د جینوم ارتقاء
طبیعت
ارتباطات
د جینوم سلسله د نړیوال توزیع لارې په ګوته کوي او د سمندر په تکامل کې متقابل جینیتیک موافقت وړاندیز کوي
PacBio |Illumina |Hi-C |WGS |جنتيکي تنوع |د ډیموګرافیک تاریخ |د جین جریان
د Pacbio ترتیب کول، د جینوم ډی نوو مجلس او د تشریح خدمتونه د بایومارکر ټیکنالوژیو لخوا چمتو شوي.
لوړوالی
1. د 15.5 Mb د کانټیګ N50 سره د لوړ کیفیت کروموزوم سطح سمندري هارس (Hippocampus erectus) جینوم ترلاسه شوی.
2. په ټوله نړۍ کې د 21 سمندري هارس ډولونو څخه 358 جینومونه بیاکتل شوي.
3. د اولیګوسین په وروستیو کې د سمندري غرونو پراختیا او وروسته د نړیوال استعمار لارې پیژندل شوي او د سمندري جریانونو او د پیلوټیمپورل سمندري لارو خلاصیدو کې د متحرکاتو بدلولو سره تړاو لري.
4. د تکراري "هډوکي نخاع" د تطبیقي فینوټایپ جنیټیک اساس په کلیدي پرمختیایي جین کې د خپلواکو بدیلونو سره تړاو لري.
5. د سمندر د سیندونو له لارې رافټینګ د خرابو خپریدو لپاره تاوان ورکوي او چټک تطبیق د نوي استوګنځایونو استعمار ته اسانتیا برابروي.
لاسته راوړنې
شکل 1 د 358 سمندري هارس نمونو جینیاتي تنوع او فیلوجینیک اړیکې
aد نمونې شوي سمندري آسونو لپاره د جغرافیایي نمونې ځایونه چې په 22 کروموزومونو کې د 21 سمندري هارس ډولونو د نیوکلیوټایډ تنوع (π) نمونو سره.b ګاونډی سره تړلې ونې د 358 سمندري آسونو جینوم پراخه SNPs سره جوړ شوي.په (a) کې د ځای پن سمبولونه او په (b) کې د شاخ پس منظر یو له بل سره مطابقت لري.
انځور 2 د سمندري آسونو استعمار او ډیموګرافیک تاریخ
aد 21 سمندري هارس ډولونو لپاره د فایلوجینیک ونې او د توپیر وخت اټکل.د څانګو د کرښې ضخامت د نفوس د اندازې (Ne) سره مطابقت لري او رنګونه مختلف نسبونه په ګوته کوي.I–III سمبولونه د کیلیبریشن ټکي په ګوته کوي.b-d د انحراف وخت، توزیع، ویکیریانس پیښو، او د سمندر سیندونو (سپین تیرونو) پر بنسټ د سمندري آسونو د استثمار کولو لارې (رنګ تیرونه) اټکل شوي.b د هند-آسترالیا ټاپو وزمه د 18-23 Ma 18 څخه دمخه د سمندري آسونو متنوع او توزیع کیدو دمخه د هیپوکامپس نسل د اصلي (سرخ نښه کولو) مرکز و.c سمندري غرونو په پیل کې اتلانتیک بحر د تیتیان سمندرګي د پرانیستې له لارې استخدام کړ، کوم چې د هغې له تړلو وروسته (د 7-13 می په موده کې ترمینل پیښه)، دا تیتیان نسب د هند بحر له خور نسب څخه جلا کړ.وروستنۍ، په عربي بحر کې په چټکۍ سره متنوع (ژېړ نښه کول)، د سمندري هارس تنوع دویم مرکز رامینځته کړ.د اتلانتیک بحر د سمندري آسونو د استعمار دوهمه پیښه د هند بحر څخه د 5 می په شاوخوا کې د سویلي افریقا د پای څخه تیریدلو او په پای کې شاوخوا 3.6 Ma د پانامې سمندري لارې له لارې ختیځ ارام سمندر ته ورسیده.
انځور 3 د نفوس په اغیزمنه اندازه کې د جین جریان او تغیرات
aد جین جریان د سویلي اتلانتیک بحر کې میشته ډولونو ترمنځ کشف شوی.د جین جریان د سپینو لیکو سره نږدې د مهاجرت نرخ په توګه ښودل شوی چې د G-PhoCS لخوا کم شوی.د تیرونو ضخامت او سمت په ترتیب سره د جین جریان نرخونو او سمت سره مطابقت لري.د PSMC لخوا د اغیزمن نفوس اندازې کې بدلونونه.د x محور د موجوده وخت څخه وړاندې کلونو کې وخت استازیتوب کوي پداسې حال کې چې y محور د اغیزمن نفوس اندازه څرګندوي.چارټونه په عمده توګه د هر ډول جغرافیایي ویش سره سم تنظیم شوي چې د مختلف ویشلو سیمو سره.c په تیرو 1 ملیون کلونو کې د بحر کچه په 33 مترو کې بدلون.ژېړ کرښه د نړۍ وروستنی بین البرقی چوټی په ګوته کوي پداسې حال کې چې سیان سایه د ګلیشیل وروستۍ اعظمي موده په ګوته کوي.
شکل 4. د نخاعې تکامل.
aکیڼ، د نوعې ونې په سمندري اسونو کې د نخاعې خپلواکه تکامل څرګندوي.د څانګې اوږدوالی په هر سایټ کې د بدیلونو شمیر په ګوته کوي.د سمندري آسونو څلور ډولونه په نیلي رنګ کې روښانه شوي.غټې څانګې د bmp3 جین لپاره د غیر مترادف څخه تر مترادف بدیلونو (dN/dS) لوړ نرخونو سره مطابقت لري.د bmp3 جین لپاره کینونیکي او عمومي شوي مکډونالډ او کریټمن ټیسټ (MKT) د دریو جوړه خویندو ډولونو لپاره ترسره شو چې د متنوع سپینې او غیر سپینې ځانګړتیاو سره د شالید رنګونو لخوا روښانه شوي ، چې د اهمیت کچه یې په ترتیب سره د نیلي او سور فونټ سره د p ارزښت لخوا ښودل شوې.په سمه توګه، په bmp3 پروټینونو کې د امینو اسید بدیلونو پرتله کول، په سپیني سمندري هارونو کې پولیمورفیک او ثابت بدیلونه په ترتیب سره د سور او نیلي حلقو سره ښودل شوي.b د dN/dS ارزښتونو توزیع په bmp3 کې په سپينې سمندري اسونو کې د غیر سپین ډول ډولونو په پرتله.c په phylogenetic ونې کې خپلواک تکامل د bmp3 لخوا کوډ شوي پروټین لپاره بیا جوړ شوی.d په Hippocampus erectus کې د bmp3 د سیټو هایبرډیزیشن کې بشپړ ماونټ.
حواله
Li C et al.د جینوم سلسله د نړیوال توزیع لارې په ګوته کوي او د سمندر په تکامل کې د متقابل جینیتیک موافقت وړاندیز کوي.نیټ کمون.2021 فبروري 17؛12(1):1094.
خبرونه او مهم ټکي موخه یې د بایومارکر ټیکنالوژیو سره وروستي بریالي قضیې شریکول دي، د نوي ساینسي لاسته راوړنو نیول او همدارنګه د مطالعې په جریان کې پلي شوي مشهور تخنیکونه.
د پوسټ وخت: جنوري-06-2022