅਸੈਂਬਲੀ
(ਅਮਰਸਿੰਘੇ ਐਸ.ਐਲ. ਆਦਿ,ਜੀਨੋਮ ਜੀਵ ਵਿਗਿਆਨ(2020)
●ਵਿਆਪਕ ਮੁਹਾਰਤ ਅਤੇ ਪ੍ਰਕਾਸ਼ਨ ਰਿਕਾਰਡ: BMKGene ਨੇ ਵਿਭਿੰਨ ਪ੍ਰਜਾਤੀਆਂ ਦੇ ਉੱਚ-ਗੁਣਵੱਤਾ ਵਾਲੇ ਜੀਨੋਮ ਅਸੈਂਬਲੀ ਵਿੱਚ ਵਿਸ਼ਾਲ ਤਜਰਬਾ ਇਕੱਠਾ ਕੀਤਾ ਹੈ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਡਿਪਲੋਇਡ ਜੀਨੋਮ ਅਤੇ ਪੌਲੀਪਲਾਇਡ ਅਤੇ ਐਲੋਪੋਲਾਇਡ ਪ੍ਰਜਾਤੀਆਂ ਦੇ ਬਹੁਤ ਹੀ ਗੁੰਝਲਦਾਰ ਜੀਨੋਮ ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ। 2018 ਤੋਂ, ਅਸੀਂ ਵੱਧ ਤੋਂ ਵੱਧ ਯੋਗਦਾਨ ਪਾਇਆ ਹੈ300 ਉੱਚ-ਪ੍ਰਭਾਵ ਪ੍ਰਕਾਸ਼ਨ, ਅਤੇ ਉਨ੍ਹਾਂ ਵਿੱਚੋਂ 20+ ਨੇਚਰ ਜੈਨੇਟਿਕਸ ਵਿੱਚ ਪ੍ਰਕਾਸ਼ਿਤ ਹਨ।.
● ਇੱਕ-ਸਟਾਪ ਹੱਲ: ਸਾਡਾ ਏਕੀਕ੍ਰਿਤ ਦ੍ਰਿਸ਼ਟੀਕੋਣ ਮਲਟੀਪਲ ਸੀਕੁਐਂਸਿੰਗ ਤਕਨਾਲੋਜੀਆਂ ਅਤੇ ਬਾਇਓਇਨਫਾਰਮੈਟਿਕ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣਾਂ ਨੂੰ ਇੱਕ ਸੁਮੇਲ ਵਰਕਫਲੋ ਵਿੱਚ ਜੋੜਦਾ ਹੈ, ਇੱਕ ਉੱਚ-ਗੁਣਵੱਤਾ ਵਾਲਾ ਇਕੱਠਾ ਕੀਤਾ ਜੀਨੋਮ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ।
●ਤੁਹਾਡੀਆਂ ਜ਼ਰੂਰਤਾਂ ਅਨੁਸਾਰ ਤਿਆਰ ਕੀਤਾ ਗਿਆ: ਸਾਡਾ ਸੇਵਾ ਵਰਕਫਲੋ ਅਨੁਕੂਲਿਤ ਹੈ, ਜੋ ਵਿਭਿੰਨ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾਵਾਂ ਅਤੇ ਖਾਸ ਖੋਜ ਜ਼ਰੂਰਤਾਂ ਵਾਲੇ ਜੀਨੋਮ ਲਈ ਅਨੁਕੂਲਤਾ ਦੀ ਆਗਿਆ ਦਿੰਦਾ ਹੈ। ਇਸ ਵਿੱਚ ਵਿਸ਼ਾਲ ਜੀਨੋਮ, ਪੌਲੀਪਲੌਇਡ ਜੀਨੋਮ, ਬਹੁਤ ਜ਼ਿਆਦਾ ਵਿਭਿੰਨ ਜੀਨੋਮ, ਅਤੇ ਹੋਰ ਬਹੁਤ ਕੁਝ ਸ਼ਾਮਲ ਹੈ।
●ਬਹੁਤ ਹੁਨਰਮੰਦ ਬਾਇਓਇਨਫਾਰਮੈਟਿਕਸ ਅਤੇ ਲੈਬਾਰਟਰੀ ਟੀਮ: ਗੁੰਝਲਦਾਰ ਜੀਨੋਮ ਅਸੈਂਬਲੀਆਂ ਦੇ ਪ੍ਰਯੋਗਾਤਮਕ ਅਤੇ ਬਾਇਓਇਨਫਾਰਮੈਟਿਕਸ ਦੋਵਾਂ ਵਿੱਚ ਵਧੀਆ ਅਨੁਭਵ ਅਤੇ ਪੇਟੈਂਟਾਂ ਅਤੇ ਸਾਫਟਵੇਅਰ ਕਾਪੀਰਾਈਟਾਂ ਦੀ ਇੱਕ ਲੜੀ ਦੇ ਨਾਲ।
●ਵਿਕਰੀ ਤੋਂ ਬਾਅਦ ਸਹਾਇਤਾ:ਸਾਡੀ ਵਚਨਬੱਧਤਾ ਪ੍ਰੋਜੈਕਟ ਦੇ ਮੁਕੰਮਲ ਹੋਣ ਤੋਂ ਪਰੇ 3-ਮਹੀਨੇ ਦੀ ਵਿਕਰੀ ਤੋਂ ਬਾਅਦ ਸੇਵਾ ਦੀ ਮਿਆਦ ਦੇ ਨਾਲ ਫੈਲੀ ਹੋਈ ਹੈ। ਇਸ ਸਮੇਂ ਦੌਰਾਨ, ਅਸੀਂ ਨਤੀਜਿਆਂ ਨਾਲ ਸਬੰਧਤ ਕਿਸੇ ਵੀ ਪ੍ਰਸ਼ਨਾਂ ਦੇ ਹੱਲ ਲਈ ਪ੍ਰੋਜੈਕਟ ਫਾਲੋ-ਅਪ, ਸਮੱਸਿਆ ਨਿਪਟਾਰਾ ਸਹਾਇਤਾ, ਅਤੇ ਪ੍ਰਸ਼ਨ ਅਤੇ ਉੱਤਰ ਸੈਸ਼ਨਾਂ ਦੀ ਪੇਸ਼ਕਸ਼ ਕਰਦੇ ਹਾਂ।
ਸੇਵਾ ਨਿਰਧਾਰਨ
| ਜੀਨੋਮ ਸਰਵੇਖਣ | ਜੀਨੋਮ ਅਸੈਂਬਲੀ | ਕ੍ਰੋਮੋਸੋਮ-ਪੱਧਰ | ਜੀਨੋਮ ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ |
| 50X ਇਲੂਮਿਨਾ ਨੋਵਾਸੇਕ PE150
| 30X PacBio CCS HiFi ਰੀਡਜ਼ | 100X ਹਾਈ-ਸੀ | RNA-seq ਇਲੂਮਿਨਾ PE150 10 Gb + (ਵਿਕਲਪਿਕ) ਪੂਰੀ ਲੰਬਾਈ ਵਾਲਾ RNA-seq PacBio 40 Gb ਜਾਂ ਨੈਨੋਪੋਰ 12 ਜੀ.ਬੀ. |
ਸੇਵਾ ਦੀਆਂ ਜ਼ਰੂਰਤਾਂ
ਜੀਨੋਮ ਸਰਵੇਖਣ, ਜੀਨੋਮ ਅਸੈਂਬਲੀ ਅਤੇ ਹਾਈ-ਸੀ ਅਸੈਂਬਲੀ ਲਈ:
| ਟਿਸ਼ੂ ਜਾਂ ਕੱਢੇ ਗਏ ਨਿਊਕਲੀਕ ਐਸਿਡ | ਜੀਨੋਮ ਸਰਵੇਖਣ | ਪੈਕਬਿਓ ਨਾਲ ਜੀਨੋਮ ਅਸੈਂਬਲੀ | ਹਾਈ-ਸੀ ਅਸੈਂਬਲੀ |
| ਜਾਨਵਰ ਵਿਸੇਰਾ | 0.5-1 ਗ੍ਰਾਮ
| ≥ 3.5 ਗ੍ਰਾਮ | ≥2 ਗ੍ਰਾਮ |
| ਜਾਨਵਰ ਮਾਸਪੇਸ਼ੀ | ≥ 5 ਗ੍ਰਾਮ | ||
| ਥਣਧਾਰੀ ਖੂਨ | 1.5 ਮਿ.ਲੀ.
| ≥ 5 ਮਿ.ਲੀ. | ≥2 ਮਿ.ਲੀ. |
| ਪੋਲਟਰੀ/ਮੱਛੀ ਦਾ ਖੂਨ | ≥ 0.5 ਮਿ.ਲੀ. | ||
| ਪੌਦਾ- ਤਾਜ਼ੇ ਪੱਤੇ | 1-2 ਗ੍ਰਾਮ | ≥ 5 ਗ੍ਰਾਮ | ≥ 4 ਗ੍ਰਾਮ |
| ਸੰਸਕ੍ਰਿਤ ਸੈੱਲ |
| ≥ 1x108 | ≥ 1x107 |
| ਕੀੜਾ | 0.5-1 ਗ੍ਰਾਮ | ≥ 3 ਗ੍ਰਾਮ | ≥ 2 ਗ੍ਰਾਮ |
| ਕੱਢਿਆ ਗਿਆ ਡੀਐਨਏ | ਇਕਾਗਰਤਾ: ≥1 ng/ µL ਮਾਤਰਾ ≥ 30 ਨਗ ਸੀਮਤ ਜਾਂ ਕੋਈ ਗਿਰਾਵਟ ਜਾਂ ਪ੍ਰਦੂਸ਼ਣ ਨਹੀਂ | ਗਾੜ੍ਹਾਪਣ: ≥ 50 ng/ µL ਮਾਤਰਾ: 10 µg/ਫਲੋ ਸੈੱਲ/ਨਮੂਨਾ OD260/280=1.7-2.2 OD260/230=1.8-2.5 ਸੀਮਤ ਜਾਂ ਕੋਈ ਗਿਰਾਵਟ ਜਾਂ ਪ੍ਰਦੂਸ਼ਣ ਨਹੀਂ |
-
|
ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੌਮਿਕਸ ਦੇ ਨਾਲ ਜੀਨੋਮ ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ ਲਈ:
| ਟਿਸ਼ੂ ਜਾਂ ਕੱਢੇ ਗਏ ਨਿਊਕਲੀਕ ਐਸਿਡ | ਇਲੂਮੀਨਾ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੋਮ | ਪੈਕਬਾਇਓ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੋਮ | ਨੈਨੋਪੋਰ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੋਮ |
| ਪੌਦਾ- ਜੜ੍ਹ/ਤਣਾ/ਪੱਟੀ | 450 ਮਿਲੀਗ੍ਰਾਮ | 600 ਮਿਲੀਗ੍ਰਾਮ | |
| ਪੌਦਾ - ਪੱਤਾ/ਬੀਜ | 300 ਮਿਲੀਗ੍ਰਾਮ | 300 ਮਿਲੀਗ੍ਰਾਮ | |
| ਪੌਦਾ - ਫਲ | 1.2 ਗ੍ਰਾਮ | 1.2 ਗ੍ਰਾਮ | |
| ਜਾਨਵਰ ਦਾ ਦਿਲ/ਅੰਤੜੀ | 300 ਮਿਲੀਗ੍ਰਾਮ | 300 ਮਿਲੀਗ੍ਰਾਮ | |
| ਜਾਨਵਰਾਂ ਦਾ ਵਿਸੇਰਾ/ਦਿਮਾਗ | 240 ਮਿਲੀਗ੍ਰਾਮ | 240 ਮਿਲੀਗ੍ਰਾਮ | |
| ਜਾਨਵਰ ਮਾਸਪੇਸ਼ੀ | 450 ਮਿਲੀਗ੍ਰਾਮ | 450 ਮਿਲੀਗ੍ਰਾਮ | |
| ਜਾਨਵਰਾਂ ਦੀਆਂ ਹੱਡੀਆਂ/ਵਾਲ/ਚਮੜੀ | 1 ਗ੍ਰਾਮ | 1 ਗ੍ਰਾਮ | |
| ਆਰਥਰੋਪੌਡ - ਕੀਟ | 6 | 6 | |
| ਆਰਥਰੋਪੌਡ - ਕਰਸਟੇਸੀਆ | 300 ਮਿਲੀਗ੍ਰਾਮ | 300 ਮਿਲੀਗ੍ਰਾਮ | |
| ਪੂਰਾ ਖੂਨ | 1 ਟਿਊਬ | 1 ਟਿਊਬ | |
| ਕੱਢਿਆ ਗਿਆ RNA | ਗਾੜ੍ਹਾਪਣ: ≥ 20 ng/ µL ਮਾਤਰਾ ≥ 0.3 µg OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 ਆਰਆਈਐਨ≥ 6 5≥28S/18S≥1 | ਇਕਾਗਰਤਾ: ≥ 100 ng/ µL ਮਾਤਰਾ ≥ 0.75 µg OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 ਆਰਆਈਐਨ≥ 8 5≥28S/18S≥1 | ਇਕਾਗਰਤਾ: ≥ 100 ng/ µL ਮਾਤਰਾ ≥ 0.75 µg OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 ਆਰਆਈਐਨ≥ 7.5 5≥28S/18S≥1 |
ਸਿਫ਼ਾਰਸ਼ੀ ਨਮੂਨਾ ਡਿਲੀਵਰੀ
ਕੰਟੇਨਰ: 2 ਮਿ.ਲੀ. ਸੈਂਟਰਿਫਿਊਜ ਟਿਊਬ (ਟਿਨ ਫੋਇਲ ਦੀ ਸਿਫ਼ਾਰਸ਼ ਨਹੀਂ ਕੀਤੀ ਜਾਂਦੀ)
(ਜ਼ਿਆਦਾਤਰ ਨਮੂਨਿਆਂ ਲਈ, ਅਸੀਂ ਈਥਾਨੌਲ ਵਿੱਚ ਸੁਰੱਖਿਅਤ ਨਾ ਰੱਖਣ ਦੀ ਸਿਫਾਰਸ਼ ਕਰਦੇ ਹਾਂ।)
ਨਮੂਨਾ ਲੇਬਲਿੰਗ: ਨਮੂਨਿਆਂ 'ਤੇ ਸਪੱਸ਼ਟ ਤੌਰ 'ਤੇ ਲੇਬਲ ਲਗਾਇਆ ਜਾਣਾ ਚਾਹੀਦਾ ਹੈ ਅਤੇ ਜਮ੍ਹਾਂ ਕੀਤੇ ਗਏ ਨਮੂਨਾ ਜਾਣਕਾਰੀ ਫਾਰਮ ਦੇ ਸਮਾਨ ਹੋਣਾ ਚਾਹੀਦਾ ਹੈ।
ਸ਼ਿਪਮੈਂਟ: ਸੁੱਕੀ-ਬਰਫ਼: ਨਮੂਨਿਆਂ ਨੂੰ ਪਹਿਲਾਂ ਬੈਗਾਂ ਵਿੱਚ ਪੈਕ ਕਰਨ ਅਤੇ ਸੁੱਕੀ-ਬਰਫ਼ ਵਿੱਚ ਦੱਬਣ ਦੀ ਲੋੜ ਹੁੰਦੀ ਹੈ।
ਵਰਕਫਲੋ
ਸੇਵਾ ਕਾਰਜ ਪ੍ਰਵਾਹ
ਪ੍ਰਯੋਗ ਡਿਜ਼ਾਈਨ
ਨਮੂਨਾ ਡਿਲੀਵਰੀ
ਡੀਐਨਏ ਕੱਢਣਾ
ਲਾਇਬ੍ਰੇਰੀ ਨਿਰਮਾਣ
ਕ੍ਰਮ
ਡਾਟਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ
ਵਿਕਰੀ ਤੋਂ ਬਾਅਦ ਦੀਆਂ ਸੇਵਾਵਾਂ
ਪੂਰਾ ਬਾਇਓਇਨਫਾਰਮੈਟਿਕ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ, 4 ਪੜਾਵਾਂ ਵਿੱਚ ਵੰਡਿਆ ਹੋਇਆ:
1) ਜੀਨੋਮ ਸਰਵੇਖਣ, NGS ਨਾਲ k-mer ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ 'ਤੇ ਅਧਾਰਤ, ਪੜ੍ਹਦਾ ਹੈ:
ਜੀਨੋਮ ਦੇ ਆਕਾਰ ਦਾ ਅਨੁਮਾਨ
ਹੇਟਰੋਜ਼ਾਈਗੋਸਿਟੀ ਦਾ ਅਨੁਮਾਨ
ਦੁਹਰਾਉਣ ਵਾਲੇ ਖੇਤਰਾਂ ਦਾ ਅਨੁਮਾਨ
2) PacBio HiFi ਨਾਲ ਜੀਨੋਮ ਅਸੈਂਬਲੀ:
ਨਵਾਂਅਸੈਂਬਲੀ
ਅਸੈਂਬਲੀ ਮੁਲਾਂਕਣ: ਜੀਨੋਮ ਸੰਪੂਰਨਤਾ ਲਈ BUSCO ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਅਤੇ NGS ਅਤੇ PacBio HiFi ਰੀਡਜ਼ ਦੀ ਮੈਪਿੰਗ ਸਮੇਤ
3) ਹਾਈ-ਸੀ ਅਸੈਂਬਲੀ:
ਹਾਈ-ਸੀ ਲਾਇਬ੍ਰੇਰੀ QC: ਵੈਧ ਹਾਈ-ਸੀ ਪਰਸਪਰ ਪ੍ਰਭਾਵ ਦਾ ਅਨੁਮਾਨ
ਹਾਈ-ਸੀ ਅਸੈਂਬਲੀ: ਸਮੂਹਾਂ ਵਿੱਚ ਕੰਟੀਗ ਦਾ ਕਲੱਸਟਰਿੰਗ, ਇਸਦੇ ਬਾਅਦ ਹਰੇਕ ਸਮੂਹ ਦੇ ਅੰਦਰ ਕੰਟੀਗ ਕ੍ਰਮ ਅਤੇ ਕੰਟੀਗ ਸਥਿਤੀ ਨਿਰਧਾਰਤ ਕਰਨਾ।
ਹਾਈ-ਸੀ ਮੁਲਾਂਕਣ
4) ਜੀਨੋਮ ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ:
ਗੈਰ-ਕੋਡਿੰਗ RNA ਭਵਿੱਖਬਾਣੀ
ਦੁਹਰਾਉਣ ਵਾਲੇ ਕ੍ਰਮਾਂ ਦੀ ਪਛਾਣ (ਟ੍ਰਾਂਸਪੋਜ਼ਨ ਅਤੇ ਟੈਂਡਮ ਦੁਹਰਾਓ)
ਜੀਨ ਭਵਿੱਖਬਾਣੀ
§ਨਵਾਂ: ਸ਼ੁਰੂਆਤੀ ਐਲਗੋਰਿਦਮ
§ ਸਮਰੂਪਤਾ ਦੇ ਆਧਾਰ 'ਤੇ
§ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੋਮ ਦੇ ਆਧਾਰ 'ਤੇ, ਲੰਬੇ ਅਤੇ ਛੋਟੇ ਪਾਠਾਂ ਦੇ ਨਾਲ: ਪਾਠ ਹਨਨਵਾਂ ਕੀ ਹੈਡਰਾਫਟ ਜੀਨੋਮ ਨਾਲ ਇਕੱਠਾ ਕੀਤਾ ਜਾਂ ਮੈਪ ਕੀਤਾ ਗਿਆ
§ ਕਈ ਡੇਟਾਬੇਸਾਂ ਦੇ ਨਾਲ ਅਨੁਮਾਨਿਤ ਜੀਨਾਂ ਦੀ ਵਿਆਖਿਆ
1) ਜੀਨੋਮ ਸਰਵੇਖਣ- ਕੇ-ਮੇਰ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ
2) ਜੀਨੋਮ ਅਸੈਂਬਲੀ
2) ਜੀਨੋਮ ਅਸੈਂਬਲੀ - ਪੈਕਬਿਓ ਹਾਈਫਾਈ ਡਰਾਫਟ ਅਸੈਂਬਲੀ ਲਈ ਮੈਪਿੰਗ ਪੜ੍ਹਦਾ ਹੈ
2) ਹਾਈ-ਸੀ ਅਸੈਂਬਲੀ - ਹਾਈ-ਸੀ ਵੈਧ ਇੰਟਰਐਕਸ਼ਨ ਜੋੜਿਆਂ ਦਾ ਅਨੁਮਾਨ
3) ਹਾਈ-ਸੀ ਪੋਸਟ-ਅਸੈਂਬਲੀ ਮੁਲਾਂਕਣ
4) ਜੀਨੋਮ ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ - ਅਨੁਮਾਨਿਤ ਜੀਨਾਂ ਦਾ ਏਕੀਕਰਨ
4) ਜੀਨੋਮ ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ - ਅਨੁਮਾਨਿਤ ਜੀਨ ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ
ਪ੍ਰਕਾਸ਼ਨਾਂ ਦੇ ਇੱਕ ਕਿਉਰੇਟਿਡ ਸੰਗ੍ਰਹਿ ਰਾਹੀਂ BMKGene ਦੀਆਂ ਡੀ ਨੋਵੋ ਜੀਨੋਮ ਅਸੈਂਬਲੀ ਸੇਵਾਵਾਂ ਦੁਆਰਾ ਸੁਵਿਧਾਜਨਕ ਤਰੱਕੀਆਂ ਦੀ ਪੜਚੋਲ ਕਰੋ:
ਲੀ, ਸੀ. ਐਟ ਅਲ. (2021) 'ਜੀਨੋਮ ਕ੍ਰਮ ਗਲੋਬਲ ਫੈਲਾਅ ਰੂਟਾਂ ਨੂੰ ਪ੍ਰਗਟ ਕਰਦੇ ਹਨ ਅਤੇ ਸਮੁੰਦਰੀ ਘੋੜਿਆਂ ਦੇ ਵਿਕਾਸ ਵਿੱਚ ਕਨਵਰਜੈਂਟ ਜੈਨੇਟਿਕ ਅਨੁਕੂਲਨ ਦਾ ਸੁਝਾਅ ਦਿੰਦੇ ਹਨ', ਨੇਚਰ ਕਮਿਊਨੀਕੇਸ਼ਨਜ਼, 12(1). doi: 10.1038/S41467-021-21379-X।
ਲੀ, ਵਾਈ. ਐਟ ਅਲ. (2023) 'ਵੱਡੇ ਪੈਮਾਨੇ ਦੇ ਕ੍ਰੋਮੋਸੋਮਲ ਬਦਲਾਅ ਜੀਨੋਮ-ਪੱਧਰ ਦੇ ਪ੍ਰਗਟਾਵੇ ਵਿੱਚ ਤਬਦੀਲੀਆਂ, ਵਾਤਾਵਰਣ ਅਨੁਕੂਲਨ, ਅਤੇ ਗੇਅਲ (ਬੋਸ ਫਰੰਟਾਲਿਸ) ਵਿੱਚ ਪ੍ਰਜਾਤੀ ਵੱਲ ਲੈ ਜਾਂਦੇ ਹਨ', ਅਣੂ ਜੀਵ ਵਿਗਿਆਨ ਅਤੇ ਵਿਕਾਸ, 40(1). doi: 10.1093/MOLBEV/MSAD006।
ਤਿਆਨ, ਟੀ. ਐਟ ਅਲ. (2023) 'ਜੀਨੋਮ ਅਸੈਂਬਲੀ ਅਤੇ ਇੱਕ ਪ੍ਰਮੁੱਖ ਸੋਕਾ-ਰੋਧਕ ਮੱਕੀ ਦੇ ਜਰਮਪਲਾਜ਼ਮ ਦਾ ਜੈਨੇਟਿਕ ਵਿਭਾਜਨ', ਨੇਚਰ ਜੈਨੇਟਿਕਸ 2023 55:3, 55(3), ਪੰਨੇ 496–506। doi: 10.1038/s41588-023-01297-y।
ਝਾਂਗ, ਐੱਫ. ਐਟ ਅਲ. (2023) 'ਸੋਲਾਨੇਸੀ ਪਰਿਵਾਰ ਵਿੱਚ ਦੋ ਜੀਨੋਮ ਦਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕਰਕੇ ਟ੍ਰੋਪੇਨ ਐਲਕਾਲਾਇਡ ਬਾਇਓਸਿੰਥੇਸਿਸ ਦੇ ਵਿਕਾਸ ਦਾ ਖੁਲਾਸਾ', ਨੇਚਰ ਕਮਿਊਨੀਕੇਸ਼ਨਜ਼ 2023 14:1, 14(1), ਪੰਨੇ 1–18. doi: 10.1038/s41467-023-37133-4।
ਚੁਣੌਤੀਪੂਰਨ ਕੇਸ-ਸਟੱਡੀਜ਼:
ਟੈਲੋਮੀਅਰ-ਤੋਂ-ਟੈਲੋਮੀਅਰ ਅਸੈਂਬਲੀ:ਫੂ, ਏ. ਐਟ ਅਲ. (2023) 'ਕੁੱਟੇ ਖਰਬੂਜੇ (ਮੋਮੋਰਡਿਕਾ ਚਾਰੰਟੀਆ ਐਲ. ਵਰ. ਸੰਖੇਪ ਸਰ.) ਦਾ ਟੈਲੋਮੇਰ-ਟੂ-ਟੈਲੋਮੇਰ ਜੀਨੋਮ ਅਸੈਂਬਲੀ ਫਲ ਵਿਕਾਸ, ਰਚਨਾ ਅਤੇ ਪੱਕਣ ਦੀਆਂ ਜੈਨੇਟਿਕ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾਵਾਂ ਨੂੰ ਪ੍ਰਗਟ ਕਰਦਾ ਹੈ', ਬਾਗਬਾਨੀ ਖੋਜ, 10(1). doi: 10.1093/HR/UHAC228।
ਹੈਪਲੋਟਾਈਪ ਅਸੈਂਬਲੀ:ਹੂ, ਡਬਲਯੂ. ਐਟ ਅਲ. (2021) 'ਐਲੀਲ-ਪ੍ਰਭਾਸ਼ਿਤ ਜੀਨੋਮ ਕਸਾਵਾ ਵਿਕਾਸ ਦੌਰਾਨ ਬਾਇਲੇਲਿਕ ਭਿੰਨਤਾ ਨੂੰ ਪ੍ਰਗਟ ਕਰਦਾ ਹੈ', ਮੌਲੀਕਿਊਲਰ ਪਲਾਂਟ, 14(6), ਪੰਨੇ 851–854। doi: 10.1016/j.molp.2021.04.009।
ਵਿਸ਼ਾਲ ਜੀਨੋਮ ਅਸੈਂਬਲੀ:ਯੂਆਨ, ਜੇ. ਐਟ ਅਲ. (2022) 'ਰੁੱਖ ਦੇ ਪੀਓਨੀ ਪਾਓਨੀਆ ਓਸਟੀ ਦੇ ਗੀਗਾ-ਕ੍ਰੋਮੋਸੋਮ ਅਤੇ ਗੀਗਾ-ਜੀਨੋਮ ਦਾ ਜੀਨੋਮਿਕ ਆਧਾਰ', ਨੇਚਰ ਕਮਿਊਨੀਕੇਸ਼ਨਜ਼ 2022 13:1, 13(1), ਪੰਨੇ 1–16। doi: 10.1038/s41467-022-35063-1।
ਪੌਲੀਪਲਾਇਡ ਜੀਨੋਮ ਅਸੈਂਬਲੀ:ਝਾਂਗ, ਕਿਊ. ਐਟ ਅਲ. (2022) 'ਆਟੋਪੋਲੀਪਲੋਇਡ ਗੰਨੇ ਸੈਕਰਮ ਸਪੋਂਟੇਨੀਅਮ ਦੇ ਹਾਲੀਆ ਕ੍ਰੋਮੋਸੋਮ ਕਮੀ ਵਿੱਚ ਜੀਨੋਮਿਕ ਸੂਝ', ਨੇਚਰ ਜੈਨੇਟਿਕਸ 2022 54:6, 54(6), ਪੰਨੇ 885–896। doi: 10.1038/s41588-022-01084-1।
